MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS046_spA

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009345	GC	3	6	252	257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009345	AG	3	6	314	319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009345	GC	4	8	831	838	0 %	0 %	50 %	50 %	145294026
4	NC_009345	CG	3	6	1186	1191	0 %	0 %	50 %	50 %	145294027
5	NC_009345	GC	3	6	1420	1425	0 %	0 %	50 %	50 %	145294027
6	NC_009345	GC	4	8	1613	1620	0 %	0 %	50 %	50 %	145294027
7	NC_009345	TA	3	6	3075	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009345	AC	3	6	3210	3215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009345	AT	3	6	5618	5623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009345	GA	3	6	5633	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009345	AT	3	6	5641	5646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009345	CG	3	6	5974	5979	0 %	0 %	50 %	50 %	145294028
13	NC_009345	CG	3	6	6244	6249	0 %	0 %	50 %	50 %	145294028
14	NC_009345	GC	4	8	6427	6434	0 %	0 %	50 %	50 %	145294028
15	NC_009345	CA	3	6	6520	6525	50 %	0 %	0 %	50 %	145294028
16	NC_009345	GC	3	6	7360	7365	0 %	0 %	50 %	50 %	145294029
17	NC_009345	CT	3	6	7720	7725	0 %	50 %	0 %	50 %	145294030
18	NC_009345	GC	3	6	7867	7872	0 %	0 %	50 %	50 %	145294030
19	NC_009345	TC	3	6	8141	8146	0 %	50 %	0 %	50 %	145294030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.