MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	145597105
2	NC_009377	CA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	0 %	50 %	145597107
3	NC_009377	CG	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
4	NC_009377	GC	3	6	2406	2411	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
5	NC_009377	TC	3	6	5375	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	145597109
6	NC_009377	AC	3	6	5451	5456	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
7	NC_009377	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
8	NC_009377	AC	3	6	6860	6865	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
9	NC_009377	GC	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	145597109
10	NC_009377	AG	3	6	7332	7337	50 %	0 %	50 %	0 %	145597109
11	NC_009377	AT	3	6	7910	7915	50 %	50 %	0 %	0 %	145597110
12	NC_009377	GA	4	8	8353	8360	50 %	0 %	50 %	0 %	145597110
13	NC_009377	AG	3	6	10400	10405	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
14	NC_009377	AG	3	6	10491	10496	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
15	NC_009377	CA	3	6	10846	10851	50 %	0 %	0 %	50 %	145597114
16	NC_009377	GC	4	8	10923	10930	0 %	0 %	50 %	50 %	145597114
17	NC_009377	GA	3	6	13615	13620	50 %	0 %	50 %	0 %	145597118
18	NC_009377	CG	3	6	13729	13734	0 %	0 %	50 %	50 %	145597118
19	NC_009377	GA	4	8	13956	13963	50 %	0 %	50 %	0 %	145597118
20	NC_009377	AG	3	6	15037	15042	50 %	0 %	50 %	0 %	145597121
21	NC_009377	GC	3	6	16939	16944	0 %	0 %	50 %	50 %	145597123
22	NC_009377	CT	3	6	17196	17201	0 %	50 %	0 %	50 %	145597124
23	NC_009377	GT	3	6	18500	18505	0 %	50 %	50 %	0 %	145597126
24	NC_009377	TC	3	6	19871	19876	0 %	50 %	0 %	50 %	145597130
25	NC_009377	CG	3	6	21027	21032	0 %	0 %	50 %	50 %	145597131
26	NC_009377	AC	3	6	21291	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	145597132
27	NC_009377	GA	3	6	24257	24262	50 %	0 %	50 %	0 %	145597134
28	NC_009377	AT	3	6	24641	24646	50 %	50 %	0 %	0 %	145597134
29	NC_009377	AT	3	6	26250	26255	50 %	50 %	0 %	0 %	145597135
30	NC_009377	GC	3	6	26828	26833	0 %	0 %	50 %	50 %	145597135
31	NC_009377	AG	3	6	27235	27240	50 %	0 %	50 %	0 %	145597136
32	NC_009377	TG	3	6	28746	28751	0 %	50 %	50 %	0 %	145597139
33	NC_009377	CG	3	6	29843	29848	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
34	NC_009377	CG	3	6	29929	29934	0 %	0 %	50 %	50 %	145597140
35	NC_009377	CT	3	6	30489	30494	0 %	50 %	0 %	50 %	145597140
36	NC_009377	AG	3	6	31718	31723	50 %	0 %	50 %	0 %	145597142
37	NC_009377	GC	3	6	34786	34791	0 %	0 %	50 %	50 %	145597147
38	NC_009377	TC	3	6	35473	35478	0 %	50 %	0 %	50 %	145597148
39	NC_009377	CG	3	6	35562	35567	0 %	0 %	50 %	50 %	145597148
40	NC_009377	AT	3	6	35665	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
41	NC_009377	AT	3	6	36308	36313	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
42	NC_009377	TC	3	6	36508	36513	0 %	50 %	0 %	50 %	145597148
43	NC_009377	AT	3	6	36788	36793	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
44	NC_009377	TC	3	6	37445	37450	0 %	50 %	0 %	50 %	145597149
45	NC_009377	TG	3	6	37727	37732	0 %	50 %	50 %	0 %	145597150
46	NC_009377	CT	3	6	39077	39082	0 %	50 %	0 %	50 %	145597152
47	NC_009377	AG	3	6	41177	41182	50 %	0 %	50 %	0 %	145597154
48	NC_009377	CA	3	6	42366	42371	50 %	0 %	0 %	50 %	145597155
49	NC_009377	AG	3	6	44854	44859	50 %	0 %	50 %	0 %	145597159
50	NC_009377	GA	3	6	45682	45687	50 %	0 %	50 %	0 %	145597159
51	NC_009377	GA	3	6	48777	48782	50 %	0 %	50 %	0 %	145597164
52	NC_009377	CT	3	6	49220	49225	0 %	50 %	0 %	50 %	145597164
53	NC_009377	CA	3	6	51673	51678	50 %	0 %	0 %	50 %	145597166
54	NC_009377	GT	3	6	52569	52574	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
55	NC_009377	AT	3	6	52582	52587	50 %	50 %	0 %	0 %	145597168
56	NC_009377	GT	3	6	52697	52702	0 %	50 %	50 %	0 %	145597168
57	NC_009377	TC	4	8	55552	55559	0 %	50 %	0 %	50 %	145597172
58	NC_009377	GA	3	6	55781	55786	50 %	0 %	50 %	0 %	145597172
59	NC_009377	AT	3	6	57200	57205	50 %	50 %	0 %	0 %	145597174
60	NC_009377	TA	3	6	57556	57561	50 %	50 %	0 %	0 %	145597175
61	NC_009377	TA	3	6	57563	57568	50 %	50 %	0 %	0 %	145597175
62	NC_009377	AT	3	6	58859	58864	50 %	50 %	0 %	0 %	145597177
63	NC_009377	TA	3	6	58952	58957	50 %	50 %	0 %	0 %	145597177
64	NC_009377	GC	3	6	59387	59392	0 %	0 %	50 %	50 %	145597178
65	NC_009377	AG	3	6	59856	59861	50 %	0 %	50 %	0 %	145597179
66	NC_009377	AC	3	6	60329	60334	50 %	0 %	0 %	50 %	145597179
67	NC_009377	TC	3	6	62989	62994	0 %	50 %	0 %	50 %	145597182
68	NC_009377	TC	3	6	64677	64682	0 %	50 %	0 %	50 %	145597184
69	NC_009377	CG	3	6	65046	65051	0 %	0 %	50 %	50 %	145597184
70	NC_009377	GA	3	6	67213	67218	50 %	0 %	50 %	0 %	145597185
71	NC_009377	CA	3	6	67691	67696	50 %	0 %	0 %	50 %	145597186
72	NC_009377	GA	3	6	69175	69180	50 %	0 %	50 %	0 %	145597187
73	NC_009377	TC	3	6	70000	70005	0 %	50 %	0 %	50 %	145597188
74	NC_009377	CG	3	6	70554	70559	0 %	0 %	50 %	50 %	145597190

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.