MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	CAAT	2	8	90	97	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009350	CCCT	2	8	1130	1137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009350	CAGG	2	8	1625	1632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009350	GTTC	2	8	2773	2780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009350	TTTG	2	8	6806	6813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009350	ACTC	2	8	7583	7590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009350	CAGT	2	8	9066	9073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009350	GCAG	2	8	9435	9442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009350	GCTG	2	8	11760	11767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009350	TTAA	2	8	12686	12693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009350	GAAC	2	8	13156	13163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009350	CCAT	2	8	13209	13216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009350	TATT	2	8	13982	13989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009350	TTGG	2	8	14025	14032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009350	TGAA	2	8	14885	14892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009350	CAAT	2	8	16040	16047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009350	TGAT	2	8	16057	16064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009350	GGCA	2	8	17579	17586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009350	TGCT	2	8	19392	19399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009350	TCAT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009350	CCCG	2	8	37098	37105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009350	GGCT	2	8	37763	37770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009350	GCGG	2	8	38028	38035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009350	CAAA	2	8	38277	38284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009350	CAGT	2	8	38720	38727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009350	GCTG	2	8	49571	49578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009350	GCTT	2	8	49666	49673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009350	AACT	2	8	51984	51991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009350	CAAA	2	8	53208	53215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009350	GGCC	2	8	53598	53605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009350	TAAA	2	8	53676	53683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009350	TTTA	2	8	63071	63078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009350	GCCC	2	8	73173	73180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_009350	CAAA	2	8	80072	80079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009350	TTAG	2	8	81565	81572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009350	TCGT	2	8	81660	81667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009350	CAAC	2	8	82677	82684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009350	CCTT	2	8	82899	82906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009350	CCAT	2	8	83201	83208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009350	TCTA	2	8	90798	90805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009350	TCGG	2	8	91405	91412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009350	AAAC	2	8	91517	91524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009350	GCTG	2	8	93141	93148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009350	TTGC	2	8	96169	96176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009350	TCGC	2	8	96307	96314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009350	CAGC	2	8	96448	96455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009350	AAGC	2	8	96832	96839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009350	CGAA	2	8	96896	96903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009350	CTGT	2	8	97079	97086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009350	TGGA	2	8	98329	98336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009350	GTTT	2	8	98453	98460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009350	ACCG	2	8	98564	98571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009350	ACGA	2	8	99736	99743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009350	TGAC	2	8	99997	100004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009350	CATT	2	8	104906	104913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009350	CAGA	2	8	109707	109714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009350	CGCC	2	8	111256	111263	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009350	CGCC	2	8	112362	112369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009350	TCAG	2	8	112426	112433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009350	CCGC	2	8	112837	112844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_009350	CGCC	2	8	112859	112866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009350	ATTA	2	8	114704	114711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009350	CCAA	2	8	114935	114942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009350	TGGT	2	8	116360	116367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009350	CTAT	2	8	127200	127207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009350	GCCA	2	8	131211	131218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009350	CTGC	2	8	131385	131392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009350	GTGA	2	8	132235	132242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009350	CGCC	2	8	132473	132480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_009350	AAAT	2	8	135538	135545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009350	ATTG	2	8	135875	135882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009350	TCCC	2	8	135988	135995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009350	TCAC	2	8	136056	136063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009350	ACCC	2	8	136440	136447	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_009350	CAAA	2	8	138924	138931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009350	CTTT	2	8	143156	143163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009350	ACTA	2	8	144558	144565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009350	ATCT	2	8	148072	148079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009350	AAGG	2	8	148189	148196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009350	AGGG	2	8	150231	150238	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009350	CCGG	2	8	150390	150397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009350	ACTA	2	8	151336	151343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009350	ATCC	2	8	151440	151447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009350	ATGG	2	8	151463	151470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009350	GTGA	2	8	151552	151559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009350	ACGT	2	8	152241	152248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009350	TCCC	2	8	152466	152473	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_009350	GTCC	2	8	152583	152590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.