MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	GATCA	2	10	529	538	40 %	20 %	20 %	20 %	145301387
2	NC_009350	GCTTT	2	10	665	674	0 %	60 %	20 %	20 %	145301387
3	NC_009350	AGCCA	2	10	2575	2584	40 %	0 %	20 %	40 %	145301388
4	NC_009350	AAACA	2	10	3114	3123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009350	TCAAA	2	10	4192	4201	60 %	20 %	0 %	20 %	145301390
6	NC_009350	TTCAG	2	10	4621	4630	20 %	40 %	20 %	20 %	145301391
7	NC_009350	CGCTG	2	10	7827	7836	0 %	20 %	40 %	40 %	145301394
8	NC_009350	CCGGC	2	10	8072	8081	0 %	0 %	40 %	60 %	145301394
9	NC_009350	TGCCG	2	10	8800	8809	0 %	20 %	40 %	40 %	145301394
10	NC_009350	TTGTT	2	10	10669	10678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009350	TTCAA	2	10	12267	12276	40 %	40 %	0 %	20 %	145301397
12	NC_009350	ATGCC	2	10	13261	13270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009350	ATTTT	2	10	13303	13312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009350	AATCA	2	10	13503	13512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009350	TTTTA	2	10	14008	14017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009350	CCGTA	2	10	14854	14863	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009350	GATCA	2	10	16478	16487	40 %	20 %	20 %	20 %	145301402
18	NC_009350	GCTTT	2	10	16614	16623	0 %	60 %	20 %	20 %	145301402
19	NC_009350	CGAGC	2	10	18529	18538	20 %	0 %	40 %	40 %	145301403
20	NC_009350	AAGCA	2	10	19279	19288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009350	CAGCC	2	10	25070	25079	20 %	0 %	20 %	60 %	145301412
22	NC_009350	CTGGG	2	10	25427	25436	0 %	20 %	60 %	20 %	145301412
23	NC_009350	AATGC	2	10	25916	25925	40 %	20 %	20 %	20 %	145301413
24	NC_009350	GGTGC	2	10	26462	26471	0 %	20 %	60 %	20 %	145301414
25	NC_009350	GGCAA	2	10	26748	26757	40 %	0 %	40 %	20 %	145301414
26	NC_009350	GCCGA	2	10	28893	28902	20 %	0 %	40 %	40 %	145301414
27	NC_009350	CCGCA	2	10	32145	32154	20 %	0 %	20 %	60 %	145301419
28	NC_009350	ACTTC	2	10	32295	32304	20 %	40 %	0 %	40 %	145301419
29	NC_009350	ATTTC	2	10	32341	32350	20 %	60 %	0 %	20 %	145301419
30	NC_009350	TGCCT	2	10	34551	34560	0 %	40 %	20 %	40 %	145301420
31	NC_009350	AGGCC	2	10	35294	35303	20 %	0 %	40 %	40 %	145301422
32	NC_009350	TGCGC	2	10	37360	37369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009350	CCAGT	2	10	38579	38588	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009350	CAAGG	2	10	38610	38619	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009350	CTGTG	2	10	39775	39784	0 %	40 %	40 %	20 %	145301423
36	NC_009350	ATTTT	2	10	40872	40881	20 %	80 %	0 %	0 %	145301425
37	NC_009350	TCCAG	2	10	42472	42481	20 %	20 %	20 %	40 %	145301425
38	NC_009350	CACCG	2	10	43158	43167	20 %	0 %	20 %	60 %	145301426
39	NC_009350	GCTCG	2	10	44332	44341	0 %	20 %	40 %	40 %	145301426
40	NC_009350	CAAGG	2	10	45729	45738	40 %	0 %	40 %	20 %	145301426
41	NC_009350	AGCGC	2	10	46234	46243	20 %	0 %	40 %	40 %	145301426
42	NC_009350	TTCAG	2	10	48557	48566	20 %	40 %	20 %	20 %	145301427
43	NC_009350	TTTTG	2	10	50877	50886	0 %	80 %	20 %	0 %	145301428
44	NC_009350	TGATC	2	10	52002	52011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009350	CAGCT	2	10	55896	55905	20 %	20 %	20 %	40 %	145301434
46	NC_009350	AGAGA	2	10	56849	56858	60 %	0 %	40 %	0 %	145301436
47	NC_009350	AAGTA	2	10	57239	57248	60 %	20 %	20 %	0 %	145301437
48	NC_009350	GCAAG	2	10	58123	58132	40 %	0 %	40 %	20 %	145301439
49	NC_009350	ACCAG	2	10	60273	60282	40 %	0 %	20 %	40 %	145301440
50	NC_009350	ATTTT	2	10	62744	62753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009350	GACGT	2	10	67262	67271	20 %	20 %	40 %	20 %	145301450
52	NC_009350	TCAGC	2	10	67497	67506	20 %	20 %	20 %	40 %	145301450
53	NC_009350	TGGGC	2	10	70040	70049	0 %	20 %	60 %	20 %	145301453
54	NC_009350	GGCAT	2	10	70432	70441	20 %	20 %	40 %	20 %	145301453
55	NC_009350	ATCAG	2	10	72200	72209	40 %	20 %	20 %	20 %	145301457
56	NC_009350	ATGAC	2	10	74229	74238	40 %	20 %	20 %	20 %	145301459
57	NC_009350	AGGCA	2	10	74528	74537	40 %	0 %	40 %	20 %	145301459
58	NC_009350	GAGCC	2	10	77740	77749	20 %	0 %	40 %	40 %	145301463
59	NC_009350	CTTCA	2	10	77961	77970	20 %	40 %	0 %	40 %	145301464
60	NC_009350	CATCA	2	10	83009	83018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009350	TTCAG	2	10	85409	85418	20 %	40 %	20 %	20 %	145301471
62	NC_009350	GCTCA	2	10	86707	86716	20 %	20 %	20 %	40 %	145301472
63	NC_009350	TTGTT	2	10	90197	90206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009350	CTTCG	2	10	92720	92729	0 %	40 %	20 %	40 %	145301477
65	NC_009350	CGGCA	2	10	93189	93198	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009350	TTTGA	2	10	98026	98035	20 %	60 %	20 %	0 %	145301480
67	NC_009350	ACTCC	2	10	100803	100812	20 %	20 %	0 %	60 %	145301481
68	NC_009350	AGCGC	2	10	101100	101109	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_009350	CGGGG	2	10	101158	101167	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009350	ATCCC	2	10	101271	101280	20 %	20 %	0 %	60 %	145301482
71	NC_009350	TGCAG	2	10	101772	101781	20 %	20 %	40 %	20 %	145301483
72	NC_009350	CGCAC	2	10	102748	102757	20 %	0 %	20 %	60 %	145301485
73	NC_009350	AAGAG	2	10	102996	103005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009350	AGCGC	2	10	103091	103100	20 %	0 %	40 %	40 %	145301486
75	NC_009350	CTGAT	2	10	104702	104711	20 %	40 %	20 %	20 %	145301488
76	NC_009350	CGATC	2	10	106867	106876	20 %	20 %	20 %	40 %	145301492
77	NC_009350	GTTCG	2	10	107080	107089	0 %	40 %	40 %	20 %	145301492
78	NC_009350	TCCCA	2	10	108181	108190	20 %	20 %	0 %	60 %	145301493
79	NC_009350	GCATG	2	10	109980	109989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009350	GTTGA	2	10	112185	112194	20 %	40 %	40 %	0 %	145301497
81	NC_009350	CTTGG	2	10	114752	114761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009350	ACCAA	2	10	116167	116176	60 %	0 %	0 %	40 %	145301501
83	NC_009350	CGCCC	2	10	117261	117270	0 %	0 %	20 %	80 %	145301502
84	NC_009350	TGCGA	2	10	117379	117388	20 %	20 %	40 %	20 %	145301502
85	NC_009350	GTCAG	2	10	117560	117569	20 %	20 %	40 %	20 %	145301502
86	NC_009350	CGTGG	2	10	120814	120823	0 %	20 %	60 %	20 %	145301505
87	NC_009350	GTTGC	2	10	121103	121112	0 %	40 %	40 %	20 %	145301505
88	NC_009350	CGGCG	2	10	121252	121261	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009350	CACCG	2	10	121529	121538	20 %	0 %	20 %	60 %	145301506
90	NC_009350	GCTCG	2	10	122706	122715	0 %	20 %	40 %	40 %	145301506
91	NC_009350	CAAGG	2	10	124103	124112	40 %	0 %	40 %	20 %	145301506
92	NC_009350	AGCGC	2	10	124608	124617	20 %	0 %	40 %	40 %	145301506
93	NC_009350	ACCAG	2	10	128253	128262	40 %	0 %	20 %	40 %	145301509
94	NC_009350	CCATT	2	10	129069	129078	20 %	40 %	0 %	40 %	145301511
95	NC_009350	TTGAT	2	10	129197	129206	20 %	60 %	20 %	0 %	145301512
96	NC_009350	GCGAA	2	10	129330	129339	40 %	0 %	40 %	20 %	145301512
97	NC_009350	TCCCC	2	10	130139	130148	0 %	20 %	0 %	80 %	145301515
98	NC_009350	CTTGC	2	10	131554	131563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009350	CGCGG	2	10	131875	131884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_009350	GGTGG	2	10	131981	131990	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009350	TTGAT	2	10	133346	133355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009350	TACCA	2	10	135494	135503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009350	CTGTG	2	10	135587	135596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009350	GTGAT	2	10	136289	136298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009350	GCCCG	2	10	137048	137057	0 %	0 %	40 %	60 %	145301519
106	NC_009350	TGAGC	2	10	141365	141374	20 %	20 %	40 %	20 %	145301525
107	NC_009350	GATTT	2	10	142776	142785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009350	AAAAT	2	10	147864	147873	80 %	20 %	0 %	0 %	145301534
109	NC_009350	CAGTG	2	10	148850	148859	20 %	20 %	40 %	20 %	145301535
110	NC_009350	TTGAA	2	10	149793	149802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009350	GTTAA	2	10	150215	150224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009350	TTGAG	2	10	153702	153711	20 %	40 %	40 %	0 %	145301539

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.