MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	CT	3	6	289	294	0 %	50 %	0 %	50 %	145301212
2	NC_009349	AC	3	6	1325	1330	50 %	0 %	0 %	50 %	145301212
3	NC_009349	AT	3	6	3421	3426	50 %	50 %	0 %	0 %	145301215
4	NC_009349	AC	3	6	4877	4882	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
5	NC_009349	AG	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	145301216
6	NC_009349	AC	3	6	5135	5140	50 %	0 %	0 %	50 %	145301216
7	NC_009349	GC	3	6	7456	7461	0 %	0 %	50 %	50 %	145301219
8	NC_009349	AT	3	6	8654	8659	50 %	50 %	0 %	0 %	145301220
9	NC_009349	AG	3	6	8662	8667	50 %	0 %	50 %	0 %	145301220
10	NC_009349	GA	3	6	10418	10423	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
11	NC_009349	GA	3	6	10520	10525	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
12	NC_009349	AG	3	6	11560	11565	50 %	0 %	50 %	0 %	145301223
13	NC_009349	AT	3	6	12068	12073	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
14	NC_009349	AT	3	6	12837	12842	50 %	50 %	0 %	0 %	145301224
15	NC_009349	AG	3	6	13191	13196	50 %	0 %	50 %	0 %	145301224
16	NC_009349	TA	3	6	13902	13907	50 %	50 %	0 %	0 %	145301225
17	NC_009349	CG	3	6	14279	14284	0 %	0 %	50 %	50 %	145301225
18	NC_009349	CT	3	6	14363	14368	0 %	50 %	0 %	50 %	145301225
19	NC_009349	AG	3	6	14396	14401	50 %	0 %	50 %	0 %	145301225
20	NC_009349	GA	3	6	16321	16326	50 %	0 %	50 %	0 %	145301228
21	NC_009349	CA	3	6	16810	16815	50 %	0 %	0 %	50 %	145301229
22	NC_009349	CT	3	6	18332	18337	0 %	50 %	0 %	50 %	145301230
23	NC_009349	CA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	0 %	50 %	145301231
24	NC_009349	AT	3	6	20159	20164	50 %	50 %	0 %	0 %	145301232
25	NC_009349	TG	3	6	20517	20522	0 %	50 %	50 %	0 %	145301232
26	NC_009349	TC	3	6	21394	21399	0 %	50 %	0 %	50 %	145301233
27	NC_009349	CT	3	6	21762	21767	0 %	50 %	0 %	50 %	145301233
28	NC_009349	CT	3	6	22635	22640	0 %	50 %	0 %	50 %	145301235
29	NC_009349	CA	3	6	22871	22876	50 %	0 %	0 %	50 %	145301235
30	NC_009349	CA	3	6	23447	23452	50 %	0 %	0 %	50 %	145301236
31	NC_009349	CT	4	8	25337	25344	0 %	50 %	0 %	50 %	145301238
32	NC_009349	GC	3	6	26909	26914	0 %	0 %	50 %	50 %	145301242
33	NC_009349	GA	3	6	27555	27560	50 %	0 %	50 %	0 %	145301243
34	NC_009349	GT	3	6	28793	28798	0 %	50 %	50 %	0 %	145301244
35	NC_009349	GA	3	6	32023	32028	50 %	0 %	50 %	0 %	145301247
36	NC_009349	AC	3	6	32628	32633	50 %	0 %	0 %	50 %	145301247
37	NC_009349	GT	4	8	33098	33105	0 %	50 %	50 %	0 %	145301247
38	NC_009349	TC	3	6	34247	34252	0 %	50 %	0 %	50 %	145301249
39	NC_009349	GA	3	6	35710	35715	50 %	0 %	50 %	0 %	145301250
40	NC_009349	TC	3	6	37934	37939	0 %	50 %	0 %	50 %	145301254
41	NC_009349	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	145301254
42	NC_009349	TA	4	8	43222	43229	50 %	50 %	0 %	0 %	145301260
43	NC_009349	CT	3	6	43824	43829	0 %	50 %	0 %	50 %	145301260
44	NC_009349	TG	3	6	44623	44628	0 %	50 %	50 %	0 %	145301262
45	NC_009349	CT	3	6	44724	44729	0 %	50 %	0 %	50 %	145301262
46	NC_009349	GT	3	6	45013	45018	0 %	50 %	50 %	0 %	145301263
47	NC_009349	AG	3	6	46076	46081	50 %	0 %	50 %	0 %	145301264
48	NC_009349	CT	3	6	46351	46356	0 %	50 %	0 %	50 %	145301265
49	NC_009349	GA	3	6	47771	47776	50 %	0 %	50 %	0 %	145301266
50	NC_009349	AT	3	6	48043	48048	50 %	50 %	0 %	0 %	145301266
51	NC_009349	TC	3	6	48979	48984	0 %	50 %	0 %	50 %	145301268
52	NC_009349	TC	4	8	49085	49092	0 %	50 %	0 %	50 %	145301268
53	NC_009349	GT	3	6	49279	49284	0 %	50 %	50 %	0 %	145301268
54	NC_009349	GT	3	6	49853	49858	0 %	50 %	50 %	0 %	145301269
55	NC_009349	GA	3	6	50058	50063	50 %	0 %	50 %	0 %	145301270
56	NC_009349	AG	3	6	51162	51167	50 %	0 %	50 %	0 %	145301271
57	NC_009349	TG	3	6	51915	51920	0 %	50 %	50 %	0 %	145301272
58	NC_009349	CT	3	6	52806	52811	0 %	50 %	0 %	50 %	145301272
59	NC_009349	AG	3	6	53213	53218	50 %	0 %	50 %	0 %	145301272
60	NC_009349	TG	3	6	56306	56311	0 %	50 %	50 %	0 %	145301273
61	NC_009349	CG	3	6	57351	57356	0 %	0 %	50 %	50 %	145301274
62	NC_009349	TG	3	6	57538	57543	0 %	50 %	50 %	0 %	145301275
63	NC_009349	AT	3	6	58525	58530	50 %	50 %	0 %	0 %	145301275
64	NC_009349	CA	3	6	59125	59130	50 %	0 %	0 %	50 %	145301276
65	NC_009349	CT	3	6	59224	59229	0 %	50 %	0 %	50 %	145301276
66	NC_009349	GA	3	6	59821	59826	50 %	0 %	50 %	0 %	145301277
67	NC_009349	CT	3	6	59992	59997	0 %	50 %	0 %	50 %	145301277
68	NC_009349	GA	3	6	60713	60718	50 %	0 %	50 %	0 %	145301278
69	NC_009349	AT	3	6	61007	61012	50 %	50 %	0 %	0 %	145301278
70	NC_009349	AC	3	6	61035	61040	50 %	0 %	0 %	50 %	145301278
71	NC_009349	CT	3	6	62747	62752	0 %	50 %	0 %	50 %	145301279
72	NC_009349	GA	3	6	64137	64142	50 %	0 %	50 %	0 %	145301280
73	NC_009349	CA	3	6	65636	65641	50 %	0 %	0 %	50 %	145301281
74	NC_009349	CT	3	6	67237	67242	0 %	50 %	0 %	50 %	145301282
75	NC_009349	CA	3	6	68499	68504	50 %	0 %	0 %	50 %	145301282
76	NC_009349	TC	3	6	68646	68651	0 %	50 %	0 %	50 %	145301282
77	NC_009349	CA	3	6	69023	69028	50 %	0 %	0 %	50 %	145301283
78	NC_009349	GT	3	6	69039	69044	0 %	50 %	50 %	0 %	145301283
79	NC_009349	GA	4	8	69950	69957	50 %	0 %	50 %	0 %	145301284
80	NC_009349	CA	3	6	69986	69991	50 %	0 %	0 %	50 %	145301284
81	NC_009349	GA	3	6	70777	70782	50 %	0 %	50 %	0 %	145301284
82	NC_009349	CT	3	6	71093	71098	0 %	50 %	0 %	50 %	145301285
83	NC_009349	GA	3	6	71801	71806	50 %	0 %	50 %	0 %	145301286
84	NC_009349	TC	3	6	71876	71881	0 %	50 %	0 %	50 %	145301286
85	NC_009349	GA	3	6	74985	74990	50 %	0 %	50 %	0 %	145301289
86	NC_009349	CA	3	6	75098	75103	50 %	0 %	0 %	50 %	145301289
87	NC_009349	CG	4	8	76489	76496	0 %	0 %	50 %	50 %	145301290
88	NC_009349	TA	3	6	78995	79000	50 %	50 %	0 %	0 %	145301292
89	NC_009349	CT	3	6	80265	80270	0 %	50 %	0 %	50 %	145301294
90	NC_009349	AC	3	6	81301	81306	50 %	0 %	0 %	50 %	145301294
91	NC_009349	GC	3	6	82273	82278	0 %	0 %	50 %	50 %	145301295
92	NC_009349	GC	3	6	82919	82924	0 %	0 %	50 %	50 %	145301296
93	NC_009349	GC	3	6	83368	83373	0 %	0 %	50 %	50 %	145301298
94	NC_009349	TG	3	6	84225	84230	0 %	50 %	50 %	0 %	145301299
95	NC_009349	AC	3	6	84791	84796	50 %	0 %	0 %	50 %	145301299
96	NC_009349	GC	3	6	84872	84877	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
97	NC_009349	CG	3	6	84903	84908	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
98	NC_009349	AC	3	6	84913	84918	50 %	0 %	0 %	50 %	145301299
99	NC_009349	CG	4	8	85240	85247	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
100	NC_009349	CG	3	6	85264	85269	0 %	0 %	50 %	50 %	145301299
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102	NC_009349	CG	3	6	85805	85810	0 %	0 %	50 %	50 %	145301300
103	NC_009349	GC	3	6	86091	86096	0 %	0 %	50 %	50 %	145301301
104	NC_009349	GC	3	6	86166	86171	0 %	0 %	50 %	50 %	145301302
105	NC_009349	GC	3	6	86564	86569	0 %	0 %	50 %	50 %	145301302
106	NC_009349	GC	3	6	86963	86968	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
107	NC_009349	GC	3	6	87293	87298	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
108	NC_009349	CG	3	6	87997	88002	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
109	NC_009349	CG	3	6	88206	88211	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
110	NC_009349	GC	3	6	88407	88412	0 %	0 %	50 %	50 %	145301303
111	NC_009349	CG	3	6	88694	88699	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
112	NC_009349	GC	3	6	88937	88942	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
113	NC_009349	CG	3	6	89138	89143	0 %	0 %	50 %	50 %	145301304
114	NC_009349	CG	3	6	89677	89682	0 %	0 %	50 %	50 %	145301305
115	NC_009349	CG	3	6	89905	89910	0 %	0 %	50 %	50 %	145301305
116	NC_009349	GC	3	6	91568	91573	0 %	0 %	50 %	50 %	145301308
117	NC_009349	CT	3	6	92057	92062	0 %	50 %	0 %	50 %	145301308
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120	NC_009349	CG	3	6	96261	96266	0 %	0 %	50 %	50 %	145301311
121	NC_009349	GC	3	6	96373	96378	0 %	0 %	50 %	50 %	145301311
122	NC_009349	GC	3	6	97490	97495	0 %	0 %	50 %	50 %	145301313
123	NC_009349	GC	3	6	97645	97650	0 %	0 %	50 %	50 %	145301313
124	NC_009349	GC	3	6	99233	99238	0 %	0 %	50 %	50 %	145301314
125	NC_009349	GC	3	6	100504	100509	0 %	0 %	50 %	50 %	145301314
126	NC_009349	GT	3	6	102389	102394	0 %	50 %	50 %	0 %	145301315
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128	NC_009349	CA	3	6	103256	103261	50 %	0 %	0 %	50 %	145301317
129	NC_009349	AC	3	6	103262	103267	50 %	0 %	0 %	50 %	145301317
130	NC_009349	AG	3	6	105022	105027	50 %	0 %	50 %	0 %	145301319
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132	NC_009349	CT	3	6	106821	106826	0 %	50 %	0 %	50 %	145301321
133	NC_009349	TA	3	6	107414	107419	50 %	50 %	0 %	0 %	145301322
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139	NC_009349	CA	3	6	113004	113009	50 %	0 %	0 %	50 %	145301329
140	NC_009349	GA	3	6	113380	113385	50 %	0 %	50 %	0 %	145301330
141	NC_009349	AC	3	6	113749	113754	50 %	0 %	0 %	50 %	145301330
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.