MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	GTGG	2	8	786	793	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009343	GCAG	2	8	966	973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009343	TCAA	2	8	1243	1250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009343	ACCA	2	8	1899	1906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009343	CTGA	2	8	1987	1994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009343	CTAC	2	8	2063	2070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009343	TGAC	2	8	4382	4389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009343	GGGC	2	8	4824	4831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009343	ATCC	2	8	5418	5425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009343	ATTG	2	8	5651	5658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009343	GTGG	2	8	5769	5776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009343	GAAT	2	8	6901	6908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009343	GAAT	2	8	7253	7260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009343	GCAG	2	8	7485	7492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009343	ATCG	2	8	7495	7502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009343	GATG	2	8	7613	7620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009343	AAGC	2	8	7801	7808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009343	TTGA	2	8	8590	8597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009343	CCTC	2	8	8621	8628	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009343	CCCA	2	8	9130	9137	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_009343	AGGC	2	8	9598	9605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009343	ACCC	2	8	9666	9673	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009343	TCGC	2	8	10749	10756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009343	ACCA	2	8	11386	11393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009343	CAAA	2	8	11697	11704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009343	ATGG	2	8	12374	12381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009343	GGCA	2	8	12417	12424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009343	TCGC	2	8	12927	12934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009343	GCTG	2	8	14670	14677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009343	ACCC	2	8	15220	15227	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_009343	TCGG	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009343	TCGT	2	8	18849	18856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009343	GCGG	2	8	18945	18952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009343	AAAT	2	8	19047	19054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009343	CAAA	2	8	20869	20876	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009343	TGAC	2	8	20912	20919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009343	GTTG	2	8	22657	22664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009343	CTAC	2	8	22796	22803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009343	CAAC	2	8	24063	24070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009343	GTCC	2	8	24072	24079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009343	CAAA	2	8	24122	24129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009343	CAGC	2	8	24139	24146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009343	CCAA	2	8	24178	24185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009343	CAAG	2	8	24198	24205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009343	ACTG	2	8	24266	24273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009343	CGGG	2	8	25290	25297	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009343	TCGA	2	8	25367	25374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009343	TTCT	2	8	25389	25396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009343	AAGC	2	8	25767	25774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009343	CCCG	2	8	31963	31970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009343	ATCA	2	8	32183	32190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009343	CAGG	2	8	33204	33211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009343	AATC	2	8	34605	34612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009343	GGGT	2	8	35171	35178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009343	GGCA	2	8	36941	36948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009343	CCGC	2	8	37599	37606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009343	TGCC	2	8	38718	38725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009343	TTCG	2	8	38913	38920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009343	TGGT	2	8	39528	39535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009343	TGTT	2	8	39970	39977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009343	CCTC	2	8	40558	40565	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009343	CATT	2	8	41834	41841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009343	GATT	2	8	42019	42026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009343	CTTT	2	8	43142	43149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009343	CCAT	2	8	44042	44049	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009343	GCAG	2	8	46354	46361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009343	CAAC	2	8	47033	47040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009343	CAAC	2	8	47318	47325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009343	TGGC	2	8	47970	47977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009343	TGCC	2	8	48035	48042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009343	GTTG	2	8	49094	49101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.