MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CAAGGC	2	12	987	998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
2	NC_009349	GGTCAA	2	12	1227	1238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301212
3	NC_009349	CGAACA	2	12	1910	1921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145301213
4	NC_009349	CTGTGG	2	12	2099	2110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145301213
5	NC_009349	TCTTGA	2	12	10526	10537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145301223
6	NC_009349	ACCCAG	2	12	16365	16376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301228
7	NC_009349	AAATTA	2	12	19276	19287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301231
8	NC_009349	GCTCCT	2	12	22515	22526	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145301235
9	NC_009349	TGTTCT	2	12	22602	22613	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	145301235
10	NC_009349	ATTGCA	2	12	24457	24468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301237
11	NC_009349	TCCGGC	2	12	31563	31574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301247
12	NC_009349	AACGAT	2	12	34721	34732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145301249
13	NC_009349	CAGTGA	2	12	45720	45731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301264
14	NC_009349	TGCAAT	2	12	48317	48328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301267
15	NC_009349	TTGATT	2	12	53399	53410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	145301272
16	NC_009349	GATCAT	2	12	54728	54739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145301272
17	NC_009349	GGCTGG	2	12	57119	57130	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145301274
18	NC_009349	CTCTGG	2	12	57194	57205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301274
19	NC_009349	TTCTGC	2	12	68260	68271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	145301282
20	NC_009349	CAAGGC	2	12	80963	80974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301294
21	NC_009349	GGTCAA	2	12	81203	81214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145301294
22	NC_009349	CTGGTC	2	12	82959	82970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301296
23	NC_009349	CCTGCC	2	12	85958	85969	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145301301
24	NC_009349	CGCGCT	2	12	86043	86054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145301301
25	NC_009349	AGGTAA	2	12	87142	87153	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	145301303
26	NC_009349	GCCCAC	2	12	88949	88960	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145301304
27	NC_009349	CCCTTC	2	12	118695	118706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301337
28	NC_009349	TGATGT	2	12	121067	121078	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145301338
29	NC_009349	CACCAG	2	12	131421	131432	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145301353
30	NC_009349	CACCGG	2	12	133575	133586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145301356
31	NC_009349	ATTCTG	2	12	138563	138574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145301359
32	NC_009349	TTGAAA	2	12	141460	141471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	145301364
33	NC_009349	AATAGC	2	12	143387	143398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	145301366
34	NC_009349	AAACAA	2	12	144933	144944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	145301368
35	NC_009349	ACTACA	2	12	146628	146639	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	145301369
36	NC_009349	GAGTTT	2	12	157411	157422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145301377
37	NC_009349	CAGATC	2	12	164324	164335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145301382

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.