MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	AAACA	2	10	3114	3123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009350	TTGTT	2	10	10669	10678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009350	ATGCC	2	10	13261	13270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009350	ATTTT	2	10	13303	13312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009350	AATCA	2	10	13503	13512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009350	TTTTA	2	10	14008	14017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009350	CCGTA	2	10	14854	14863	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009350	AAGCA	2	10	19279	19288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009350	TGCGC	2	10	37360	37369	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009350	CCAGT	2	10	38579	38588	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009350	CAAGG	2	10	38610	38619	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009350	TGATC	2	10	52002	52011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009350	ATTTT	2	10	62744	62753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009350	CATCA	2	10	83009	83018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009350	TTGTT	2	10	90197	90206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009350	CGGCA	2	10	93189	93198	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009350	AGCGC	2	10	101100	101109	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009350	CGGGG	2	10	101158	101167	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009350	AAGAG	2	10	102996	103005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009350	GCATG	2	10	109980	109989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009350	CTTGG	2	10	114752	114761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009350	CGGCG	2	10	121252	121261	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009350	CTTGC	2	10	131554	131563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009350	CGCGG	2	10	131875	131884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009350	GGTGG	2	10	131981	131990	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009350	TTGAT	2	10	133346	133355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009350	TACCA	2	10	135494	135503	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009350	CTGTG	2	10	135587	135596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009350	GTGAT	2	10	136289	136298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009350	GATTT	2	10	142776	142785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009350	TTGAA	2	10	149793	149802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009350	GTTAA	2	10	150215	150224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.