MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	145301212
2	NC_009349	AC	3	6	1325	1330	50 %	0 %	0 %	50 %	145301212
3	NC_009349	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	145301215
4	NC_009349	AG	3	6	4095	4100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009349	AC	3	6	4877	4882	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
6	NC_009349	AG	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	145301216
7	NC_009349	AC	3	6	5135	5140	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
8	NC_009349	AC	3	6	5906	5911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009349	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	145301219
10	NC_009349	AT	3	6	8654	8659	50 %	50 %	0 %	0 %	145301220
11	NC_009349	AG	3	6	8662	8667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301220
12	NC_009349	GA	3	6	10418	10423	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
13	NC_009349	GA	3	6	10520	10525	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
14	NC_009349	AG	3	6	11560	11565	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
15	NC_009349	AT	3	6	12068	12073	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
16	NC_009349	AT	3	6	12837	12842	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
17	NC_009349	AG	3	6	13191	13196	50 %	0 %	50 %	0 %	145301224
18	NC_009349	TA	3	6	13902	13907	50 %	50 %	0 %	0 %	145301225
19	NC_009349	CG	3	6	14279	14284	0 %	0 %	50 %	50 %	145301225
20	NC_009349	CT	3	6	14363	14368	0 %	50 %	0 %	50 %	145301225
21	NC_009349	AG	3	6	14396	14401	50 %	0 %	50 %	0 %	145301225
22	NC_009349	AC	3	6	14891	14896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009349	GA	3	6	16321	16326	50 %	0 %	50 %	0 %	145301228
24	NC_009349	CA	3	6	16810	16815	50 %	0 %	0 %	50 %	145301229
25	NC_009349	CT	3	6	18332	18337	0 %	50 %	0 %	50 %	145301230
26	NC_009349	CA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	0 %	50 %	145301231
27	NC_009349	AT	3	6	19704	19709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009349	AT	3	6	20159	20164	50 %	50 %	0 %	0 %	145301232
29	NC_009349	TG	3	6	20517	20522	0 %	50 %	50 %	0 %	145301232
30	NC_009349	AC	4	8	20910	20917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009349	TC	3	6	21394	21399	0 %	50 %	0 %	50 %	145301233
32	NC_009349	CT	3	6	21762	21767	0 %	50 %	0 %	50 %	145301233
33	NC_009349	CT	3	6	22635	22640	0 %	50 %	0 %	50 %	145301235
34	NC_009349	CA	3	6	22871	22876	50 %	0 %	0 %	50 %	145301235
35	NC_009349	CA	3	6	23447	23452	50 %	0 %	0 %	50 %	145301236
36	NC_009349	CA	3	6	25200	25205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009349	CT	4	8	25337	25344	0 %	50 %	0 %	50 %	145301238
38	NC_009349	GC	3	6	26909	26914	0 %	0 %	50 %	50 %	145301242
39	NC_009349	GA	3	6	27555	27560	50 %	0 %	50 %	0 %	145301243
40	NC_009349	GT	3	6	28793	28798	0 %	50 %	50 %	0 %	145301244
41	NC_009349	CA	3	6	30669	30674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009349	GA	3	6	30821	30826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009349	CA	3	6	31082	31087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009349	GA	3	6	32023	32028	50 %	0 %	50 %	0 %	145301247
45	NC_009349	AC	3	6	32628	32633	50 %	0 %	0 %	50 %	145301247
46	NC_009349	GT	4	8	33098	33105	0 %	50 %	50 %	0 %	145301247
47	NC_009349	AT	3	6	33822	33827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009349	TC	3	6	34247	34252	0 %	50 %	0 %	50 %	145301249
49	NC_009349	GA	3	6	35710	35715	50 %	0 %	50 %	0 %	145301250
50	NC_009349	TC	3	6	37934	37939	0 %	50 %	0 %	50 %	145301254
51	NC_009349	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	145301254
52	NC_009349	TC	3	6	38844	38849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009349	GT	3	6	42716	42721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009349	TA	4	8	43222	43229	50 %	50 %	0 %	0 %	145301260
55	NC_009349	CT	3	6	43824	43829	0 %	50 %	0 %	50 %	145301260
56	NC_009349	TG	3	6	44623	44628	0 %	50 %	50 %	0 %	145301262
57	NC_009349	CT	3	6	44724	44729	0 %	50 %	0 %	50 %	145301262
58	NC_009349	GT	3	6	45013	45018	0 %	50 %	50 %	0 %	145301263
59	NC_009349	AG	3	6	46076	46081	50 %	0 %	50 %	0 %	145301264
60	NC_009349	CT	3	6	46351	46356	0 %	50 %	0 %	50 %	145301265
61	NC_009349	CT	3	6	47530	47535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009349	GA	3	6	47771	47776	50 %	0 %	50 %	0 %	145301266
63	NC_009349	AT	3	6	48043	48048	50 %	50 %	0 %	0 %	145301266
64	NC_009349	TC	3	6	48979	48984	0 %	50 %	0 %	50 %	145301268
65	NC_009349	TC	4	8	49085	49092	0 %	50 %	0 %	50 %	145301268
66	NC_009349	GT	3	6	49279	49284	0 %	50 %	50 %	0 %	145301268
67	NC_009349	GT	3	6	49853	49858	0 %	50 %	50 %	0 %	145301269
68	NC_009349	GA	3	6	50058	50063	50 %	0 %	50 %	0 %	145301270
69	NC_009349	TG	3	6	50254	50259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009349	AG	3	6	51162	51167	50 %	0 %	50 %	0 %	145301271
71	NC_009349	TG	3	6	51915	51920	0 %	50 %	50 %	0 %	145301272
72	NC_009349	CT	3	6	52806	52811	0 %	50 %	0 %	50 %	145301272
73	NC_009349	AG	3	6	53213	53218	50 %	0 %	50 %	0 %	145301272
74	NC_009349	TG	3	6	56306	56311	0 %	50 %	50 %	0 %	145301273
75	NC_009349	CG	3	6	57351	57356	0 %	0 %	50 %	50 %	145301274
76	NC_009349	AG	3	6	57401	57406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009349	TG	3	6	57538	57543	0 %	50 %	50 %	0 %	145301275
78	NC_009349	AT	3	6	58525	58530	50 %	50 %	0 %	0 %	145301275
79	NC_009349	CA	3	6	59125	59130	50 %	0 %	0 %	50 %	145301276
80	NC_009349	CT	3	6	59224	59229	0 %	50 %	0 %	50 %	145301276
81	NC_009349	GA	3	6	59821	59826	50 %	0 %	50 %	0 %	145301277
82	NC_009349	CT	3	6	59992	59997	0 %	50 %	0 %	50 %	145301277
83	NC_009349	GA	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	145301278
84	NC_009349	AT	3	6	61007	61012	50 %	50 %	0 %	0 %	145301278
85	NC_009349	AC	3	6	61035	61040	50 %	0 %	0 %	50 %	145301278
86	NC_009349	AG	3	6	62604	62609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009349	AG	4	8	62614	62621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009349	CT	3	6	62698	62703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009349	TA	3	6	62720	62725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009349	CT	3	6	62747	62752	0 %	50 %	0 %	50 %	145301279
91	NC_009349	GA	3	6	64137	64142	50 %	0 %	50 %	0 %	145301280
92	NC_009349	CA	3	6	65636	65641	50 %	0 %	0 %	50 %	145301281
93	NC_009349	CT	3	6	67237	67242	0 %	50 %	0 %	50 %	145301282
94	NC_009349	CA	3	6	68499	68504	50 %	0 %	0 %	50 %	145301282
95	NC_009349	TC	3	6	68646	68651	0 %	50 %	0 %	50 %	145301282
96	NC_009349	CA	3	6	69023	69028	50 %	0 %	0 %	50 %	145301283
97	NC_009349	GT	3	6	69039	69044	0 %	50 %	50 %	0 %	145301283
98	NC_009349	GA	4	8	69950	69957	50 %	0 %	50 %	0 %	145301284
99	NC_009349	CA	3	6	69986	69991	50 %	0 %	0 %	50 %	145301284
100	NC_009349	GA	3	6	70777	70782	50 %	0 %	50 %	0 %	145301284
101	NC_009349	CA	3	6	70983	70988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009349	AG	4	8	71030	71037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009349	CT	4	8	71052	71059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009349	CT	3	6	71093	71098	0 %	50 %	0 %	50 %	145301285
105	NC_009349	GA	3	6	71801	71806	50 %	0 %	50 %	0 %	145301286
106	NC_009349	TC	3	6	71876	71881	0 %	50 %	0 %	50 %	145301286
107	NC_009349	CT	3	6	71956	71961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009349	GA	3	6	74985	74990	50 %	0 %	50 %	0 %	145301289
109	NC_009349	CA	3	6	75098	75103	50 %	0 %	0 %	50 %	145301289
110	NC_009349	CG	4	8	76489	76496	0 %	0 %	50 %	50 %	145301290
111	NC_009349	TG	3	6	77874	77879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009349	GT	3	6	78097	78102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009349	AG	3	6	78127	78132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009349	TA	3	6	78995	79000	50 %	50 %	0 %	0 %	145301292
115	NC_009349	TG	4	8	79394	79401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009349	CT	3	6	79957	79962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009349	CT	3	6	80265	80270	0 %	50 %	0 %	50 %	145301294
118	NC_009349	AC	3	6	81301	81306	50 %	0 %	0 %	50 %	145301294
119	NC_009349	GC	3	6	82273	82278	0 %	0 %	50 %	50 %	145301295
120	NC_009349	GC	3	6	82919	82924	0 %	0 %	50 %	50 %	145301296
121	NC_009349	GC	3	6	83368	83373	0 %	0 %	50 %	50 %	145301298
122	NC_009349	TG	3	6	84225	84230	0 %	50 %	50 %	0 %	145301299
123	NC_009349	AC	3	6	84791	84796	50 %	0 %	0 %	50 %	145301299
124	NC_009349	GC	3	6	84872	84877	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
125	NC_009349	CG	3	6	84903	84908	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
126	NC_009349	AC	3	6	84913	84918	50 %	0 %	0 %	50 %	145301299
127	NC_009349	CG	4	8	85240	85247	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
128	NC_009349	CG	3	6	85264	85269	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
129	NC_009349	GC	3	6	85678	85683	0 %	0 %	50 %	50 %	145301300
130	NC_009349	CG	3	6	85805	85810	0 %	0 %	50 %	50 %	145301300
131	NC_009349	GC	3	6	86091	86096	0 %	0 %	50 %	50 %	145301301
132	NC_009349	GC	3	6	86166	86171	0 %	0 %	50 %	50 %	145301302
133	NC_009349	GC	3	6	86564	86569	0 %	0 %	50 %	50 %	145301302
134	NC_009349	GC	3	6	86963	86968	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
135	NC_009349	GC	3	6	87293	87298	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
136	NC_009349	CG	3	6	87997	88002	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
137	NC_009349	CG	3	6	88206	88211	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
138	NC_009349	GC	3	6	88407	88412	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
139	NC_009349	CG	3	6	88694	88699	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
140	NC_009349	GC	3	6	88937	88942	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
141	NC_009349	CG	3	6	89138	89143	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
142	NC_009349	CG	3	6	89677	89682	0 %	0 %	50 %	50 %	145301305
143	NC_009349	CG	3	6	89905	89910	0 %	0 %	50 %	50 %	145301305
144	NC_009349	AT	3	6	91342	91347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009349	GC	3	6	91568	91573	0 %	0 %	50 %	50 %	145301308
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.