MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 3198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009348	AGGTC	2	10	1815	1824	20 %	20 %	40 %	20 %	145297126
2	NC_009348	GCGAT	2	10	7870	7879	20 %	20 %	40 %	20 %	145297131
3	NC_009348	CATGG	2	10	8460	8469	20 %	20 %	40 %	20 %	145297131
4	NC_009348	AGGAT	2	10	9237	9246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009348	GGTTG	2	10	10184	10193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009348	CGATA	2	10	10786	10795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009348	CATCC	2	10	11004	11013	20 %	20 %	0 %	60 %	145297134
8	NC_009348	ATCCG	2	10	16820	16829	20 %	20 %	20 %	40 %	145297138
9	NC_009348	TGCCT	2	10	17175	17184	0 %	40 %	20 %	40 %	145297138
10	NC_009348	CAGGG	2	10	20735	20744	20 %	0 %	60 %	20 %	145297140
11	NC_009348	GCCAG	2	10	21255	21264	20 %	0 %	40 %	40 %	145297140
12	NC_009348	TGTGA	2	10	21517	21526	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009348	CATGC	2	10	27339	27348	20 %	20 %	20 %	40 %	145297144
14	NC_009348	GGGCA	2	10	27765	27774	20 %	0 %	60 %	20 %	145297144
15	NC_009348	GATCA	2	10	31699	31708	40 %	20 %	20 %	20 %	145297146
16	NC_009348	CAAGT	2	10	31906	31915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009348	GCGCG	2	10	34619	34628	0 %	0 %	60 %	40 %	145297149
18	NC_009348	CGACC	2	10	35086	35095	20 %	0 %	20 %	60 %	145297149
19	NC_009348	CAGCC	2	10	35375	35384	20 %	0 %	20 %	60 %	145297150
20	NC_009348	CCCGC	2	10	39409	39418	0 %	0 %	20 %	80 %	145297153
21	NC_009348	GGCCG	2	10	40160	40169	0 %	0 %	60 %	40 %	145297154
22	NC_009348	AGACC	2	10	44360	44369	40 %	0 %	20 %	40 %	145297160
23	NC_009348	GCAGA	2	10	44886	44895	40 %	0 %	40 %	20 %	145297160
24	NC_009348	GTTGC	2	10	48119	48128	0 %	40 %	40 %	20 %	145297164
25	NC_009348	GCTTG	2	10	49419	49428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009348	ATCAC	2	10	51522	51531	40 %	20 %	0 %	40 %	145297165
27	NC_009348	TGGCT	2	10	51544	51553	0 %	40 %	40 %	20 %	145297165
28	NC_009348	CTGCC	2	10	54232	54241	0 %	20 %	20 %	60 %	145297168
29	NC_009348	TTTGC	2	10	56875	56884	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009348	GCGAC	2	10	58607	58616	20 %	0 %	40 %	40 %	145297170
31	NC_009348	GCTCT	2	10	58660	58669	0 %	40 %	20 %	40 %	145297170
32	NC_009348	GCTTG	2	10	59482	59491	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009348	AAGCA	2	10	61102	61111	60 %	0 %	20 %	20 %	145297172
34	NC_009348	CTGGT	2	10	61273	61282	0 %	40 %	40 %	20 %	145297172
35	NC_009348	TGAGC	2	10	63501	63510	20 %	20 %	40 %	20 %	145297174
36	NC_009348	AGGCA	2	10	66807	66816	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009348	GATGT	2	10	67414	67423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009348	GGGAG	2	10	68789	68798	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009348	CCGGG	2	10	72890	72899	0 %	0 %	60 %	40 %	145297180
40	NC_009348	GGGGC	2	10	75582	75591	0 %	0 %	80 %	20 %	145297183
41	NC_009348	GGGAT	2	10	75988	75997	20 %	20 %	60 %	0 %	145297183
42	NC_009348	AGGGG	2	10	76854	76863	20 %	0 %	80 %	0 %	145297184
43	NC_009348	CGGCC	2	10	77640	77649	0 %	0 %	40 %	60 %	145297186
44	NC_009348	GGGAG	2	10	78430	78439	20 %	0 %	80 %	0 %	145297187
45	NC_009348	TGGAG	2	10	80135	80144	20 %	20 %	60 %	0 %	145297188
46	NC_009348	CTGGC	2	10	80466	80475	0 %	20 %	40 %	40 %	145297188
47	NC_009348	CGTGG	2	10	80879	80888	0 %	20 %	60 %	20 %	145297188
48	NC_009348	TGAGC	2	10	81522	81531	20 %	20 %	40 %	20 %	145297189
49	NC_009348	AAACC	2	10	82352	82361	60 %	0 %	0 %	40 %	145297190
50	NC_009348	CAAAC	2	10	83328	83337	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009348	TCGTG	2	10	84411	84420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009348	AGTCG	2	10	86490	86499	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009348	AGCGG	2	10	88623	88632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009348	TCCGC	2	10	88691	88700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_009348	GGAGT	2	10	89457	89466	20 %	20 %	60 %	0 %	145297191
56	NC_009348	AGGGC	2	10	90585	90594	20 %	0 %	60 %	20 %	145297193
57	NC_009348	AGCTG	2	10	91930	91939	20 %	20 %	40 %	20 %	145297194
58	NC_009348	CGAGC	2	10	93439	93448	20 %	0 %	40 %	40 %	145297194
59	NC_009348	TGATC	2	10	94046	94055	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009348	GCTCA	2	10	94520	94529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009348	TGACC	2	10	99741	99750	20 %	20 %	20 %	40 %	145297199
62	NC_009348	GCCGA	2	10	100391	100400	20 %	0 %	40 %	40 %	145297199
63	NC_009348	AAAAT	2	10	100856	100865	80 %	20 %	0 %	0 %	145297200
64	NC_009348	AAAGA	2	10	100921	100930	80 %	0 %	20 %	0 %	145297200
65	NC_009348	TTTCT	2	10	101001	101010	0 %	80 %	0 %	20 %	145297200
66	NC_009348	GCATC	2	10	104355	104364	20 %	20 %	20 %	40 %	145297202
67	NC_009348	GCTTG	2	10	104495	104504	0 %	40 %	40 %	20 %	145297202
68	NC_009348	ATCGC	2	10	105963	105972	20 %	20 %	20 %	40 %	145297204
69	NC_009348	TGGTC	2	10	108272	108281	0 %	40 %	40 %	20 %	145297206
70	NC_009348	AAGGG	2	10	109131	109140	40 %	0 %	60 %	0 %	145297207
71	NC_009348	CAAGC	2	10	109745	109754	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_009348	TGGCG	2	10	111524	111533	0 %	20 %	60 %	20 %	145297209
73	NC_009348	CAGTC	2	10	113720	113729	20 %	20 %	20 %	40 %	145297211
74	NC_009348	TTGCC	2	10	115348	115357	0 %	40 %	20 %	40 %	145297213
75	NC_009348	GACCA	2	10	116097	116106	40 %	0 %	20 %	40 %	145297213
76	NC_009348	CGACT	2	10	116772	116781	20 %	20 %	20 %	40 %	145297214
77	NC_009348	AGGCG	2	10	119079	119088	20 %	0 %	60 %	20 %	145297216
78	NC_009348	AAGCG	2	10	121000	121009	40 %	0 %	40 %	20 %	145297217
79	NC_009348	TTCGC	2	10	124945	124954	0 %	40 %	20 %	40 %	145297222
80	NC_009348	ACAGG	2	10	128234	128243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009348	GCCCA	2	10	129953	129962	20 %	0 %	20 %	60 %	145297226
82	NC_009348	CTGCC	2	10	130575	130584	0 %	20 %	20 %	60 %	145297227
83	NC_009348	CCTCT	2	10	130702	130711	0 %	40 %	0 %	60 %	145297227
84	NC_009348	GATCA	2	10	131758	131767	40 %	20 %	20 %	20 %	145297228
85	NC_009348	AGCGC	2	10	131843	131852	20 %	0 %	40 %	40 %	145297228
86	NC_009348	CGTAC	2	10	132337	132346	20 %	20 %	20 %	40 %	145297228
87	NC_009348	GGCCC	2	10	132637	132646	0 %	0 %	40 %	60 %	145297228
88	NC_009348	GCCCG	2	10	134458	134467	0 %	0 %	40 %	60 %	145297229
89	NC_009348	TGAGC	2	10	135329	135338	20 %	20 %	40 %	20 %	145297230
90	NC_009348	CCAGT	2	10	136140	136149	20 %	20 %	20 %	40 %	145297230
91	NC_009348	GGAGG	2	10	136955	136964	20 %	0 %	80 %	0 %	145297232
92	NC_009348	GTTCA	2	10	138545	138554	20 %	40 %	20 %	20 %	145297234
93	NC_009348	GCGAG	2	10	138773	138782	20 %	0 %	60 %	20 %	145297234
94	NC_009348	GCCGA	2	10	139673	139682	20 %	0 %	40 %	40 %	145297234
95	NC_009348	ACCGC	2	10	142242	142251	20 %	0 %	20 %	60 %	145297236
96	NC_009348	TCGCC	2	10	142272	142281	0 %	20 %	20 %	60 %	145297236
97	NC_009348	CCGTG	2	10	144081	144090	0 %	20 %	40 %	40 %	145297237
98	NC_009348	CAGGG	2	10	144858	144867	20 %	0 %	60 %	20 %	145297239
99	NC_009348	AGTCG	2	10	144886	144895	20 %	20 %	40 %	20 %	145297239
100	NC_009348	CGGGT	2	10	145891	145900	0 %	20 %	60 %	20 %	145297240
101	NC_009348	CCCGG	2	10	146102	146111	0 %	0 %	40 %	60 %	145297240
102	NC_009348	GCCCA	2	10	147179	147188	20 %	0 %	20 %	60 %	145297241
103	NC_009348	CCCAA	2	10	148011	148020	40 %	0 %	0 %	60 %	145297242
104	NC_009348	GCCAT	2	10	149842	149851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009348	AGCGG	2	10	149873	149882	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009348	CTGGC	2	10	149939	149948	0 %	20 %	40 %	40 %	145297244
107	NC_009348	TGGGG	2	10	150577	150586	0 %	20 %	80 %	0 %	145297244
108	NC_009348	ACCTG	2	10	153630	153639	20 %	20 %	20 %	40 %	145297248
109	NC_009348	AAAAT	2	10	154794	154803	80 %	20 %	0 %	0 %	145297249
110	NC_009348	CTATT	2	10	154943	154952	20 %	60 %	0 %	20 %	145297249
111	NC_009348	TGGCG	2	10	156337	156346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009348	CAGCT	2	10	156529	156538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009348	GTCGG	2	10	157402	157411	0 %	20 %	60 %	20 %	145297252
114	NC_009348	GGGCG	2	10	158191	158200	0 %	0 %	80 %	20 %	145297253
115	NC_009348	GCAGC	2	10	162402	162411	20 %	0 %	40 %	40 %	145297258
116	NC_009348	GGTCA	2	10	162721	162730	20 %	20 %	40 %	20 %	145297258
117	NC_009348	CAAAA	2	10	166738	166747	80 %	0 %	0 %	20 %	145297262
118	NC_009348	CTTGC	2	10	167242	167251	0 %	40 %	20 %	40 %	145297262
119	NC_009348	TCATT	2	10	167385	167394	20 %	60 %	0 %	20 %	145297262
120	NC_009348	TTGTT	2	10	170183	170192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009348	TGGCC	2	10	176353	176362	0 %	20 %	40 %	40 %	145297269
122	NC_009348	CGGCG	2	10	177591	177600	0 %	0 %	60 %	40 %	145297270
123	NC_009348	CAGCC	2	10	180367	180376	20 %	0 %	20 %	60 %	145297273
124	NC_009348	GCAAA	2	10	181372	181381	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009348	TTCGT	2	10	181930	181939	0 %	60 %	20 %	20 %	145297275
126	NC_009348	CACGA	2	10	183223	183232	40 %	0 %	20 %	40 %	145297276
127	NC_009348	GGGCA	2	10	183787	183796	20 %	0 %	60 %	20 %	145297276
128	NC_009348	GGCTG	2	10	184398	184407	0 %	20 %	60 %	20 %	145297276
129	NC_009348	AACCT	2	10	186928	186937	40 %	20 %	0 %	40 %	145297278
130	NC_009348	TGGTG	2	10	190596	190605	0 %	40 %	60 %	0 %	145297282
131	NC_009348	TGTCA	2	10	190769	190778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009348	CTTTT	2	10	190996	191005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009348	CGGGC	2	10	193387	193396	0 %	0 %	60 %	40 %	145297285
134	NC_009348	GGGAG	2	10	194274	194283	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009348	TGCCT	2	10	194516	194525	0 %	40 %	20 %	40 %	145297286
136	NC_009348	TGAAA	2	10	194659	194668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009348	GCACG	2	10	195407	195416	20 %	0 %	40 %	40 %	145297287
138	NC_009348	GGTGA	2	10	195835	195844	20 %	20 %	60 %	0 %	145297287
139	NC_009348	GAGCA	2	10	198006	198015	40 %	0 %	40 %	20 %	145297290
140	NC_009348	GAGTC	2	10	199207	199216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009348	GGGGC	2	10	200365	200374	0 %	0 %	80 %	20 %	145297292
142	NC_009348	AGGCG	2	10	205526	205535	20 %	0 %	60 %	20 %	145297297
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148	NC_009348	CACTG	2	10	208319	208328	20 %	20 %	20 %	40 %	145297299
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175	NC_009348	TGCAC	2	10	260008	260017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_009348	AAAAG	2	10	260921	260930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_009348	TTGGG	2	10	270405	270414	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_009348	CCAGT	2	10	375974	375983	20 %	20 %	20 %	40 %	145297454
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258	NC_009348	CAGCG	2	10	380792	380801	20 %	0 %	40 %	40 %	145297460
259	NC_009348	GCCAA	2	10	381548	381557	40 %	0 %	20 %	40 %	145297460
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265	NC_009348	TGCAG	2	10	385436	385445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_009348	CAGCA	2	10	387680	387689	40 %	0 %	20 %	40 %	145297466
267	NC_009348	TCGGA	2	10	392897	392906	20 %	20 %	40 %	20 %	145297472
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269	NC_009348	TGCGC	2	10	401200	401209	0 %	20 %	40 %	40 %	145297481
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