MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	GAAAT	2	10	1883	1892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009343	TTGAT	2	10	2165	2174	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009343	AGCAC	2	10	2410	2419	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009343	TTGCA	2	10	4506	4515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009343	AGCAA	2	10	5859	5868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009343	CGTTC	2	10	8579	8588	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009343	GCAAC	2	10	8786	8795	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009343	CGGTT	2	10	8830	8839	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009343	AACCG	2	10	9191	9200	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009343	TTGAT	2	10	12910	12919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009343	CGATT	2	10	14076	14085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009343	GTGGC	2	10	16341	16350	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009343	TGGGT	2	10	23153	23162	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009343	CGCAA	2	10	32595	32604	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009343	GACCA	2	10	35085	35094	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009343	CAAAA	2	10	37000	37009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009343	CCAGT	2	10	38078	38087	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009343	TCACG	2	10	38284	38293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009343	TGGGG	2	10	45073	45082	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009343	GCCTG	2	10	45548	45557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009343	CACAC	2	10	46629	46638	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009343	CCGCA	2	10	47300	47309	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.