MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	GT	3	6	1222	1227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009350	AG	3	6	1394	1399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009350	CA	3	6	3108	3113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009350	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	145301389
5	NC_009350	CA	3	6	3740	3745	50 %	0 %	0 %	50 %	145301389
6	NC_009350	AG	3	6	4035	4040	50 %	0 %	50 %	0 %	145301390
7	NC_009350	GA	3	6	4170	4175	50 %	0 %	50 %	0 %	145301390
8	NC_009350	GC	3	6	4527	4532	0 %	0 %	50 %	50 %	145301391
9	NC_009350	CA	3	6	4761	4766	50 %	0 %	0 %	50 %	145301391
10	NC_009350	CG	3	6	4932	4937	0 %	0 %	50 %	50 %	145301391
11	NC_009350	TC	3	6	5920	5925	0 %	50 %	0 %	50 %	145301392
12	NC_009350	AT	5	10	6848	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009350	GC	3	6	8003	8008	0 %	0 %	50 %	50 %	145301394
14	NC_009350	AG	3	6	8541	8546	50 %	0 %	50 %	0 %	145301394
15	NC_009350	AC	3	6	9369	9374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009350	GC	3	6	10484	10489	0 %	0 %	50 %	50 %	145301395
17	NC_009350	AT	3	6	10985	10990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009350	TG	3	6	11741	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009350	TG	3	6	14530	14535	0 %	50 %	50 %	0 %	145301399
20	NC_009350	GT	3	6	14576	14581	0 %	50 %	50 %	0 %	145301399
21	NC_009350	CA	4	8	14668	14675	50 %	0 %	0 %	50 %	145301399
22	NC_009350	CT	3	6	14871	14876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009350	TA	3	6	15347	15352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009350	GA	3	6	15920	15925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009350	GT	3	6	17179	17184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009350	AG	3	6	17351	17356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009350	CT	3	6	19049	19054	0 %	50 %	0 %	50 %	145301404
28	NC_009350	GC	3	6	19081	19086	0 %	0 %	50 %	50 %	145301404
29	NC_009350	TA	3	6	19099	19104	50 %	50 %	0 %	0 %	145301404
30	NC_009350	TG	3	6	19658	19663	0 %	50 %	50 %	0 %	145301405
31	NC_009350	CT	3	6	20083	20088	0 %	50 %	0 %	50 %	145301405
32	NC_009350	AG	3	6	20119	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	145301406
33	NC_009350	CA	3	6	20148	20153	50 %	0 %	0 %	50 %	145301406
34	NC_009350	CA	3	6	21282	21287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009350	TA	3	6	21380	21385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009350	TA	3	6	21646	21651	50 %	50 %	0 %	0 %	145301407
37	NC_009350	TC	3	6	23354	23359	0 %	50 %	0 %	50 %	145301410
38	NC_009350	CA	4	8	23360	23367	50 %	0 %	0 %	50 %	145301410
39	NC_009350	CT	3	6	24364	24369	0 %	50 %	0 %	50 %	145301411
40	NC_009350	CA	3	6	24486	24491	50 %	0 %	0 %	50 %	145301411
41	NC_009350	CT	3	6	25586	25591	0 %	50 %	0 %	50 %	145301412
42	NC_009350	GC	3	6	26125	26130	0 %	0 %	50 %	50 %	145301413
43	NC_009350	CT	3	6	28838	28843	0 %	50 %	0 %	50 %	145301414
44	NC_009350	CT	3	6	29779	29784	0 %	50 %	0 %	50 %	145301416
45	NC_009350	GA	3	6	31407	31412	50 %	0 %	50 %	0 %	145301418
46	NC_009350	CA	3	6	32207	32212	50 %	0 %	0 %	50 %	145301419
47	NC_009350	GA	3	6	32583	32588	50 %	0 %	50 %	0 %	145301419
48	NC_009350	AT	3	6	32760	32765	50 %	50 %	0 %	0 %	145301419
49	NC_009350	GC	3	6	33160	33165	0 %	0 %	50 %	50 %	145301419
50	NC_009350	AC	3	6	34635	34640	50 %	0 %	0 %	50 %	145301421
51	NC_009350	GA	3	6	37209	37214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009350	CT	3	6	37424	37429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009350	AG	4	8	38130	38137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009350	AC	3	6	38947	38952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009350	AC	3	6	39109	39114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009350	AT	3	6	39196	39201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009350	TC	3	6	39628	39633	0 %	50 %	0 %	50 %	145301423
58	NC_009350	AG	3	6	39937	39942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009350	AC	3	6	40018	40023	50 %	0 %	0 %	50 %	145301424
60	NC_009350	GC	3	6	44649	44654	0 %	0 %	50 %	50 %	145301426
61	NC_009350	AC	3	6	44987	44992	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
62	NC_009350	AC	3	6	45064	45069	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
63	NC_009350	CA	3	6	45480	45485	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
64	NC_009350	TC	3	6	45679	45684	0 %	50 %	0 %	50 %	145301426
65	NC_009350	TC	3	6	46022	46027	0 %	50 %	0 %	50 %	145301426
66	NC_009350	CA	3	6	47629	47634	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
67	NC_009350	GC	3	6	48463	48468	0 %	0 %	50 %	50 %	145301427
68	NC_009350	CA	3	6	48697	48702	50 %	0 %	0 %	50 %	145301427
69	NC_009350	CG	3	6	48868	48873	0 %	0 %	50 %	50 %	145301427
70	NC_009350	TG	3	6	50419	50424	0 %	50 %	50 %	0 %	145301428
71	NC_009350	AT	3	6	51344	51349	50 %	50 %	0 %	0 %	145301428
72	NC_009350	GA	5	10	51525	51534	50 %	0 %	50 %	0 %	145301429
73	NC_009350	GA	3	6	51674	51679	50 %	0 %	50 %	0 %	145301429
74	NC_009350	CT	3	6	53120	53125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009350	AC	3	6	53220	53225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009350	AT	3	6	53729	53734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009350	AG	3	6	54326	54331	50 %	0 %	50 %	0 %	145301431
78	NC_009350	GC	3	6	55149	55154	0 %	0 %	50 %	50 %	145301433
79	NC_009350	CT	3	6	55510	55515	0 %	50 %	0 %	50 %	145301433
80	NC_009350	CG	3	6	56364	56369	0 %	0 %	50 %	50 %	145301435
81	NC_009350	CT	3	6	56801	56806	0 %	50 %	0 %	50 %	145301436
82	NC_009350	AC	3	6	56873	56878	50 %	0 %	0 %	50 %	145301436
83	NC_009350	GT	3	6	57698	57703	0 %	50 %	50 %	0 %	145301439
84	NC_009350	CG	3	6	58134	58139	0 %	0 %	50 %	50 %	145301439
85	NC_009350	CA	3	6	58756	58761	50 %	0 %	0 %	50 %	145301440
86	NC_009350	GC	3	6	58917	58922	0 %	0 %	50 %	50 %	145301440
87	NC_009350	GA	3	6	58943	58948	50 %	0 %	50 %	0 %	145301440
88	NC_009350	GC	3	6	58985	58990	0 %	0 %	50 %	50 %	145301440
89	NC_009350	GA	3	6	59675	59680	50 %	0 %	50 %	0 %	145301440
90	NC_009350	AT	3	6	62117	62122	50 %	50 %	0 %	0 %	145301443
91	NC_009350	GC	3	6	63693	63698	0 %	0 %	50 %	50 %	145301445
92	NC_009350	CT	3	6	63826	63831	0 %	50 %	0 %	50 %	145301446
93	NC_009350	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	145301446
94	NC_009350	AG	3	6	64180	64185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009350	AG	3	6	66702	66707	50 %	0 %	50 %	0 %	145301449
96	NC_009350	TC	3	6	66891	66896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009350	AG	3	6	67453	67458	50 %	0 %	50 %	0 %	145301450
98	NC_009350	GC	3	6	69193	69198	0 %	0 %	50 %	50 %	145301453
99	NC_009350	GC	3	6	70396	70401	0 %	0 %	50 %	50 %	145301453
100	NC_009350	GA	3	6	72273	72278	50 %	0 %	50 %	0 %	145301458
101	NC_009350	AG	3	6	72449	72454	50 %	0 %	50 %	0 %	145301458
102	NC_009350	GC	3	6	72551	72556	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
103	NC_009350	GC	3	6	72659	72664	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
104	NC_009350	GC	3	6	72897	72902	0 %	0 %	50 %	50 %	145301458
105	NC_009350	CA	4	8	75409	75416	50 %	0 %	0 %	50 %	145301461
106	NC_009350	TC	3	6	76143	76148	0 %	50 %	0 %	50 %	145301461
107	NC_009350	CT	3	6	76762	76767	0 %	50 %	0 %	50 %	145301462
108	NC_009350	GC	3	6	80129	80134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009350	GC	3	6	80737	80742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009350	CT	3	6	82151	82156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009350	AT	3	6	83237	83242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009350	TG	3	6	83448	83453	0 %	50 %	50 %	0 %	145301468
113	NC_009350	AC	3	6	83738	83743	50 %	0 %	0 %	50 %	145301469
114	NC_009350	CT	3	6	84030	84035	0 %	50 %	0 %	50 %	145301469
115	NC_009350	AT	3	6	84821	84826	50 %	50 %	0 %	0 %	145301470
116	NC_009350	AG	4	8	84992	84999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009350	GC	3	6	85315	85320	0 %	0 %	50 %	50 %	145301471
118	NC_009350	CA	3	6	85549	85554	50 %	0 %	0 %	50 %	145301471
119	NC_009350	CG	3	6	85720	85725	0 %	0 %	50 %	50 %	145301471
120	NC_009350	GT	3	6	87583	87588	0 %	50 %	50 %	0 %	145301473
121	NC_009350	AG	3	6	88619	88624	50 %	0 %	50 %	0 %	145301473
122	NC_009350	GC	3	6	90012	90017	0 %	0 %	50 %	50 %	145301474
123	NC_009350	CT	3	6	90937	90942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009350	TC	3	6	91429	91434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009350	CA	3	6	92779	92784	50 %	0 %	0 %	50 %	145301477
126	NC_009350	AT	3	6	93240	93245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009350	GA	3	6	94784	94789	50 %	0 %	50 %	0 %	145301479
128	NC_009350	CT	3	6	95554	95559	0 %	50 %	0 %	50 %	145301479
129	NC_009350	GC	3	6	96244	96249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009350	GT	3	6	96660	96665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009350	GA	3	6	97154	97159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009350	TC	3	6	97729	97734	0 %	50 %	0 %	50 %	145301480
133	NC_009350	AG	3	6	97801	97806	50 %	0 %	50 %	0 %	145301480
134	NC_009350	GA	3	6	98543	98548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009350	GA	3	6	99034	99039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009350	TC	3	6	100063	100068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009350	CT	3	6	100565	100570	0 %	50 %	0 %	50 %	145301481
138	NC_009350	TC	3	6	102094	102099	0 %	50 %	0 %	50 %	145301484
139	NC_009350	AC	3	6	102370	102375	50 %	0 %	0 %	50 %	145301485
140	NC_009350	AT	3	6	102604	102609	50 %	50 %	0 %	0 %	145301485
141	NC_009350	CA	3	6	103344	103349	50 %	0 %	0 %	50 %	145301486
142	NC_009350	CT	3	6	109819	109824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009350	CA	3	6	110566	110571	50 %	0 %	0 %	50 %	145301496
144	NC_009350	TA	4	8	111225	111232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009350	CA	3	6	111443	111448	50 %	0 %	0 %	50 %	145301497
146	NC_009350	TG	3	6	113437	113442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.