MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009348	TGCTGG	2	12	14531	14542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009348	GGATTG	2	12	14744	14755	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009348	ATCGAT	2	12	49732	49743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009348	GAGCAG	2	12	49894	49905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009348	CAGTGC	2	12	51015	51026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009348	CTTCCC	2	12	55402	55413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009348	ATTCGA	2	12	55783	55794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009348	GAGACG	2	12	64101	64112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009348	TTGACC	2	12	68472	68483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009348	TGAGGG	2	12	68635	68646	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009348	GCTCCA	2	12	171679	171690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009348	CGAGTT	2	12	224488	224499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009348	GGTGCT	2	12	224668	224679	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009348	CCCTAT	2	12	234413	234424	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009348	CTTTTT	2	12	312245	312256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009348	CTGGAT	2	12	337257	337268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009348	CTCCTG	2	12	337843	337854	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009348	ATTTTT	2	12	358455	358466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009348	CGGGTT	2	12	365290	365301	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009348	TTCAGG	2	12	382653	382664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009348	TCCAAC	2	12	387495	387506	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009348	GATACC	3	18	412883	412900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009348	ATCGCC	2	12	437754	437765	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009348	GGCGCG	2	12	465439	465450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009348	TTTTCG	2	12	568861	568872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009348	GCTGGC	2	12	609079	609090	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009348	GTGCCC	2	12	628974	628985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009348	CTGCCG	2	12	629166	629177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009348	AGTCTG	2	12	634525	634536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009348	TGACGG	2	12	676059	676070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009348	TTGAAA	2	12	686718	686729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009348	GCGGGG	2	12	752498	752509	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009348	CGAAGA	2	12	770506	770517	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009348	CAGCGA	2	12	842250	842261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009348	AGGGTG	2	12	869213	869224	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009348	ATCCTC	2	12	874614	874625	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009348	TTTTGT	3	18	874888	874905	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009348	CCGAGC	2	12	876975	876986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009348	CAGGTG	2	12	877959	877970	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009348	TGACCA	2	12	912331	912342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009348	ATGCTG	2	12	912615	912626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009348	TGCCAC	4	24	945425	945448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009348	TTGCCG	2	12	953423	953434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009348	CTCGGC	2	12	961175	961186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009348	CCCAGC	2	12	963838	963849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009348	TAGGCA	2	12	988282	988293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009348	AAGTGC	2	12	1025673	1025684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009348	GCGGTG	2	12	1026379	1026390	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009348	CAAAGG	2	12	1027091	1027102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009348	TGATGC	7	42	1027677	1027718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009348	CTGTTC	2	12	1066262	1066273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009348	AGCTAA	2	12	1081571	1081582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009348	ATCTGT	2	12	1082442	1082453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009348	GTATGG	2	12	1108778	1108789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009348	GTTCCT	2	12	1125770	1125781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009348	AGAAAA	2	12	1154230	1154241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009348	GACCGC	2	12	1236872	1236883	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009348	TTGAGC	2	12	1238917	1238928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009348	GTGCTG	2	12	1277836	1277847	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009348	CGAAAA	2	12	1303834	1303845	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009348	GAGGTC	2	12	1353294	1353305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009348	GCCCTG	2	12	1367980	1367991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009348	GGGGCC	2	12	1379204	1379215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009348	AAGGTT	2	12	1474782	1474793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009348	CATATG	2	12	1480574	1480585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009348	TGAAAG	2	12	1511602	1511613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009348	TGTCTG	2	12	1530041	1530052	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009348	TAGAGG	2	12	1530167	1530178	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009348	TCGGCA	2	12	1530395	1530406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009348	GGCCGA	2	12	1539461	1539472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009348	GGTCAG	2	12	1543573	1543584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009348	GCATGG	2	12	1544498	1544509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009348	GCTGCG	2	12	1583139	1583150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009348	TTTTTG	2	12	1635670	1635681	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009348	GCCCAG	2	12	1675915	1675926	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009348	GGCGCG	2	12	1678132	1678143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009348	CAAGGA	2	12	1684639	1684650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009348	CAGCAT	2	12	1687125	1687136	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009348	CAGGCA	2	12	1706697	1706708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009348	ATTGTT	2	12	1790107	1790118	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009348	GCTGTG	2	12	1890347	1890358	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009348	TTATGT	2	12	1901497	1901508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009348	ATCATT	2	12	1927998	1928009	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009348	TGCCGC	2	12	1945549	1945560	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009348	ACGTAA	2	12	1956592	1956603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009348	CCTGAA	2	12	1979972	1979983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009348	CAAAAA	2	12	1989833	1989844	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009348	CGTAAA	2	12	2031572	2031583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009348	CTGGCG	2	12	2034403	2034414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009348	ACGGCA	2	12	2049237	2049248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009348	GTGACG	2	12	2136558	2136569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009348	GTGACG	2	12	2146933	2146944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_009348	AGTTGC	2	12	2169912	2169923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009348	ATCGGC	2	12	2172052	2172063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009348	AGCGAA	2	12	2217167	2217178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009348	TGCTCC	2	12	2268379	2268390	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009348	CGCAGG	2	12	2274654	2274665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009348	AATAAC	2	12	2304264	2304275	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009348	CCCAGT	2	12	2334927	2334938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009348	GAAGGA	2	12	2335617	2335628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009348	GCTGGT	2	12	2335974	2335985	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009348	AGCCAG	2	12	2346500	2346511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009348	CCTCAC	2	12	2353503	2353514	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_009348	GCGCCA	2	12	2356264	2356275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009348	TTCGAC	2	12	2375736	2375747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009348	CTATCA	2	12	2380856	2380867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009348	CGCCAT	2	12	2381390	2381401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009348	TGCCCC	2	12	2389628	2389639	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009348	AGCACC	2	12	2411894	2411905	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009348	CATACA	2	12	2420407	2420418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009348	ACGTAA	2	12	2430807	2430818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009348	ATTTCA	2	12	2445534	2445545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009348	TCATAT	2	12	2497232	2497243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009348	CCCCTG	2	12	2504935	2504946	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009348	GCCCTG	2	12	2511979	2511990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009348	CAGATA	2	12	2528957	2528968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009348	CAGCGG	2	12	2539901	2539912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009348	ACTCAC	2	12	2540883	2540894	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009348	AACCAG	2	12	2542222	2542233	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009348	GCCATG	2	12	2543559	2543570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009348	GCCAGC	2	12	2562810	2562821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009348	TTGTAA	2	12	2570276	2570287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009348	GGCCAG	2	12	2593371	2593382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009348	AGCCAG	2	12	2620459	2620470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009348	TCCCCA	2	12	2620888	2620899	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009348	GCCTGG	2	12	2621497	2621508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009348	TAAAGC	2	12	2636134	2636145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009348	GGCAGG	2	12	2656192	2656203	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009348	CGCTTG	2	12	2669746	2669757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009348	GCGCCA	2	12	2670512	2670523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009348	ATGGCG	2	12	2679970	2679981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_009348	GCCATC	2	12	2737007	2737018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009348	CCAGCG	2	12	2739836	2739847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009348	ACGCTT	2	12	2800834	2800845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009348	AACGCA	2	12	2831691	2831702	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009348	CTATGA	2	12	2842487	2842498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_009348	GCAGGG	2	12	2866519	2866530	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_009348	AATGAT	2	12	2888545	2888556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_009348	AAAACA	2	12	3027079	3027090	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_009348	GCGATA	2	12	3061397	3061408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_009348	GGATCA	2	12	3093752	3093763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_009348	GAAACT	2	12	3132478	3132489	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_009348	TGAGGC	2	12	3154471	3154482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_009348	GATCAG	2	12	3249027	3249038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.