MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	ACCG	2	8	5368	5375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009349	ACCC	2	8	5786	5793	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009349	TTAT	2	8	14778	14785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009349	ATTT	2	8	14907	14914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009349	TGAC	2	8	15115	15122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009349	TCAC	2	8	20771	20778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009349	GTAA	2	8	20955	20962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009349	CTGT	2	8	24701	24708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009349	CACG	2	8	24906	24913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009349	TGAT	2	8	25674	25681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009349	CCTT	2	8	26879	26886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009349	AAAT	2	8	27481	27488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009349	CTTG	2	8	30770	30777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009349	CTTA	2	8	31222	31229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009349	CAAG	2	8	33723	33730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009349	CCAA	2	8	38564	38571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009349	ACCC	2	8	38612	38619	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009349	AATA	2	8	40373	40380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009349	GATC	2	8	40405	40412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009349	AAAG	2	8	40419	40426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009349	ACCT	2	8	40497	40504	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009349	TAGT	2	8	42083	42090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009349	TCAA	2	8	42749	42756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009349	ACCT	2	8	42769	42776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009349	CTGT	2	8	42854	42861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009349	CTAT	2	8	44861	44868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009349	ATCT	3	12	44950	44961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009349	AATT	2	8	47639	47646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009349	ATAA	2	8	48153	48160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009349	TTAT	2	8	48175	48182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009349	CTTG	2	8	50531	50538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009349	GGGT	2	8	62674	62681	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009349	GAAC	2	8	63927	63934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009349	CCCT	2	8	63961	63968	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_009349	GTTG	2	8	64675	64682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009349	ACCT	2	8	82091	82098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009349	GCGG	2	8	90138	90145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009349	CTGG	2	8	92638	92645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009349	CCGC	2	8	93000	93007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009349	ACCT	2	8	93037	93044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009349	GGCT	2	8	93580	93587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009349	ATGG	2	8	93643	93650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009349	TGCG	2	8	94052	94059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009349	GTCA	2	8	101086	101093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009349	CATT	2	8	101889	101896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009349	GGTT	2	8	109006	109013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009349	AGAT	2	8	110547	110554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009349	CTTG	2	8	111673	111680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009349	TCAT	2	8	111817	111824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009349	AACT	2	8	111934	111941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009349	AGGG	2	8	111963	111970	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009349	TGGC	2	8	112320	112327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009349	GACC	2	8	112438	112445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009349	TCAT	2	8	112462	112469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009349	TGTT	2	8	115366	115373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009349	TGGA	2	8	116540	116547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009349	TTGC	2	8	116635	116642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009349	GGTA	2	8	117527	117534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009349	AGGG	2	8	117985	117992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009349	GTTT	2	8	120511	120518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009349	TATT	2	8	121363	121370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009349	AAGG	2	8	121562	121569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009349	TGTT	2	8	121658	121665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009349	ACTC	2	8	123165	123172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009349	TGTT	2	8	126115	126122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009349	AACC	2	8	127146	127153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009349	GCTC	2	8	127433	127440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009349	CAAT	2	8	127495	127502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009349	CAGC	2	8	127676	127683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009349	TGTT	2	8	130899	130906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009349	CGTT	2	8	135946	135953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009349	TGTT	2	8	135957	135964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009349	CAGA	2	8	136732	136739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009349	ATCC	2	8	136784	136791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009349	GATT	2	8	138996	139003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009349	TGAA	2	8	141144	141151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009349	TGCC	2	8	142194	142201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009349	AGCC	2	8	142598	142605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009349	TGAA	2	8	144880	144887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009349	TTGT	2	8	148471	148478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009349	CGCA	2	8	148560	148567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009349	ACCT	2	8	149008	149015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009349	CTGA	2	8	149031	149038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009349	AAGG	2	8	155356	155363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009349	CCCT	2	8	159282	159289	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_009349	TGGC	2	8	165472	165479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009349	AGTG	2	8	165549	165556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.