MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	G	6	6	948	953	0 %	0 %	100 %	0 %	145597104
2	NC_009377	A	6	6	1273	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	145597105
3	NC_009377	A	7	7	1815	1821	100 %	0 %	0 %	0 %	145597107
4	NC_009377	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009377	A	7	7	3081	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009377	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	145597108
7	NC_009377	T	7	7	4972	4978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009377	G	8	8	6601	6608	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
9	NC_009377	G	6	6	6661	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
10	NC_009377	A	6	6	7501	7506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009377	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
12	NC_009377	A	7	7	8337	8343	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
13	NC_009377	A	6	6	8482	8487	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
14	NC_009377	A	8	8	8542	8549	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
15	NC_009377	A	6	6	8904	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009377	A	6	6	9166	9171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009377	T	6	6	10150	10155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009377	A	6	6	10156	10161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009377	A	6	6	10201	10206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009377	A	6	6	10292	10297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009377	T	6	6	10300	10305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009377	A	6	6	11368	11373	100 %	0 %	0 %	0 %	145597114
23	NC_009377	T	6	6	12058	12063	0 %	100 %	0 %	0 %	145597115
24	NC_009377	G	6	6	12752	12757	0 %	0 %	100 %	0 %	145597117
25	NC_009377	T	6	6	13349	13354	0 %	100 %	0 %	0 %	145597118
26	NC_009377	T	7	7	14994	15000	0 %	100 %	0 %	0 %	145597121
27	NC_009377	G	6	6	15316	15321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009377	C	6	6	15470	15475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_009377	C	6	6	16087	16092	0 %	0 %	0 %	100 %	145597122
30	NC_009377	T	7	7	16229	16235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009377	A	6	6	16264	16269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009377	C	7	7	18358	18364	0 %	0 %	0 %	100 %	145597126
33	NC_009377	T	6	6	19921	19926	0 %	100 %	0 %	0 %	145597130
34	NC_009377	C	6	6	20217	20222	0 %	0 %	0 %	100 %	145597131
35	NC_009377	T	6	6	20483	20488	0 %	100 %	0 %	0 %	145597131
36	NC_009377	T	6	6	20730	20735	0 %	100 %	0 %	0 %	145597131
37	NC_009377	A	6	6	20854	20859	100 %	0 %	0 %	0 %	145597131
38	NC_009377	A	6	6	21001	21006	100 %	0 %	0 %	0 %	145597131
39	NC_009377	T	6	6	22552	22557	0 %	100 %	0 %	0 %	145597132
40	NC_009377	A	6	6	23061	23066	100 %	0 %	0 %	0 %	145597132
41	NC_009377	T	6	6	23486	23491	0 %	100 %	0 %	0 %	145597133
42	NC_009377	A	7	7	23617	23623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009377	A	8	8	23889	23896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009377	A	6	6	24473	24478	100 %	0 %	0 %	0 %	145597134
45	NC_009377	A	6	6	24485	24490	100 %	0 %	0 %	0 %	145597134
46	NC_009377	G	7	7	25184	25190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009377	A	7	7	25442	25448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009377	A	7	7	25526	25532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009377	T	7	7	26518	26524	0 %	100 %	0 %	0 %	145597135
50	NC_009377	A	7	7	26629	26635	100 %	0 %	0 %	0 %	145597135
51	NC_009377	A	7	7	28231	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	145597138
52	NC_009377	G	7	7	28432	28438	0 %	0 %	100 %	0 %	145597138
53	NC_009377	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	145597140
54	NC_009377	T	6	6	30689	30694	0 %	100 %	0 %	0 %	145597140
55	NC_009377	T	6	6	31151	31156	0 %	100 %	0 %	0 %	145597141
56	NC_009377	C	9	9	32127	32135	0 %	0 %	0 %	100 %	145597142
57	NC_009377	C	6	6	32295	32300	0 %	0 %	0 %	100 %	145597142
58	NC_009377	A	6	6	32700	32705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009377	T	7	7	33686	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	145597143
60	NC_009377	C	6	6	34360	34365	0 %	0 %	0 %	100 %	145597146
61	NC_009377	C	8	8	35141	35148	0 %	0 %	0 %	100 %	145597148
62	NC_009377	A	6	6	36883	36888	100 %	0 %	0 %	0 %	145597148
63	NC_009377	A	7	7	38609	38615	100 %	0 %	0 %	0 %	145597151
64	NC_009377	A	6	6	38775	38780	100 %	0 %	0 %	0 %	145597151
65	NC_009377	C	6	6	39459	39464	0 %	0 %	0 %	100 %	145597153
66	NC_009377	A	7	7	40700	40706	100 %	0 %	0 %	0 %	145597154
67	NC_009377	A	6	6	41866	41871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009377	G	7	7	41920	41926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009377	A	7	7	43185	43191	100 %	0 %	0 %	0 %	145597155
70	NC_009377	T	6	6	43447	43452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009377	T	6	6	44004	44009	0 %	100 %	0 %	0 %	145597157
72	NC_009377	T	6	6	44608	44613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009377	A	6	6	45071	45076	100 %	0 %	0 %	0 %	145597159
74	NC_009377	A	6	6	45197	45202	100 %	0 %	0 %	0 %	145597159
75	NC_009377	T	6	6	45438	45443	0 %	100 %	0 %	0 %	145597159
76	NC_009377	T	6	6	46121	46126	0 %	100 %	0 %	0 %	145597160
77	NC_009377	A	6	6	46316	46321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009377	C	7	7	46519	46525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_009377	A	6	6	46927	46932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009377	T	6	6	46935	46940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009377	T	6	6	47002	47007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009377	T	7	7	47009	47015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009377	T	6	6	47170	47175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009377	G	8	8	47465	47472	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009377	T	6	6	47670	47675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009377	T	6	6	47781	47786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009377	T	7	7	48787	48793	0 %	100 %	0 %	0 %	145597164
88	NC_009377	T	6	6	49698	49703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009377	A	6	6	50390	50395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009377	A	7	7	50461	50467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009377	A	6	6	50644	50649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009377	A	7	7	51157	51163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009377	A	6	6	51244	51249	100 %	0 %	0 %	0 %	145597166
94	NC_009377	C	6	6	51279	51284	0 %	0 %	0 %	100 %	145597166
95	NC_009377	C	7	7	52980	52986	0 %	0 %	0 %	100 %	145597169
96	NC_009377	T	6	6	53476	53481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009377	T	6	6	53768	53773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009377	A	7	7	55808	55814	100 %	0 %	0 %	0 %	145597172
99	NC_009377	T	7	7	56283	56289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009377	T	9	9	56635	56643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009377	A	6	6	56672	56677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009377	T	7	7	56678	56684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009377	T	6	6	57326	57331	0 %	100 %	0 %	0 %	145597174
104	NC_009377	A	6	6	57699	57704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009377	A	6	6	58517	58522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009377	G	6	6	58894	58899	0 %	0 %	100 %	0 %	145597177
107	NC_009377	A	6	6	61103	61108	100 %	0 %	0 %	0 %	145597180
108	NC_009377	T	9	9	61566	61574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009377	A	7	7	61753	61759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009377	T	6	6	63207	63212	0 %	100 %	0 %	0 %	145597183
111	NC_009377	A	6	6	63881	63886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009377	T	7	7	64567	64573	0 %	100 %	0 %	0 %	145597184
113	NC_009377	A	6	6	65117	65122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009377	A	6	6	65823	65828	100 %	0 %	0 %	0 %	145597185
115	NC_009377	C	6	6	66886	66891	0 %	0 %	0 %	100 %	145597185
116	NC_009377	T	7	7	67948	67954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009377	T	7	7	68069	68075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009377	T	6	6	68079	68084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009377	A	7	7	68106	68112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009377	T	7	7	68165	68171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009377	T	9	9	68240	68248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009377	T	6	6	68385	68390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009377	A	8	8	68762	68769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009377	A	6	6	69354	69359	100 %	0 %	0 %	0 %	145597187
125	NC_009377	A	6	6	69414	69419	100 %	0 %	0 %	0 %	145597187
126	NC_009377	T	6	6	69917	69922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.