MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 4

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009349	G	7	7	3704	3710	0 %	0 %	100 %	0 %	145301215
2	NC_009349	T	7	7	4143	4149	0 %	100 %	0 %	0 %	145301216
3	NC_009349	A	6	6	7391	7396	100 %	0 %	0 %	0 %	145301219
4	NC_009349	C	6	6	8856	8861	0 %	0 %	0 %	100 %	145301220
5	NC_009349	G	7	7	9372	9378	0 %	0 %	100 %	0 %	145301221
6	NC_009349	C	6	6	9641	9646	0 %	0 %	0 %	100 %	145301221
7	NC_009349	T	6	6	10869	10874	0 %	100 %	0 %	0 %	145301223
8	NC_009349	T	6	6	12459	12464	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
9	NC_009349	T	6	6	12527	12532	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
10	NC_009349	T	6	6	12951	12956	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
11	NC_009349	T	6	6	13452	13457	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
12	NC_009349	A	6	6	13698	13703	100 %	0 %	0 %	0 %	145301224
13	NC_009349	T	6	6	13792	13797	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
14	NC_009349	T	6	6	13811	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	145301224
15	NC_009349	T	6	6	14069	14074	0 %	100 %	0 %	0 %	145301225
16	NC_009349	A	6	6	14312	14317	100 %	0 %	0 %	0 %	145301225
17	NC_009349	A	7	7	14481	14487	100 %	0 %	0 %	0 %	145301225
18	NC_009349	T	6	6	14935	14940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009349	A	6	6	15011	15016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009349	G	6	6	15328	15333	0 %	0 %	100 %	0 %	145301226
21	NC_009349	T	7	7	15786	15792	0 %	100 %	0 %	0 %	145301227
22	NC_009349	T	6	6	16407	16412	0 %	100 %	0 %	0 %	145301228
23	NC_009349	T	6	6	17043	17048	0 %	100 %	0 %	0 %	145301229
24	NC_009349	A	6	6	17112	17117	100 %	0 %	0 %	0 %	145301229
25	NC_009349	C	6	6	17440	17445	0 %	0 %	0 %	100 %	145301229
26	NC_009349	T	7	7	18537	18543	0 %	100 %	0 %	0 %	145301230
27	NC_009349	T	6	6	19139	19144	0 %	100 %	0 %	0 %	145301231
28	NC_009349	A	6	6	19330	19335	100 %	0 %	0 %	0 %	145301231
29	NC_009349	T	6	6	19445	19450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009349	A	6	6	19787	19792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009349	A	9	9	20877	20885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009349	C	6	6	21219	21224	0 %	0 %	0 %	100 %	145301233
33	NC_009349	T	6	6	21550	21555	0 %	100 %	0 %	0 %	145301233
34	NC_009349	A	6	6	21834	21839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009349	T	6	6	22949	22954	0 %	100 %	0 %	0 %	145301235
36	NC_009349	A	6	6	23961	23966	100 %	0 %	0 %	0 %	145301236
37	NC_009349	T	6	6	24303	24308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009349	C	6	6	24772	24777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_009349	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009349	A	6	6	26084	26089	100 %	0 %	0 %	0 %	145301239
41	NC_009349	T	6	6	28111	28116	0 %	100 %	0 %	0 %	145301243
42	NC_009349	T	8	8	29593	29600	0 %	100 %	0 %	0 %	145301245
43	NC_009349	C	6	6	29808	29813	0 %	0 %	0 %	100 %	145301246
44	NC_009349	T	6	6	30238	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009349	T	7	7	30701	30707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009349	T	6	6	31091	31096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009349	A	7	7	33951	33957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009349	C	6	6	35905	35910	0 %	0 %	0 %	100 %	145301251
49	NC_009349	C	6	6	36089	36094	0 %	0 %	0 %	100 %	145301251
50	NC_009349	C	6	6	37148	37153	0 %	0 %	0 %	100 %	145301252
51	NC_009349	T	6	6	40818	40823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009349	C	6	6	40983	40988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_009349	C	6	6	41021	41026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_009349	C	6	6	41059	41064	0 %	0 %	0 %	100 %	145301257
55	NC_009349	C	6	6	41097	41102	0 %	0 %	0 %	100 %	145301257
56	NC_009349	C	6	6	41135	41140	0 %	0 %	0 %	100 %	145301257
57	NC_009349	C	6	6	41173	41178	0 %	0 %	0 %	100 %	145301257
58	NC_009349	A	7	7	41248	41254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009349	G	6	6	42033	42038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009349	G	8	8	42423	42430	0 %	0 %	100 %	0 %	145301259
61	NC_009349	G	6	6	42783	42788	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009349	T	6	6	43349	43354	0 %	100 %	0 %	0 %	145301260
63	NC_009349	A	6	6	43395	43400	100 %	0 %	0 %	0 %	145301260
64	NC_009349	A	6	6	44479	44484	100 %	0 %	0 %	0 %	145301262
65	NC_009349	T	7	7	45006	45012	0 %	100 %	0 %	0 %	145301263
66	NC_009349	T	6	6	45048	45053	0 %	100 %	0 %	0 %	145301263
67	NC_009349	T	6	6	45056	45061	0 %	100 %	0 %	0 %	145301263
68	NC_009349	A	7	7	45162	45168	100 %	0 %	0 %	0 %	145301263
69	NC_009349	G	7	7	45367	45373	0 %	0 %	100 %	0 %	145301264
70	NC_009349	A	8	8	47712	47719	100 %	0 %	0 %	0 %	145301266
71	NC_009349	A	7	7	47907	47913	100 %	0 %	0 %	0 %	145301266
72	NC_009349	A	6	6	47952	47957	100 %	0 %	0 %	0 %	145301266
73	NC_009349	T	7	7	48805	48811	0 %	100 %	0 %	0 %	145301268
74	NC_009349	T	7	7	49625	49631	0 %	100 %	0 %	0 %	145301269
75	NC_009349	T	8	8	50134	50141	0 %	100 %	0 %	0 %	145301270
76	NC_009349	T	6	6	50293	50298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009349	A	6	6	50609	50614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009349	A	7	7	50792	50798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009349	A	9	9	51285	51293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009349	G	6	6	52092	52097	0 %	0 %	100 %	0 %	145301272
81	NC_009349	A	6	6	54650	54655	100 %	0 %	0 %	0 %	145301272
82	NC_009349	G	7	7	57132	57138	0 %	0 %	100 %	0 %	145301274
83	NC_009349	T	6	6	57188	57193	0 %	100 %	0 %	0 %	145301274
84	NC_009349	A	6	6	57443	57448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009349	T	6	6	57909	57914	0 %	100 %	0 %	0 %	145301275
86	NC_009349	T	7	7	59276	59282	0 %	100 %	0 %	0 %	145301277
87	NC_009349	A	6	6	60718	60723	100 %	0 %	0 %	0 %	145301278
88	NC_009349	C	6	6	64070	64075	0 %	0 %	0 %	100 %	145301280
89	NC_009349	C	6	6	64425	64430	0 %	0 %	0 %	100 %	145301280
90	NC_009349	T	6	6	64815	64820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009349	T	6	6	65918	65923	0 %	100 %	0 %	0 %	145301281
92	NC_009349	G	7	7	68394	68400	0 %	0 %	100 %	0 %	145301282
93	NC_009349	G	6	6	68976	68981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009349	C	6	6	69550	69555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_009349	T	6	6	70472	70477	0 %	100 %	0 %	0 %	145301284
96	NC_009349	T	6	6	71010	71015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009349	C	6	6	73166	73171	0 %	0 %	0 %	100 %	145301288
98	NC_009349	C	6	6	75419	75424	0 %	0 %	0 %	100 %	145301289
99	NC_009349	T	6	6	78452	78457	0 %	100 %	0 %	0 %	145301292
100	NC_009349	A	6	6	80019	80024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009349	A	7	7	92419	92425	100 %	0 %	0 %	0 %	145301308
102	NC_009349	A	6	6	94674	94679	100 %	0 %	0 %	0 %	145301309
103	NC_009349	T	7	7	94802	94808	0 %	100 %	0 %	0 %	145301309
104	NC_009349	A	6	6	95035	95040	100 %	0 %	0 %	0 %	145301309
105	NC_009349	T	7	7	95132	95138	0 %	100 %	0 %	0 %	145301309
106	NC_009349	T	7	7	101907	101913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009349	C	6	6	102055	102060	0 %	0 %	0 %	100 %	145301315
108	NC_009349	A	6	6	102877	102882	100 %	0 %	0 %	0 %	145301316
109	NC_009349	A	7	7	102954	102960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009349	A	6	6	103082	103087	100 %	0 %	0 %	0 %	145301317
111	NC_009349	T	7	7	103303	103309	0 %	100 %	0 %	0 %	145301317
112	NC_009349	A	7	7	104604	104610	100 %	0 %	0 %	0 %	145301318
113	NC_009349	A	6	6	107537	107542	100 %	0 %	0 %	0 %	145301322
114	NC_009349	A	6	6	107896	107901	100 %	0 %	0 %	0 %	145301323
115	NC_009349	T	6	6	108022	108027	0 %	100 %	0 %	0 %	145301323
116	NC_009349	A	6	6	108156	108161	100 %	0 %	0 %	0 %	145301323
117	NC_009349	A	6	6	108590	108595	100 %	0 %	0 %	0 %	145301323
118	NC_009349	C	10	10	108837	108846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_009349	A	6	6	109486	109491	100 %	0 %	0 %	0 %	145301324
120	NC_009349	T	6	6	110195	110200	0 %	100 %	0 %	0 %	145301325
121	NC_009349	C	6	6	111324	111329	0 %	0 %	0 %	100 %	145301327
122	NC_009349	T	6	6	111340	111345	0 %	100 %	0 %	0 %	145301327
123	NC_009349	A	7	7	111607	111613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009349	A	6	6	111743	111748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009349	A	6	6	111802	111807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009349	A	7	7	112302	112308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009349	T	7	7	112368	112374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009349	C	6	6	112761	112766	0 %	0 %	0 %	100 %	145301328
129	NC_009349	C	6	6	114197	114202	0 %	0 %	0 %	100 %	145301330
130	NC_009349	C	6	6	114782	114787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_009349	A	6	6	114874	114879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009349	T	6	6	115304	115309	0 %	100 %	0 %	0 %	145301331
133	NC_009349	A	6	6	115440	115445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009349	G	7	7	117809	117815	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009349	A	8	8	117967	117974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009349	T	6	6	121179	121184	0 %	100 %	0 %	0 %	145301338
137	NC_009349	A	6	6	121640	121645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009349	C	6	6	121768	121773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_009349	G	6	6	121935	121940	0 %	0 %	100 %	0 %	145301339
140	NC_009349	T	7	7	122657	122663	0 %	100 %	0 %	0 %	145301340
141	NC_009349	C	6	6	126240	126245	0 %	0 %	0 %	100 %	145301346
142	NC_009349	T	7	7	127669	127675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009349	A	6	6	128184	128189	100 %	0 %	0 %	0 %	145301349
144	NC_009349	T	6	6	129435	129440	0 %	100 %	0 %	0 %	145301350
145	NC_009349	C	6	6	130417	130422	0 %	0 %	0 %	100 %	145301352
146	NC_009349	T	6	6	130807	130812	0 %	100 %	0 %	0 %	145301352
147	NC_009349	A	6	6	130973	130978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009349	C	6	6	132318	132323	0 %	0 %	0 %	100 %	145301355
149	NC_009349	T	6	6	132352	132357	0 %	100 %	0 %	0 %	145301355
150	NC_009349	T	7	7	135720	135726	0 %	100 %	0 %	0 %	145301357
151	NC_009349	G	7	7	135751	135757	0 %	0 %	100 %	0 %	145301357
152	NC_009349	A	7	7	135939	135945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009349	G	6	6	138074	138079	0 %	0 %	100 %	0 %	145301359
154	NC_009349	T	6	6	138927	138932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009349	A	6	6	138984	138989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009349	A	6	6	140678	140683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009349	C	9	9	140707	140715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
158	NC_009349	T	6	6	140738	140743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009349	T	8	8	141078	141085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009349	C	7	7	141218	141224	0 %	0 %	0 %	100 %	145301364
161	NC_009349	G	7	7	142970	142976	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009349	A	6	6	143474	143479	100 %	0 %	0 %	0 %	145301366
163	NC_009349	T	6	6	144019	144024	0 %	100 %	0 %	0 %	145301366
164	NC_009349	A	6	6	144299	144304	100 %	0 %	0 %	0 %	145301366
165	NC_009349	T	6	6	145343	145348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_009349	G	8	8	145573	145580	0 %	0 %	100 %	0 %	145301369
167	NC_009349	G	12	12	146553	146564	0 %	0 %	100 %	0 %	145301369
168	NC_009349	C	6	6	147069	147074	0 %	0 %	0 %	100 %	145301369
169	NC_009349	A	6	6	148527	148532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009349	T	6	6	148547	148552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009349	T	6	6	149649	149654	0 %	100 %	0 %	0 %	145301372
172	NC_009349	C	10	10	149915	149924	0 %	0 %	0 %	100 %	145301373
173	NC_009349	T	6	6	151735	151740	0 %	100 %	0 %	0 %	145301374
174	NC_009349	T	8	8	152857	152864	0 %	100 %	0 %	0 %	145301375
175	NC_009349	C	6	6	152920	152925	0 %	0 %	0 %	100 %	145301375
176	NC_009349	T	7	7	153698	153704	0 %	100 %	0 %	0 %	145301375
177	NC_009349	G	6	6	156171	156176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009349	A	6	6	157825	157830	100 %	0 %	0 %	0 %	145301377
179	NC_009349	A	6	6	157928	157933	100 %	0 %	0 %	0 %	145301377
180	NC_009349	G	6	6	159461	159466	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
181	NC_009349	G	6	6	160158	160163	0 %	0 %	100 %	0 %	145301380
182	NC_009349	A	7	7	160311	160317	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
183	NC_009349	A	7	7	161074	161080	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
184	NC_009349	A	8	8	161175	161182	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
185	NC_009349	T	6	6	161210	161215	0 %	100 %	0 %	0 %	145301380
186	NC_009349	A	6	6	161868	161873	100 %	0 %	0 %	0 %	145301380
187	NC_009349	T	6	6	164233	164238	0 %	100 %	0 %	0 %	145301382
188	NC_009349	A	8	8	165345	165352	100 %	0 %	0 %	0 %	145301382
189	NC_009349	G	6	6	165943	165948	0 %	0 %	100 %	0 %	145301383
190	NC_009349	C	6	6	166106	166111	0 %	0 %	0 %	100 %	145301383
191	NC_009349	C	6	6	166134	166139	0 %	0 %	0 %	100 %	145301383

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.