MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	GCGGTC	2	12	22667	22678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301408
2	NC_009350	GCCAAA	2	12	26882	26893	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301414
3	NC_009350	GATGCT	2	12	31349	31360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301418
4	NC_009350	CTATAC	2	12	32517	32528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301419
5	NC_009350	TTTTCT	2	12	33989	34000	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	145301419
6	NC_009350	CAACGC	2	12	34141	34152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301419
7	NC_009350	GTCAAC	2	12	35039	35050	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301421
8	NC_009350	AAAAAC	2	12	35793	35804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	145301422
9	NC_009350	ACCATC	2	12	42859	42870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	145301425
10	NC_009350	GCTGGT	2	12	44957	44968	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301426
11	NC_009350	GCCAAA	2	12	47982	47993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301426
12	NC_009350	CTCCGG	2	12	55021	55032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301433
13	NC_009350	GCACCA	2	12	55187	55198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301433
14	NC_009350	CTGCAT	2	12	55854	55865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301434
15	NC_009350	TGGCCG	2	12	59198	59209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301440
16	NC_009350	CGGCCA	2	12	68103	68114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301451
17	NC_009350	TCCTTC	2	12	69151	69162	0 %	50 %	0 %	50 %	145301453
18	NC_009350	CGAGAT	2	12	69668	69679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301453
19	NC_009350	GGCCCC	2	12	69852	69863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301453
20	NC_009350	CAGAGC	2	12	70970	70981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301454
21	NC_009350	TCCCCC	2	12	71036	71047	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	145301454
22	NC_009350	GGTCGG	2	12	73564	73575	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301459
23	NC_009350	TCAGGC	2	12	74383	74394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301459
24	NC_009350	CAGGAA	2	12	75016	75027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145301460
25	NC_009350	CCACAG	2	12	86804	86815	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301472
26	NC_009350	TTGACC	2	12	87675	87686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145301473
27	NC_009350	GCCTTG	2	12	87915	87926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301473
28	NC_009350	GTAAAT	2	12	98265	98276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145301480
29	NC_009350	GCGGGG	2	12	111946	111957	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	145301497
30	NC_009350	TGGATC	2	12	115926	115937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301501
31	NC_009350	GCCATC	5	30	119505	119534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145301503
32	NC_009350	CGTTGG	2	12	119862	119873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301504
33	NC_009350	GCCAAA	2	12	126356	126367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301506
34	NC_009350	ACCATT	2	12	128045	128056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301509
35	NC_009350	AGCCTG	2	12	130267	130278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145301515
36	NC_009350	CAAGGC	2	12	140154	140165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301524
37	NC_009350	GGTCAA	2	12	140394	140405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301524
38	NC_009350	CGAACA	2	12	141077	141088	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301525
39	NC_009350	CTGTGG	2	12	141266	141277	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301525
40	NC_009350	AATTTT	2	12	147897	147908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301534
41	NC_009350	GGCTAT	2	12	153036	153047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145301538
42	NC_009350	TTGCTG	2	12	153106	153117	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	145301539
43	NC_009350	TGGCGC	2	12	153139	153150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301539

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.