MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	AGC	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597104
2	NC_009377	GGT	2	6	961	966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597104
3	NC_009377	TCG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597104
4	NC_009377	AAC	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597105
5	NC_009377	ACC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597107
6	NC_009377	CGC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
7	NC_009377	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
8	NC_009377	TAC	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597107
9	NC_009377	GCA	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597107
10	NC_009377	AAC	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597107
11	NC_009377	ACT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
12	NC_009377	TTA	2	6	3823	3828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597108
13	NC_009377	CAT	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
14	NC_009377	ACC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597108
15	NC_009377	GGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
16	NC_009377	AGC	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
17	NC_009377	AGG	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
18	NC_009377	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
19	NC_009377	GTA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
20	NC_009377	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
21	NC_009377	AAC	2	6	6096	6101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597109
22	NC_009377	TCA	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
23	NC_009377	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
24	NC_009377	AAG	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597109
25	NC_009377	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
26	NC_009377	TGG	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597109
27	NC_009377	ATC	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
28	NC_009377	GCA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
29	NC_009377	CAG	4	12	7037	7048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
30	NC_009377	GAT	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
31	NC_009377	GGC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597109
32	NC_009377	AGG	2	6	7224	7229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
33	NC_009377	TGA	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
34	NC_009377	ACT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
35	NC_009377	GAC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
36	NC_009377	ATT	2	6	7940	7945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597110
37	NC_009377	TGG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597110
38	NC_009377	ATA	2	6	8384	8389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597110
39	NC_009377	TGT	2	6	8532	8537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597110
40	NC_009377	TTA	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597111
41	NC_009377	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597111
42	NC_009377	GTA	2	6	8993	8998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597111
43	NC_009377	TAG	2	6	9035	9040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597111
44	NC_009377	TGA	2	6	9269	9274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597112
45	NC_009377	GAA	2	6	9311	9316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597112
46	NC_009377	GCC	2	6	9342	9347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597112
47	NC_009377	CAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597112
48	NC_009377	GCC	2	6	9789	9794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597112
49	NC_009377	GTT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597112
50	NC_009377	CTG	2	6	9933	9938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597113
51	NC_009377	GCT	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597113
52	NC_009377	GCA	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
53	NC_009377	TGC	2	6	10439	10444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597114
54	NC_009377	AAG	2	6	10555	10560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
55	NC_009377	AAT	2	6	10602	10607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597114
56	NC_009377	AAG	2	6	10616	10621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
57	NC_009377	ATC	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597114
58	NC_009377	CAG	2	6	10937	10942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
59	NC_009377	CAC	2	6	10949	10954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597114
60	NC_009377	GCG	2	6	11008	11013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597114
61	NC_009377	ATT	2	6	11245	11250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
62	NC_009377	CAG	2	6	11470	11475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
63	NC_009377	AGA	2	6	11633	11638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
64	NC_009377	TAT	2	6	11672	11677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
65	NC_009377	ATT	2	6	11738	11743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
66	NC_009377	ATA	2	6	12008	12013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597115
67	NC_009377	GTC	2	6	12106	12111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597115
68	NC_009377	ACC	2	6	12270	12275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597116
69	NC_009377	TTC	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597116
70	NC_009377	TCT	2	6	12377	12382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597116
71	NC_009377	ACG	2	6	12407	12412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597116
72	NC_009377	GTG	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597117
73	NC_009377	TGC	2	6	12591	12596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597117
74	NC_009377	GAA	2	6	12687	12692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597117
75	NC_009377	CTT	2	6	12701	12706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597117
76	NC_009377	TCA	2	6	12733	12738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597117
77	NC_009377	ATG	2	6	12739	12744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597117
78	NC_009377	CGT	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597117
79	NC_009377	CTG	3	9	12830	12838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597117
80	NC_009377	CCG	2	6	13037	13042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597117
81	NC_009377	TGA	2	6	13081	13086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597117
82	NC_009377	TTC	2	6	13098	13103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597117
83	NC_009377	TGT	2	6	13156	13161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597117
84	NC_009377	CAT	2	6	13242	13247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597117
85	NC_009377	CTC	2	6	13255	13260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597118
86	NC_009377	GAT	2	6	13288	13293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597118
87	NC_009377	TCA	2	6	13326	13331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597118
88	NC_009377	CTG	2	6	13379	13384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597118
89	NC_009377	ACA	2	6	13720	13725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597118
90	NC_009377	CAC	2	6	13738	13743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597118
91	NC_009377	AAG	2	6	13746	13751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597118
92	NC_009377	GTC	2	6	13903	13908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597118
93	NC_009377	CAG	2	6	14113	14118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597118
94	NC_009377	GGC	2	6	14136	14141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597118
95	NC_009377	TGC	2	6	14423	14428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597119
96	NC_009377	AAT	2	6	14582	14587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597120
97	NC_009377	CAG	2	6	14636	14641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597120
98	NC_009377	CAA	2	6	14847	14852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597120
99	NC_009377	AAT	2	6	14880	14885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597120
100	NC_009377	GCA	2	6	14886	14891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597120
101	NC_009377	TCA	2	6	14949	14954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597120
102	NC_009377	TCG	2	6	15060	15065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597121
103	NC_009377	CCA	2	6	15115	15120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597121
104	NC_009377	GTA	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597121
105	NC_009377	CCG	2	6	15157	15162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597121
106	NC_009377	CTT	2	6	15203	15208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597121
107	NC_009377	TTC	2	6	15247	15252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597121
108	NC_009377	GCC	2	6	15812	15817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597122
109	NC_009377	GGC	2	6	15832	15837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597122
110	NC_009377	AAT	2	6	15845	15850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597122
111	NC_009377	GTT	2	6	15870	15875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597122
112	NC_009377	TAA	2	6	15946	15951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597122
113	NC_009377	GAC	2	6	15966	15971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597122
114	NC_009377	CGG	2	6	16023	16028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597122
115	NC_009377	TGA	2	6	16037	16042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597122
116	NC_009377	GAC	2	6	16074	16079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597122
117	NC_009377	TTG	2	6	16111	16116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597122
118	NC_009377	TTA	2	6	16119	16124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597122
119	NC_009377	AAT	2	6	16455	16460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597123
120	NC_009377	TGT	2	6	16726	16731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597123
121	NC_009377	TTG	2	6	16836	16841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597123
122	NC_009377	GTT	2	6	16912	16917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597123
123	NC_009377	TAT	2	6	16983	16988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597123
124	NC_009377	TGC	2	6	17153	17158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597124
125	NC_009377	AGC	2	6	17250	17255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597124
126	NC_009377	AAT	2	6	17267	17272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597124
127	NC_009377	AAT	2	6	17304	17309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597124
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