MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	GATCA	2	10	529	538	40 %	20 %	20 %	20 %	145301387
2	NC_009350	GCTTT	2	10	665	674	0 %	60 %	20 %	20 %	145301387
3	NC_009350	AGCCA	2	10	2575	2584	40 %	0 %	20 %	40 %	145301388
4	NC_009350	TCAAA	2	10	4192	4201	60 %	20 %	0 %	20 %	145301390
5	NC_009350	TTCAG	2	10	4621	4630	20 %	40 %	20 %	20 %	145301391
6	NC_009350	CGCTG	2	10	7827	7836	0 %	20 %	40 %	40 %	145301394
7	NC_009350	CCGGC	2	10	8072	8081	0 %	0 %	40 %	60 %	145301394
8	NC_009350	TGCCG	2	10	8800	8809	0 %	20 %	40 %	40 %	145301394
9	NC_009350	TTCAA	2	10	12267	12276	40 %	40 %	0 %	20 %	145301397
10	NC_009350	GATCA	2	10	16478	16487	40 %	20 %	20 %	20 %	145301402
11	NC_009350	GCTTT	2	10	16614	16623	0 %	60 %	20 %	20 %	145301402
12	NC_009350	CGAGC	2	10	18529	18538	20 %	0 %	40 %	40 %	145301403
13	NC_009350	CAGCC	2	10	25070	25079	20 %	0 %	20 %	60 %	145301412
14	NC_009350	CTGGG	2	10	25427	25436	0 %	20 %	60 %	20 %	145301412
15	NC_009350	AATGC	2	10	25916	25925	40 %	20 %	20 %	20 %	145301413
16	NC_009350	GGTGC	2	10	26462	26471	0 %	20 %	60 %	20 %	145301414
17	NC_009350	GGCAA	2	10	26748	26757	40 %	0 %	40 %	20 %	145301414
18	NC_009350	GCCGA	2	10	28893	28902	20 %	0 %	40 %	40 %	145301414
19	NC_009350	CCGCA	2	10	32145	32154	20 %	0 %	20 %	60 %	145301419
20	NC_009350	ACTTC	2	10	32295	32304	20 %	40 %	0 %	40 %	145301419
21	NC_009350	ATTTC	2	10	32341	32350	20 %	60 %	0 %	20 %	145301419
22	NC_009350	TGCCT	2	10	34551	34560	0 %	40 %	20 %	40 %	145301420
23	NC_009350	AGGCC	2	10	35294	35303	20 %	0 %	40 %	40 %	145301422
24	NC_009350	CTGTG	2	10	39775	39784	0 %	40 %	40 %	20 %	145301423
25	NC_009350	ATTTT	2	10	40872	40881	20 %	80 %	0 %	0 %	145301425
26	NC_009350	TCCAG	2	10	42472	42481	20 %	20 %	20 %	40 %	145301425
27	NC_009350	CACCG	2	10	43158	43167	20 %	0 %	20 %	60 %	145301426
28	NC_009350	GCTCG	2	10	44332	44341	0 %	20 %	40 %	40 %	145301426
29	NC_009350	CAAGG	2	10	45729	45738	40 %	0 %	40 %	20 %	145301426
30	NC_009350	AGCGC	2	10	46234	46243	20 %	0 %	40 %	40 %	145301426
31	NC_009350	TTCAG	2	10	48557	48566	20 %	40 %	20 %	20 %	145301427
32	NC_009350	TTTTG	2	10	50877	50886	0 %	80 %	20 %	0 %	145301428
33	NC_009350	CAGCT	2	10	55896	55905	20 %	20 %	20 %	40 %	145301434
34	NC_009350	AGAGA	2	10	56849	56858	60 %	0 %	40 %	0 %	145301436
35	NC_009350	AAGTA	2	10	57239	57248	60 %	20 %	20 %	0 %	145301437
36	NC_009350	GCAAG	2	10	58123	58132	40 %	0 %	40 %	20 %	145301439
37	NC_009350	ACCAG	2	10	60273	60282	40 %	0 %	20 %	40 %	145301440
38	NC_009350	GACGT	2	10	67262	67271	20 %	20 %	40 %	20 %	145301450
39	NC_009350	TCAGC	2	10	67497	67506	20 %	20 %	20 %	40 %	145301450
40	NC_009350	TGGGC	2	10	70040	70049	0 %	20 %	60 %	20 %	145301453
41	NC_009350	GGCAT	2	10	70432	70441	20 %	20 %	40 %	20 %	145301453
42	NC_009350	ATCAG	2	10	72200	72209	40 %	20 %	20 %	20 %	145301457
43	NC_009350	ATGAC	2	10	74229	74238	40 %	20 %	20 %	20 %	145301459
44	NC_009350	AGGCA	2	10	74528	74537	40 %	0 %	40 %	20 %	145301459
45	NC_009350	GAGCC	2	10	77740	77749	20 %	0 %	40 %	40 %	145301463
46	NC_009350	CTTCA	2	10	77961	77970	20 %	40 %	0 %	40 %	145301464
47	NC_009350	TTCAG	2	10	85409	85418	20 %	40 %	20 %	20 %	145301471
48	NC_009350	GCTCA	2	10	86707	86716	20 %	20 %	20 %	40 %	145301472
49	NC_009350	CTTCG	2	10	92720	92729	0 %	40 %	20 %	40 %	145301477
50	NC_009350	TTTGA	2	10	98026	98035	20 %	60 %	20 %	0 %	145301480
51	NC_009350	ACTCC	2	10	100803	100812	20 %	20 %	0 %	60 %	145301481
52	NC_009350	ATCCC	2	10	101271	101280	20 %	20 %	0 %	60 %	145301482
53	NC_009350	TGCAG	2	10	101772	101781	20 %	20 %	40 %	20 %	145301483
54	NC_009350	CGCAC	2	10	102748	102757	20 %	0 %	20 %	60 %	145301485
55	NC_009350	AGCGC	2	10	103091	103100	20 %	0 %	40 %	40 %	145301486
56	NC_009350	CTGAT	2	10	104702	104711	20 %	40 %	20 %	20 %	145301488
57	NC_009350	CGATC	2	10	106867	106876	20 %	20 %	20 %	40 %	145301492
58	NC_009350	GTTCG	2	10	107080	107089	0 %	40 %	40 %	20 %	145301492
59	NC_009350	TCCCA	2	10	108181	108190	20 %	20 %	0 %	60 %	145301493
60	NC_009350	GTTGA	2	10	112185	112194	20 %	40 %	40 %	0 %	145301497
61	NC_009350	ACCAA	2	10	116167	116176	60 %	0 %	0 %	40 %	145301501
62	NC_009350	CGCCC	2	10	117261	117270	0 %	0 %	20 %	80 %	145301502
63	NC_009350	TGCGA	2	10	117379	117388	20 %	20 %	40 %	20 %	145301502
64	NC_009350	GTCAG	2	10	117560	117569	20 %	20 %	40 %	20 %	145301502
65	NC_009350	CGTGG	2	10	120814	120823	0 %	20 %	60 %	20 %	145301505
66	NC_009350	GTTGC	2	10	121103	121112	0 %	40 %	40 %	20 %	145301505
67	NC_009350	CACCG	2	10	121529	121538	20 %	0 %	20 %	60 %	145301506
68	NC_009350	GCTCG	2	10	122706	122715	0 %	20 %	40 %	40 %	145301506
69	NC_009350	CAAGG	2	10	124103	124112	40 %	0 %	40 %	20 %	145301506
70	NC_009350	AGCGC	2	10	124608	124617	20 %	0 %	40 %	40 %	145301506
71	NC_009350	ACCAG	2	10	128253	128262	40 %	0 %	20 %	40 %	145301509
72	NC_009350	CCATT	2	10	129069	129078	20 %	40 %	0 %	40 %	145301511
73	NC_009350	TTGAT	2	10	129197	129206	20 %	60 %	20 %	0 %	145301512
74	NC_009350	GCGAA	2	10	129330	129339	40 %	0 %	40 %	20 %	145301512
75	NC_009350	TCCCC	2	10	130139	130148	0 %	20 %	0 %	80 %	145301515
76	NC_009350	GCCCG	2	10	137048	137057	0 %	0 %	40 %	60 %	145301519
77	NC_009350	TGAGC	2	10	141365	141374	20 %	20 %	40 %	20 %	145301525
78	NC_009350	AAAAT	2	10	147864	147873	80 %	20 %	0 %	0 %	145301534
79	NC_009350	CAGTG	2	10	148850	148859	20 %	20 %	40 %	20 %	145301535
80	NC_009350	TTGAG	2	10	153702	153711	20 %	40 %	40 %	0 %	145301539

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.