MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 1615

< Previous1234Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009350	CGA	2	6	141526	141531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301525
1502	NC_009350	ACA	2	6	141580	141585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301525
1503	NC_009350	GTA	2	6	141906	141911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301526
1504	NC_009350	CGG	2	6	141980	141985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301526
1505	NC_009350	CAA	2	6	142021	142026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301526
1506	NC_009350	GTG	2	6	142093	142098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301526
1507	NC_009350	CCG	2	6	142251	142256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301527
1508	NC_009350	GGC	2	6	142343	142348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301527
1509	NC_009350	CGC	2	6	142533	142538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301528
1510	NC_009350	CGC	2	6	142602	142607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301528
1511	NC_009350	GGC	2	6	142625	142630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301528
1512	NC_009350	GAT	2	6	142643	142648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301528
1513	NC_009350	CAC	2	6	142716	142721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301528
1514	NC_009350	GCC	2	6	143027	143032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301529
1515	NC_009350	CAG	2	6	143090	143095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301529
1516	NC_009350	CAT	2	6	143119	143124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301529
1517	NC_009350	CAT	2	6	143242	143247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301530
1518	NC_009350	AAG	2	6	143367	143372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301530
1519	NC_009350	CAC	2	6	143458	143463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301530
1520	NC_009350	GAT	2	6	143588	143593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301530
1521	NC_009350	CAC	2	6	143615	143620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301530
1522	NC_009350	ACC	2	6	143632	143637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301530
1523	NC_009350	CTT	2	6	143638	143643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301530
1524	NC_009350	CAC	2	6	143884	143889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301530
1525	NC_009350	CGG	2	6	144084	144089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301531
1526	NC_009350	CCT	2	6	144090	144095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301531
1527	NC_009350	CTC	2	6	144109	144114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301531
1528	NC_009350	CGG	2	6	144143	144148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301531
1529	NC_009350	TGC	2	6	144176	144181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301531
1530	NC_009350	ACC	2	6	144437	144442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301532
1531	NC_009350	ACG	2	6	144443	144448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301532
1532	NC_009350	CCA	2	6	144449	144454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301532
1533	NC_009350	TAT	2	6	144698	144703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301533
1534	NC_009350	CAG	2	6	144722	144727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301533
1535	NC_009350	CTG	2	6	144732	144737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301533
1536	NC_009350	ATC	2	6	144940	144945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301533
1537	NC_009350	GTA	2	6	145077	145082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301533
1538	NC_009350	GGA	2	6	145163	145168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301533
1539	NC_009350	GAT	2	6	145208	145213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301533
1540	NC_009350	ATC	2	6	145347	145352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301533
1541	NC_009350	CTG	2	6	145397	145402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301533
1542	NC_009350	CAA	2	6	145523	145528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301533
1543	NC_009350	TCT	2	6	145552	145557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301533
1544	NC_009350	AGT	2	6	145587	145592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301533
1545	NC_009350	TTG	2	6	145687	145692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301533
1546	NC_009350	TCA	2	6	145961	145966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301533
1547	NC_009350	GAA	2	6	146007	146012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301533
1548	NC_009350	TCA	2	6	146018	146023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301533
1549	NC_009350	CAA	2	6	146066	146071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301533
1550	NC_009350	CAA	2	6	146184	146189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301533
1551	NC_009350	AAC	2	6	146202	146207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301533
1552	NC_009350	ATT	2	6	146421	146426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301534
1553	NC_009350	ATC	2	6	146632	146637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301534
1554	NC_009350	GTA	2	6	146769	146774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301534
1555	NC_009350	TCA	2	6	146839	146844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301534
1556	NC_009350	CTG	2	6	147089	147094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301534
1557	NC_009350	CAT	2	6	147266	147271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301534
1558	NC_009350	ATT	2	6	147378	147383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301534
1559	NC_009350	ATA	2	6	147408	147413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301534
1560	NC_009350	ATG	2	6	147521	147526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301534
1561	NC_009350	ATT	2	6	147535	147540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301534
1562	NC_009350	TCA	2	6	147653	147658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301534
1563	NC_009350	GAA	2	6	147689	147694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301534
1564	NC_009350	CAT	2	6	147821	147826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301534
1565	NC_009350	CGC	2	6	147839	147844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301534
1566	NC_009350	CAA	2	6	147876	147881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301534
1567	NC_009350	TAT	2	6	147909	147914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301534
1568	NC_009350	TAG	2	6	148475	148480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301535
1569	NC_009350	CTT	2	6	148481	148486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301535
1570	NC_009350	GCA	2	6	148557	148562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301535
1571	NC_009350	GAC	2	6	148581	148586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301535
1572	NC_009350	GAA	2	6	148649	148654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301535
1573	NC_009350	TGG	2	6	148679	148684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301535
1574	NC_009350	GTG	2	6	148726	148731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301535
1575	NC_009350	TGA	2	6	148954	148959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301535
1576	NC_009350	CCA	2	6	149143	149148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301536
1577	NC_009350	AGC	2	6	149152	149157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301536
1578	NC_009350	CAC	2	6	149168	149173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301536
1579	NC_009350	GTG	2	6	149440	149445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301536
1580	NC_009350	TCT	2	6	151773	151778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301537
1581	NC_009350	AAC	2	6	151875	151880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301537
1582	NC_009350	CAT	2	6	151951	151956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301537
1583	NC_009350	CCA	2	6	151981	151986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301537
1584	NC_009350	CAT	2	6	151996	152001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301537
1585	NC_009350	TGA	2	6	152002	152007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301537
1586	NC_009350	TTC	2	6	152847	152852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301538
1587	NC_009350	CTT	2	6	152883	152888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301538
1588	NC_009350	TAT	2	6	153054	153059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301538
1589	NC_009350	GCC	3	9	153260	153268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301539
1590	NC_009350	GCA	2	6	153275	153280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301539
1591	NC_009350	TGG	2	6	153540	153545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301539
1592	NC_009350	GGC	2	6	153568	153573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301539
1593	NC_009350	CAT	3	9	153583	153591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301539
1594	NC_009350	CTC	2	6	153625	153630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301539
1595	NC_009350	GGT	2	6	153687	153692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301539
1596	NC_009350	CAC	2	6	153751	153756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301539
1597	NC_009350	TTG	2	6	153800	153805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1598	NC_009350	CCG	2	6	153828	153833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301539
1599	NC_009350	AGC	2	6	153908	153913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301539
1600	NC_009350	TTG	2	6	153914	153919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1601	NC_009350	GCG	3	9	153935	153943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301539
1602	NC_009350	GTC	2	6	154081	154086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301539
1603	NC_009350	CAT	2	6	154143	154148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301539
1604	NC_009350	TGT	2	6	154263	154268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1605	NC_009350	TGT	2	6	154272	154277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1606	NC_009350	GAA	2	6	154291	154296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301539
1607	NC_009350	CGG	2	6	154374	154379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301539
1608	NC_009350	TGT	2	6	154410	154415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1609	NC_009350	GAT	2	6	154516	154521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301539
1610	NC_009350	CAA	2	6	154539	154544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301539
1611	NC_009350	GTT	2	6	154598	154603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1612	NC_009350	TGT	2	6	154626	154631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301539
1613	NC_009350	ATC	2	6	154643	154648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301539
1614	NC_009350	CCA	2	6	154649	154654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301539
1615	NC_009350	TCG	2	6	154659	154664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301539

< Previous1234Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.