MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 2222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CCT	2	6	103	108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009349	ATC	2	6	159	164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009349	TGC	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
4	NC_009349	CTC	2	6	346	351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301212
5	NC_009349	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301212
6	NC_009349	GCT	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
7	NC_009349	GAG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301212
8	NC_009349	ACT	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301212
9	NC_009349	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301212
10	NC_009349	CTG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
11	NC_009349	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
12	NC_009349	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
13	NC_009349	CTT	2	6	1056	1061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301212
14	NC_009349	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
15	NC_009349	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
16	NC_009349	TGC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301212
17	NC_009349	AGC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301212
18	NC_009349	CAA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
19	NC_009349	CAA	3	9	1842	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
20	NC_009349	CTG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
21	NC_009349	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
22	NC_009349	TAC	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301213
23	NC_009349	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
24	NC_009349	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
25	NC_009349	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
26	NC_009349	CTG	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301213
27	NC_009349	GAT	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301213
28	NC_009349	CGA	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301213
29	NC_009349	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301213
30	NC_009349	AGC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301214
31	NC_009349	CAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301214
32	NC_009349	TGA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301214
33	NC_009349	TCG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009349	TAC	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009349	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009349	TAC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009349	CAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301215
38	NC_009349	TTA	3	9	3400	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301215
39	NC_009349	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
40	NC_009349	CCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
41	NC_009349	TAA	2	6	3528	3533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
42	NC_009349	TGG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301215
43	NC_009349	CCT	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301215
44	NC_009349	AAT	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301215
45	NC_009349	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
46	NC_009349	TTG	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301215
47	NC_009349	CAG	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301215
48	NC_009349	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301215
49	NC_009349	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
50	NC_009349	TCA	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
51	NC_009349	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
52	NC_009349	TTG	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301216
53	NC_009349	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
54	NC_009349	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
55	NC_009349	TAT	2	6	4326	4331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301216
56	NC_009349	CAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301216
57	NC_009349	ATG	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
58	NC_009349	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
59	NC_009349	TGG	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
60	NC_009349	GCT	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
61	NC_009349	TCC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301216
62	NC_009349	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301216
63	NC_009349	TCA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301216
64	NC_009349	TGC	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301216
65	NC_009349	TGG	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301216
66	NC_009349	ACT	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009349	ATT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009349	AGT	2	6	5451	5456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009349	TCC	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009349	CCA	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_009349	GAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009349	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009349	TCG	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009349	CAT	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009349	GGC	2	6	6248	6253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301217
76	NC_009349	TCA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301217
77	NC_009349	TTG	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301217
78	NC_009349	GTC	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301217
79	NC_009349	GAT	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
80	NC_009349	TGA	2	6	6359	6364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301217
81	NC_009349	AGG	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301217
82	NC_009349	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301218
83	NC_009349	CTC	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301218
84	NC_009349	TGG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301218
85	NC_009349	ACC	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301218
86	NC_009349	CTG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009349	ATT	2	6	7174	7179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009349	TGT	2	6	7201	7206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009349	CGG	2	6	7320	7325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301219
90	NC_009349	TGC	2	6	7436	7441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301219
91	NC_009349	TGG	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
92	NC_009349	CGA	2	6	7533	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301219
93	NC_009349	GTG	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301219
94	NC_009349	CTC	2	6	7580	7585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009349	AGC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
96	NC_009349	CTG	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
97	NC_009349	GTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
98	NC_009349	GCC	3	9	8016	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
99	NC_009349	ATG	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
100	NC_009349	CTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
101	NC_009349	GCC	2	6	8127	8132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
102	NC_009349	GGT	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
103	NC_009349	ACC	2	6	8274	8279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
104	NC_009349	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
105	NC_009349	GGC	2	6	8318	8323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
106	NC_009349	CTG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301220
107	NC_009349	GAA	2	6	8353	8358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301220
108	NC_009349	GTG	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301220
109	NC_009349	CGG	2	6	8467	8472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
110	NC_009349	AAC	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301220
111	NC_009349	CGG	2	6	8732	8737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
112	NC_009349	GCC	2	6	8743	8748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301220
113	NC_009349	CCA	2	6	8757	8762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301220
114	NC_009349	GGC	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
115	NC_009349	GAT	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301220
116	NC_009349	GGC	2	6	8962	8967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301220
117	NC_009349	GCA	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
118	NC_009349	CAG	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301220
119	NC_009349	TGC	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301221
120	NC_009349	TGA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301221
121	NC_009349	CAT	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301221
122	NC_009349	GTT	2	6	9693	9698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301221
123	NC_009349	ACA	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301221
124	NC_009349	GCA	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301221
125	NC_009349	TGA	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301221
126	NC_009349	GGT	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301221
127	NC_009349	TCT	2	6	9830	9835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301221
128	NC_009349	TAT	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301221
129	NC_009349	GCG	2	6	9906	9911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301221
130	NC_009349	CCA	2	6	9930	9935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301221
131	NC_009349	AAT	2	6	9972	9977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301222
132	NC_009349	TCG	2	6	10047	10052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301222
133	NC_009349	GCT	2	6	10085	10090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301222
134	NC_009349	ACC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301222
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136	NC_009349	TGT	2	6	10283	10288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301223
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141	NC_009349	AAT	2	6	10841	10846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301223
142	NC_009349	TCC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301223
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152	NC_009349	ATC	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301223
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159	NC_009349	CTG	2	6	11967	11972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301224
160	NC_009349	TGG	2	6	12077	12082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301224
161	NC_009349	AAT	2	6	12229	12234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301224
162	NC_009349	GAG	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301224
163	NC_009349	ATT	3	9	12369	12377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145301224
164	NC_009349	TCA	2	6	12473	12478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301224
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188	NC_009349	CAG	2	6	14725	14730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_009349	CAA	3	9	14743	14751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_009349	TGA	2	6	14802	14807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_009349	ATA	2	6	14921	14926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009349	CAA	2	6	15140	15145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145301226
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244	NC_009349	TGT	2	6	19540	19545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009349	CCT	2	6	19598	19603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
246	NC_009349	TAA	2	6	19664	19669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_009349	ACG	2	6	19729	19734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_009349	TAA	2	6	19738	19743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_009349	TAC	2	6	20647	20652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_009349	AAT	2	6	20751	20756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009349	GTT	2	6	20791	20796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009349	GGA	2	6	20925	20930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009349	TCA	2	6	20945	20950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009349	CCT	2	6	21112	21117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_009349	TCT	2	6	21154	21159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_009349	AAC	2	6	21169	21174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_009349	TAC	2	6	21184	21189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_009349	TTG	2	6	21285	21290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301233
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267	NC_009349	TGA	2	6	21355	21360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301233
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278	NC_009349	GTA	2	6	21938	21943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301234
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282	NC_009349	GGA	2	6	22425	22430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301235
283	NC_009349	ACT	2	6	22556	22561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301235
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288	NC_009349	AGA	2	6	22841	22846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301235
289	NC_009349	AAT	2	6	22890	22895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145301235
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303	NC_009349	ATG	2	6	24255	24260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_009349	TGT	2	6	24320	24325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_009349	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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383	NC_009349	CGC	2	6	29960	29965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301246
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