MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	T	6	6	44	49	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009350	A	7	7	978	984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009350	T	7	7	1426	1432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009350	A	9	9	1457	1465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009350	T	6	6	3091	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009350	A	7	7	3144	3150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009350	A	8	8	3866	3873	100 %	0 %	0 %	0 %	145301390
8	NC_009350	G	6	6	4476	4481	0 %	0 %	100 %	0 %	145301391
9	NC_009350	A	6	6	5487	5492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009350	T	6	6	5595	5600	0 %	100 %	0 %	0 %	145301392
11	NC_009350	T	6	6	9103	9108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009350	T	6	6	11013	11018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009350	A	6	6	11070	11075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009350	A	7	7	11646	11652	100 %	0 %	0 %	0 %	145301396
15	NC_009350	T	6	6	11875	11880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009350	C	7	7	12598	12604	0 %	0 %	0 %	100 %	145301398
17	NC_009350	T	9	9	14050	14058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009350	T	6	6	14329	14334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009350	A	6	6	14513	14518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009350	T	6	6	14651	14656	0 %	100 %	0 %	0 %	145301399
21	NC_009350	T	6	6	15374	15379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009350	T	6	6	15995	16000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009350	A	8	8	16933	16940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009350	C	6	6	17084	17089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_009350	T	7	7	17383	17389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009350	A	9	9	17414	17422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009350	G	7	7	17562	17568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009350	A	7	7	18773	18779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009350	A	6	6	18880	18885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009350	T	6	6	20100	20105	0 %	100 %	0 %	0 %	145301405
31	NC_009350	C	6	6	20647	20652	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_009350	A	6	6	20942	20947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009350	A	6	6	20969	20974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009350	T	7	7	20991	20997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009350	C	9	9	21060	21068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_009350	A	7	7	21275	21281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009350	T	6	6	21569	21574	0 %	100 %	0 %	0 %	145301407
38	NC_009350	A	7	7	21879	21885	100 %	0 %	0 %	0 %	145301407
39	NC_009350	A	6	6	22126	22131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009350	A	6	6	22165	22170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009350	T	8	8	22190	22197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009350	A	7	7	23112	23118	100 %	0 %	0 %	0 %	145301409
43	NC_009350	T	6	6	23516	23521	0 %	100 %	0 %	0 %	145301410
44	NC_009350	G	6	6	23668	23673	0 %	0 %	100 %	0 %	145301410
45	NC_009350	G	6	6	25272	25277	0 %	0 %	100 %	0 %	145301412
46	NC_009350	A	6	6	25381	25386	100 %	0 %	0 %	0 %	145301412
47	NC_009350	G	6	6	25440	25445	0 %	0 %	100 %	0 %	145301412
48	NC_009350	A	6	6	25712	25717	100 %	0 %	0 %	0 %	145301412
49	NC_009350	C	6	6	25813	25818	0 %	0 %	0 %	100 %	145301412
50	NC_009350	A	6	6	26450	26455	100 %	0 %	0 %	0 %	145301414
51	NC_009350	C	6	6	26598	26603	0 %	0 %	0 %	100 %	145301414
52	NC_009350	A	6	6	26891	26896	100 %	0 %	0 %	0 %	145301414
53	NC_009350	G	7	7	27236	27242	0 %	0 %	100 %	0 %	145301414
54	NC_009350	G	6	6	27432	27437	0 %	0 %	100 %	0 %	145301414
55	NC_009350	C	6	6	29030	29035	0 %	0 %	0 %	100 %	145301415
56	NC_009350	G	6	6	29312	29317	0 %	0 %	100 %	0 %	145301415
57	NC_009350	C	6	6	30088	30093	0 %	0 %	0 %	100 %	145301417
58	NC_009350	T	6	6	30261	30266	0 %	100 %	0 %	0 %	145301417
59	NC_009350	T	7	7	31017	31023	0 %	100 %	0 %	0 %	145301417
60	NC_009350	C	6	6	31080	31085	0 %	0 %	0 %	100 %	145301418
61	NC_009350	T	7	7	31691	31697	0 %	100 %	0 %	0 %	145301419
62	NC_009350	A	6	6	33058	33063	100 %	0 %	0 %	0 %	145301419
63	NC_009350	A	7	7	33714	33720	100 %	0 %	0 %	0 %	145301419
64	NC_009350	T	6	6	34994	34999	0 %	100 %	0 %	0 %	145301421
65	NC_009350	T	6	6	35240	35245	0 %	100 %	0 %	0 %	145301422
66	NC_009350	A	6	6	39371	39376	100 %	0 %	0 %	0 %	145301423
67	NC_009350	A	6	6	39652	39657	100 %	0 %	0 %	0 %	145301423
68	NC_009350	A	7	7	39956	39962	100 %	0 %	0 %	0 %	145301424
69	NC_009350	C	6	6	40719	40724	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_009350	A	6	6	41211	41216	100 %	0 %	0 %	0 %	145301425
71	NC_009350	A	6	6	41743	41748	100 %	0 %	0 %	0 %	145301425
72	NC_009350	C	6	6	44126	44131	0 %	0 %	0 %	100 %	145301426
73	NC_009350	A	6	6	47391	47396	100 %	0 %	0 %	0 %	145301426
74	NC_009350	A	6	6	48067	48072	100 %	0 %	0 %	0 %	145301426
75	NC_009350	T	6	6	48092	48097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009350	T	6	6	48126	48131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009350	G	6	6	48412	48417	0 %	0 %	100 %	0 %	145301427
78	NC_009350	A	6	6	49423	49428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009350	A	6	6	49488	49493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009350	G	6	6	49646	49651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009350	T	6	6	50785	50790	0 %	100 %	0 %	0 %	145301428
82	NC_009350	A	6	6	50950	50955	100 %	0 %	0 %	0 %	145301428
83	NC_009350	T	6	6	51076	51081	0 %	100 %	0 %	0 %	145301428
84	NC_009350	T	6	6	51122	51127	0 %	100 %	0 %	0 %	145301428
85	NC_009350	A	6	6	51157	51162	100 %	0 %	0 %	0 %	145301428
86	NC_009350	T	10	10	51170	51179	0 %	100 %	0 %	0 %	145301428
87	NC_009350	A	6	6	51807	51812	100 %	0 %	0 %	0 %	145301429
88	NC_009350	T	6	6	51932	51937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009350	T	6	6	52401	52406	0 %	100 %	0 %	0 %	145301430
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91	NC_009350	G	6	6	54411	54416	0 %	0 %	100 %	0 %	145301432
92	NC_009350	C	6	6	54821	54826	0 %	0 %	0 %	100 %	145301432
93	NC_009350	C	6	6	56619	56624	0 %	0 %	0 %	100 %	145301435
94	NC_009350	C	6	6	58862	58867	0 %	0 %	0 %	100 %	145301440
95	NC_009350	C	6	6	58922	58927	0 %	0 %	0 %	100 %	145301440
96	NC_009350	G	6	6	59346	59351	0 %	0 %	100 %	0 %	145301440
97	NC_009350	G	6	6	60581	60586	0 %	0 %	100 %	0 %	145301441
98	NC_009350	G	6	6	60737	60742	0 %	0 %	100 %	0 %	145301441
99	NC_009350	A	6	6	61899	61904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009350	G	6	6	62339	62344	0 %	0 %	100 %	0 %	145301443
101	NC_009350	G	6	6	62895	62900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009350	T	7	7	63136	63142	0 %	100 %	0 %	0 %	145301444
103	NC_009350	C	6	6	63326	63331	0 %	0 %	0 %	100 %	145301444
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105	NC_009350	C	6	6	68763	68768	0 %	0 %	0 %	100 %	145301452
106	NC_009350	C	6	6	70552	70557	0 %	0 %	0 %	100 %	145301453
107	NC_009350	C	6	6	73227	73232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_009350	C	6	6	73497	73502	0 %	0 %	0 %	100 %	145301459
109	NC_009350	C	7	7	75444	75450	0 %	0 %	0 %	100 %	145301461
110	NC_009350	C	6	6	75974	75979	0 %	0 %	0 %	100 %	145301461
111	NC_009350	C	7	7	77434	77440	0 %	0 %	0 %	100 %	145301463
112	NC_009350	G	8	8	78310	78317	0 %	0 %	100 %	0 %	145301465
113	NC_009350	T	6	6	78611	78616	0 %	100 %	0 %	0 %	145301465
114	NC_009350	T	6	6	78686	78691	0 %	100 %	0 %	0 %	145301465
115	NC_009350	T	6	6	83098	83103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009350	T	6	6	83627	83632	0 %	100 %	0 %	0 %	145301468
117	NC_009350	A	9	9	83792	83800	100 %	0 %	0 %	0 %	145301469
118	NC_009350	A	6	6	84167	84172	100 %	0 %	0 %	0 %	145301469
119	NC_009350	T	6	6	84278	84283	0 %	100 %	0 %	0 %	145301469
120	NC_009350	A	6	6	84477	84482	100 %	0 %	0 %	0 %	145301469
121	NC_009350	T	6	6	84684	84689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009350	G	6	6	85264	85269	0 %	0 %	100 %	0 %	145301471
123	NC_009350	A	6	6	86275	86280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009350	C	7	7	91104	91110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_009350	G	8	8	94042	94049	0 %	0 %	100 %	0 %	145301479
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127	NC_009350	A	6	6	97004	97009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009350	T	6	6	97164	97169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009350	T	6	6	97643	97648	0 %	100 %	0 %	0 %	145301480
130	NC_009350	G	7	7	98867	98873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009350	T	6	6	100640	100645	0 %	100 %	0 %	0 %	145301481
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134	NC_009350	C	6	6	105544	105549	0 %	0 %	0 %	100 %	145301489
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136	NC_009350	G	6	6	111719	111724	0 %	0 %	100 %	0 %	145301497
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141	NC_009350	T	6	6	120123	120128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_009350	T	7	7	126470	126476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009350	A	6	6	126934	126939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.