MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CAAGGC	2	12	987	998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
2	NC_009349	GGTCAA	2	12	1227	1238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301212
3	NC_009349	CGAACA	2	12	1910	1921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301213
4	NC_009349	CTGTGG	2	12	2099	2110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301213
5	NC_009349	AAAAAT	2	12	3332	3343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009349	ATGGTA	2	12	5327	5338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009349	TCTTGA	2	12	10526	10537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145301223
8	NC_009349	AAAAAC	2	12	14859	14870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009349	ACCCAG	2	12	16365	16376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301228
10	NC_009349	AAATTA	2	12	19276	19287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301231
11	NC_009349	GCTCCT	2	12	22515	22526	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145301235
12	NC_009349	TGTTCT	2	12	22602	22613	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	145301235
13	NC_009349	ATTGCA	2	12	24457	24468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301237
14	NC_009349	TCCGGC	2	12	31563	31574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301247
15	NC_009349	AACGAT	2	12	34721	34732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145301249
16	NC_009349	ACCAGA	2	12	42045	42056	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009349	CAGTGA	2	12	45720	45731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301264
18	NC_009349	TGCAAT	2	12	48317	48328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301267
19	NC_009349	TTGATT	2	12	53399	53410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	145301272
20	NC_009349	GATCAT	2	12	54728	54739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301272
21	NC_009349	GGCTGG	2	12	57119	57130	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301274
22	NC_009349	CTCTGG	2	12	57194	57205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301274
23	NC_009349	CATAAT	2	12	60327	60338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009349	CCATGG	2	12	60495	60506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009349	ATCTTG	2	12	61605	61616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009349	TTACAA	2	12	64689	64700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009349	TTCTGC	2	12	68260	68271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145301282
28	NC_009349	ACTATG	2	12	68911	68922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009349	CAAGGC	2	12	80963	80974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301294
30	NC_009349	GGTCAA	2	12	81203	81214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301294
31	NC_009349	CGAACA	2	12	81886	81897	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009349	CTGGTC	2	12	82959	82970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301296
33	NC_009349	CCTGCC	2	12	85958	85969	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145301301
34	NC_009349	CGCGCT	2	12	86043	86054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301301
35	NC_009349	AGGTAA	2	12	87142	87153	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145301303
36	NC_009349	GCCCAC	2	12	88949	88960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145301304
37	NC_009349	AGGGCA	2	12	92946	92957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009349	CTGACA	2	12	111877	111888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009349	CCCTTC	2	12	118695	118706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301337
40	NC_009349	TGATGT	2	12	121067	121078	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145301338
41	NC_009349	CACCAG	2	12	131421	131432	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301353
42	NC_009349	CACCGG	2	12	133575	133586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301356
43	NC_009349	ATTCTG	2	12	138563	138574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145301359
44	NC_009349	TTGAAA	2	12	141460	141471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145301364
45	NC_009349	AATAGC	2	12	143387	143398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145301366
46	NC_009349	AAACAA	2	12	144933	144944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	145301368
47	NC_009349	ACTACA	2	12	146628	146639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	145301369
48	NC_009349	GAGTTT	2	12	157411	157422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145301377
49	NC_009349	CAGATC	2	12	164324	164335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301382

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.