MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	G	6	6	948	953	0 %	0 %	100 %	0 %	145597104
2	NC_009377	A	6	6	1273	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	145597105
3	NC_009377	A	7	7	1815	1821	100 %	0 %	0 %	0 %	145597107
4	NC_009377	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	145597108
5	NC_009377	G	8	8	6601	6608	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
6	NC_009377	G	6	6	6661	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
7	NC_009377	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
8	NC_009377	A	7	7	8337	8343	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
9	NC_009377	A	6	6	8482	8487	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
10	NC_009377	A	8	8	8542	8549	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
11	NC_009377	A	6	6	11368	11373	100 %	0 %	0 %	0 %	145597114
12	NC_009377	T	6	6	12058	12063	0 %	100 %	0 %	0 %	145597115
13	NC_009377	G	6	6	12752	12757	0 %	0 %	100 %	0 %	145597117
14	NC_009377	T	6	6	13349	13354	0 %	100 %	0 %	0 %	145597118
15	NC_009377	T	7	7	14994	15000	0 %	100 %	0 %	0 %	145597121
16	NC_009377	C	6	6	16087	16092	0 %	0 %	0 %	100 %	145597122
17	NC_009377	C	7	7	18358	18364	0 %	0 %	0 %	100 %	145597126
18	NC_009377	T	6	6	19921	19926	0 %	100 %	0 %	0 %	145597130
19	NC_009377	C	6	6	20217	20222	0 %	0 %	0 %	100 %	145597131
20	NC_009377	T	6	6	20483	20488	0 %	100 %	0 %	0 %	145597131
21	NC_009377	T	6	6	20730	20735	0 %	100 %	0 %	0 %	145597131
22	NC_009377	A	6	6	20854	20859	100 %	0 %	0 %	0 %	145597131
23	NC_009377	A	6	6	21001	21006	100 %	0 %	0 %	0 %	145597131
24	NC_009377	T	6	6	22552	22557	0 %	100 %	0 %	0 %	145597132
25	NC_009377	A	6	6	23061	23066	100 %	0 %	0 %	0 %	145597132
26	NC_009377	T	6	6	23486	23491	0 %	100 %	0 %	0 %	145597133
27	NC_009377	A	6	6	24473	24478	100 %	0 %	0 %	0 %	145597134
28	NC_009377	A	6	6	24485	24490	100 %	0 %	0 %	0 %	145597134
29	NC_009377	T	7	7	26518	26524	0 %	100 %	0 %	0 %	145597135
30	NC_009377	A	7	7	26629	26635	100 %	0 %	0 %	0 %	145597135
31	NC_009377	A	7	7	28231	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	145597138
32	NC_009377	G	7	7	28432	28438	0 %	0 %	100 %	0 %	145597138
33	NC_009377	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	145597140
34	NC_009377	T	6	6	30689	30694	0 %	100 %	0 %	0 %	145597140
35	NC_009377	T	6	6	31151	31156	0 %	100 %	0 %	0 %	145597141
36	NC_009377	C	9	9	32127	32135	0 %	0 %	0 %	100 %	145597142
37	NC_009377	C	6	6	32295	32300	0 %	0 %	0 %	100 %	145597142
38	NC_009377	T	7	7	33686	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	145597143
39	NC_009377	C	6	6	34360	34365	0 %	0 %	0 %	100 %	145597146
40	NC_009377	C	8	8	35141	35148	0 %	0 %	0 %	100 %	145597148
41	NC_009377	A	6	6	36883	36888	100 %	0 %	0 %	0 %	145597148
42	NC_009377	A	7	7	38609	38615	100 %	0 %	0 %	0 %	145597151
43	NC_009377	A	6	6	38775	38780	100 %	0 %	0 %	0 %	145597151
44	NC_009377	C	6	6	39459	39464	0 %	0 %	0 %	100 %	145597153
45	NC_009377	A	7	7	40700	40706	100 %	0 %	0 %	0 %	145597154
46	NC_009377	A	7	7	43185	43191	100 %	0 %	0 %	0 %	145597155
47	NC_009377	T	6	6	44004	44009	0 %	100 %	0 %	0 %	145597157
48	NC_009377	A	6	6	45071	45076	100 %	0 %	0 %	0 %	145597159
49	NC_009377	A	6	6	45197	45202	100 %	0 %	0 %	0 %	145597159
50	NC_009377	T	6	6	45438	45443	0 %	100 %	0 %	0 %	145597159
51	NC_009377	T	6	6	46121	46126	0 %	100 %	0 %	0 %	145597160
52	NC_009377	T	7	7	48787	48793	0 %	100 %	0 %	0 %	145597164
53	NC_009377	A	6	6	51244	51249	100 %	0 %	0 %	0 %	145597166
54	NC_009377	C	6	6	51279	51284	0 %	0 %	0 %	100 %	145597166
55	NC_009377	C	7	7	52980	52986	0 %	0 %	0 %	100 %	145597169
56	NC_009377	A	7	7	55808	55814	100 %	0 %	0 %	0 %	145597172
57	NC_009377	T	6	6	57326	57331	0 %	100 %	0 %	0 %	145597174
58	NC_009377	G	6	6	58894	58899	0 %	0 %	100 %	0 %	145597177
59	NC_009377	A	6	6	61103	61108	100 %	0 %	0 %	0 %	145597180
60	NC_009377	T	6	6	63207	63212	0 %	100 %	0 %	0 %	145597183
61	NC_009377	T	7	7	64567	64573	0 %	100 %	0 %	0 %	145597184
62	NC_009377	A	6	6	65823	65828	100 %	0 %	0 %	0 %	145597185
63	NC_009377	C	6	6	66886	66891	0 %	0 %	0 %	100 %	145597185
64	NC_009377	A	6	6	69354	69359	100 %	0 %	0 %	0 %	145597187
65	NC_009377	A	6	6	69414	69419	100 %	0 %	0 %	0 %	145597187

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.