MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 2552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009348	GCCTT	2	10	4603394	4603403	0 %	40 %	20 %	40 %	145301132
2502	NC_009348	CGAGG	2	10	4603959	4603968	20 %	0 %	60 %	20 %	145301132
2503	NC_009348	AGCAG	2	10	4604632	4604641	40 %	0 %	40 %	20 %	145301133
2504	NC_009348	CAGCA	2	10	4606689	4606698	40 %	0 %	20 %	40 %	145301135
2505	NC_009348	AGGCG	2	10	4609490	4609499	20 %	0 %	60 %	20 %	145301138
2506	NC_009348	ATTTC	2	10	4620723	4620732	20 %	60 %	0 %	20 %	145301143
2507	NC_009348	CTTCT	2	10	4621136	4621145	0 %	60 %	0 %	40 %	145301145
2508	NC_009348	GGCGA	2	10	4622590	4622599	20 %	0 %	60 %	20 %	145301146
2509	NC_009348	TGCTT	2	10	4623073	4623082	0 %	60 %	20 %	20 %	145301147
2510	NC_009348	ATTCC	2	10	4626723	4626732	20 %	40 %	0 %	40 %	145301150
2511	NC_009348	GCTCA	2	10	4629605	4629614	20 %	20 %	20 %	40 %	145301152
2512	NC_009348	AAGCA	2	10	4633084	4633093	60 %	0 %	20 %	20 %	145301155
2513	NC_009348	CTGGT	2	10	4633255	4633264	0 %	40 %	40 %	20 %	145301155
2514	NC_009348	CCACA	2	10	4635091	4635100	40 %	0 %	0 %	60 %	145301156
2515	NC_009348	GTTTG	2	10	4635867	4635876	0 %	60 %	40 %	0 %	145301156
2516	NC_009348	CAGTG	2	10	4637364	4637373	20 %	20 %	40 %	20 %	145301158
2517	NC_009348	CCACC	2	10	4642486	4642495	20 %	0 %	0 %	80 %	145301161
2518	NC_009348	GCATC	2	10	4644019	4644028	20 %	20 %	20 %	40 %	145301162
2519	NC_009348	ACTCC	2	10	4645905	4645914	20 %	20 %	0 %	60 %	145301163
2520	NC_009348	TTTCG	2	10	4648715	4648724	0 %	60 %	20 %	20 %	145301165
2521	NC_009348	GGCAC	2	10	4648769	4648778	20 %	0 %	40 %	40 %	145301165
2522	NC_009348	AGTGG	2	10	4649160	4649169	20 %	20 %	60 %	0 %	145301166
2523	NC_009348	GGGCT	2	10	4649719	4649728	0 %	20 %	60 %	20 %	145301166
2524	NC_009348	GCCGC	2	10	4650257	4650266	0 %	0 %	40 %	60 %	145301167
2525	NC_009348	TTCAC	2	10	4654418	4654427	20 %	40 %	0 %	40 %	145301170
2526	NC_009348	GCCGT	2	10	4657355	4657364	0 %	20 %	40 %	40 %	145301173
2527	NC_009348	TCAGC	2	10	4657883	4657892	20 %	20 %	20 %	40 %	145301174
2528	NC_009348	TCAGG	2	10	4660527	4660536	20 %	20 %	40 %	20 %	145301177
2529	NC_009348	GCCCA	2	10	4662955	4662964	20 %	0 %	20 %	60 %	145301180
2530	NC_009348	GATCA	2	10	4665946	4665955	40 %	20 %	20 %	20 %	145301183
2531	NC_009348	ATGGA	2	10	4667290	4667299	40 %	20 %	40 %	0 %	145301184
2532	NC_009348	GCGCT	2	10	4667931	4667940	0 %	20 %	40 %	40 %	145301185
2533	NC_009348	CGTCA	2	10	4668792	4668801	20 %	20 %	20 %	40 %	145301185
2534	NC_009348	ATCCC	2	10	4673047	4673056	20 %	20 %	0 %	60 %	145301188
2535	NC_009348	CTCGC	2	10	4673492	4673501	0 %	20 %	20 %	60 %	145301189
2536	NC_009348	GCTTG	2	10	4673944	4673953	0 %	40 %	40 %	20 %	145301189
2537	NC_009348	GAGCC	2	10	4675400	4675409	20 %	0 %	40 %	40 %	145301190
2538	NC_009348	CCGAC	2	10	4677287	4677296	20 %	0 %	20 %	60 %	145301190
2539	NC_009348	GGTTG	2	10	4678602	4678611	0 %	40 %	60 %	0 %	145301191
2540	NC_009348	TTCAC	2	10	4684790	4684799	20 %	40 %	0 %	40 %	145301196
2541	NC_009348	CCAGC	2	10	4684819	4684828	20 %	0 %	20 %	60 %	145301196
2542	NC_009348	GGGTC	2	10	4689361	4689370	0 %	20 %	60 %	20 %	145301199
2543	NC_009348	TCACT	2	10	4689478	4689487	20 %	40 %	0 %	40 %	145301199
2544	NC_009348	GGTCA	2	10	4689542	4689551	20 %	20 %	40 %	20 %	145301199
2545	NC_009348	GCAGC	2	10	4689679	4689688	20 %	0 %	40 %	40 %	145301200
2546	NC_009348	CACGC	2	10	4690198	4690207	20 %	0 %	20 %	60 %	145301200
2547	NC_009348	CGTAC	2	10	4690468	4690477	20 %	20 %	20 %	40 %	145301200
2548	NC_009348	CAGGT	2	10	4691107	4691116	20 %	20 %	40 %	20 %	145301200
2549	NC_009348	TGTCG	2	10	4693228	4693237	0 %	40 %	40 %	20 %	145301200
2550	NC_009348	CTTGG	2	10	4696358	4696367	0 %	40 %	40 %	20 %	145301203
2551	NC_009348	GCAGC	2	10	4700714	4700723	20 %	0 %	40 %	40 %	145301208
2552	NC_009348	AGGGC	2	10	4701661	4701670	20 %	0 %	60 %	20 %	145301210

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.