MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	GTGG	2	8	786	793	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009343	GCAG	2	8	966	973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009343	TCAA	2	8	1243	1250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009343	ACCA	2	8	1899	1906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009343	CTGA	2	8	1987	1994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009343	CTAC	2	8	2063	2070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009343	GCAA	2	8	3078	3085	50 %	0 %	25 %	25 %	145297096
8	NC_009343	TGAC	2	8	4382	4389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009343	GGGC	2	8	4824	4831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009343	ATCC	2	8	5418	5425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009343	ATTG	2	8	5651	5658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009343	GTGG	2	8	5769	5776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009343	GAAT	2	8	6901	6908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009343	GAAT	2	8	7253	7260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009343	GCAG	2	8	7485	7492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009343	ATCG	2	8	7495	7502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009343	GATG	2	8	7613	7620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009343	AAGC	2	8	7801	7808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009343	TTGA	2	8	8590	8597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009343	CCTC	2	8	8621	8628	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_009343	CCCA	2	8	9130	9137	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009343	AGGC	2	8	9598	9605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009343	ACCC	2	8	9666	9673	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_009343	TCGC	2	8	10749	10756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009343	TGGG	2	8	11045	11052	0 %	25 %	75 %	0 %	145297099
26	NC_009343	ACCA	2	8	11386	11393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009343	CAAA	2	8	11697	11704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009343	ATGG	2	8	12374	12381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009343	GGCA	2	8	12417	12424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009343	TCGC	2	8	12927	12934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009343	GTTG	2	8	13154	13161	0 %	50 %	50 %	0 %	145297100
32	NC_009343	ACCG	2	8	13503	13510	25 %	0 %	25 %	50 %	145297101
33	NC_009343	CGCT	2	8	13524	13531	0 %	25 %	25 %	50 %	145297101
34	NC_009343	GCTG	2	8	14670	14677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009343	ACCC	2	8	15220	15227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_009343	CGGG	2	8	16433	16440	0 %	0 %	75 %	25 %	145297104
37	NC_009343	GATT	2	8	16526	16533	25 %	50 %	25 %	0 %	145297104
38	NC_009343	TGGG	2	8	17048	17055	0 %	25 %	75 %	0 %	145297104
39	NC_009343	TCGG	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009343	TCGT	2	8	18849	18856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009343	GCGG	2	8	18945	18952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009343	AAAT	2	8	19047	19054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009343	CCAG	2	8	19336	19343	25 %	0 %	25 %	50 %	145297105
44	NC_009343	TTTC	2	8	20420	20427	0 %	75 %	0 %	25 %	145297107
45	NC_009343	CAAA	2	8	20869	20876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009343	TGAC	2	8	20912	20919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009343	GCAG	2	8	21937	21944	25 %	0 %	50 %	25 %	145297109
48	NC_009343	CGCA	2	8	22264	22271	25 %	0 %	25 %	50 %	145297109
49	NC_009343	GTTG	2	8	22657	22664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009343	CTAC	2	8	22796	22803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009343	GCAA	2	8	23452	23459	50 %	0 %	25 %	25 %	145297110
52	NC_009343	CAAC	2	8	24063	24070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009343	GTCC	2	8	24072	24079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009343	CAAA	2	8	24122	24129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009343	CAGC	2	8	24139	24146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009343	CCAA	2	8	24178	24185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009343	CAAG	2	8	24198	24205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009343	ACTG	2	8	24266	24273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009343	ATTA	2	8	25041	25048	50 %	50 %	0 %	0 %	145297112
60	NC_009343	CGGG	2	8	25290	25297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009343	TCGA	2	8	25367	25374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009343	TTCT	2	8	25389	25396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009343	AAGC	2	8	25767	25774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009343	TTGG	2	8	26335	26342	0 %	50 %	50 %	0 %	145297113
65	NC_009343	GGGC	2	8	26984	26991	0 %	0 %	75 %	25 %	145297113
66	NC_009343	GCAG	2	8	27488	27495	25 %	0 %	50 %	25 %	145297113
67	NC_009343	CGAC	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	145297113
68	NC_009343	TGAC	2	8	28688	28695	25 %	25 %	25 %	25 %	145297113
69	NC_009343	CTAA	2	8	29905	29912	50 %	25 %	0 %	25 %	145297113
70	NC_009343	GATG	2	8	30033	30040	25 %	25 %	50 %	0 %	145297113
71	NC_009343	GTGG	2	8	31138	31145	0 %	25 %	75 %	0 %	145297113
72	NC_009343	CCCG	2	8	31963	31970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009343	ATCA	2	8	32183	32190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009343	CAGG	2	8	33204	33211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009343	GGGT	2	8	33730	33737	0 %	25 %	75 %	0 %	145297114
76	NC_009343	GTCG	2	8	33889	33896	0 %	25 %	50 %	25 %	145297114
77	NC_009343	AATC	2	8	34605	34612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009343	GGGT	2	8	35171	35178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009343	AGTG	2	8	35854	35861	25 %	25 %	50 %	0 %	145297115
80	NC_009343	CAAC	2	8	36560	36567	50 %	0 %	0 %	50 %	145297117
81	NC_009343	TGGC	2	8	36774	36781	0 %	25 %	50 %	25 %	145297117
82	NC_009343	GGCA	2	8	36941	36948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009343	AACG	2	8	37260	37267	50 %	0 %	25 %	25 %	145297118
84	NC_009343	CCGC	2	8	37599	37606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009343	TGCC	2	8	38718	38725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009343	TTCG	2	8	38913	38920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009343	TGGT	2	8	39528	39535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009343	TGTT	2	8	39970	39977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009343	CCTC	2	8	40558	40565	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_009343	CATT	2	8	41834	41841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009343	GATT	2	8	42019	42026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009343	CTTT	2	8	43142	43149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009343	CCAT	2	8	44042	44049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009343	GCCA	2	8	44282	44289	25 %	0 %	25 %	50 %	145297121
95	NC_009343	GTGG	2	8	44962	44969	0 %	25 %	75 %	0 %	145297121
96	NC_009343	GCAG	2	8	46354	46361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009343	CAAC	2	8	47033	47040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009343	CAAC	2	8	47318	47325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009343	GTTC	2	8	47496	47503	0 %	50 %	25 %	25 %	145297122
100	NC_009343	TGGT	2	8	47780	47787	0 %	50 %	50 %	0 %	145297122
101	NC_009343	TGGC	2	8	47970	47977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009343	TGCC	2	8	48035	48042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009343	GTTG	2	8	49094	49101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.