MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS046_spB

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009346	A	7	7	581	587	100 %	0 %	0 %	0 %	145294032
2	NC_009346	T	7	7	804	810	0 %	100 %	0 %	0 %	145294032
3	NC_009346	T	6	6	1681	1686	0 %	100 %	0 %	0 %	145294033
4	NC_009346	A	6	6	1696	1701	100 %	0 %	0 %	0 %	145294033
5	NC_009346	A	6	6	1719	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	145294033
6	NC_009346	T	6	6	1825	1830	0 %	100 %	0 %	0 %	145294033
7	NC_009346	T	6	6	1879	1884	0 %	100 %	0 %	0 %	145294033
8	NC_009346	T	6	6	1964	1969	0 %	100 %	0 %	0 %	145294034
9	NC_009346	T	7	7	2118	2124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009346	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009346	G	6	6	2430	2435	0 %	0 %	100 %	0 %	145294035
12	NC_009346	G	6	6	2677	2682	0 %	0 %	100 %	0 %	145294035
13	NC_009346	A	6	6	3262	3267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009346	T	6	6	3531	3536	0 %	100 %	0 %	0 %	145294037
15	NC_009346	A	6	6	3622	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	145294037
16	NC_009346	T	6	6	4020	4025	0 %	100 %	0 %	0 %	145294038
17	NC_009346	A	7	7	4188	4194	100 %	0 %	0 %	0 %	145294038
18	NC_009346	T	7	7	5004	5010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.