MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS046_spA

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009345	ATCT	2	8	173	180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009345	AGTG	2	8	441	448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009345	GCCT	2	8	859	866	0 %	25 %	25 %	50 %	145294026
4	NC_009345	GCCG	2	8	1795	1802	0 %	0 %	50 %	50 %	145294027
5	NC_009345	CGCT	2	8	1825	1832	0 %	25 %	25 %	50 %	145294027
6	NC_009345	GCCG	2	8	1913	1920	0 %	0 %	50 %	50 %	145294027
7	NC_009345	GATG	2	8	2128	2135	25 %	25 %	50 %	0 %	145294027
8	NC_009345	TGCT	2	8	2155	2162	0 %	50 %	25 %	25 %	145294027
9	NC_009345	GCAA	2	8	2189	2196	50 %	0 %	25 %	25 %	145294027
10	NC_009345	CAGG	2	8	2204	2211	25 %	0 %	50 %	25 %	145294027
11	NC_009345	CTGC	2	8	2369	2376	0 %	25 %	25 %	50 %	145294027
12	NC_009345	TACA	2	8	2611	2618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009345	TGCC	2	8	2660	2667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009345	GCCA	2	8	2681	2688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009345	GCAT	2	8	3819	3826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009345	ACGG	2	8	4848	4855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009345	AGAT	2	8	5287	5294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009345	GCAG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	145294028
19	NC_009345	TCTG	2	8	6400	6407	0 %	50 %	25 %	25 %	145294028
20	NC_009345	GAAA	2	8	6571	6578	75 %	0 %	25 %	0 %	145294028
21	NC_009345	TCTG	2	8	6931	6938	0 %	50 %	25 %	25 %	145294029
22	NC_009345	GGCT	2	8	8008	8015	0 %	25 %	50 %	25 %	145294030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.