MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	GCAA	2	8	3078	3085	50 %	0 %	25 %	25 %	145297096
2	NC_009343	TGGG	2	8	11045	11052	0 %	25 %	75 %	0 %	145297099
3	NC_009343	GTTG	2	8	13154	13161	0 %	50 %	50 %	0 %	145297100
4	NC_009343	ACCG	2	8	13503	13510	25 %	0 %	25 %	50 %	145297101
5	NC_009343	CGCT	2	8	13524	13531	0 %	25 %	25 %	50 %	145297101
6	NC_009343	CGGG	2	8	16433	16440	0 %	0 %	75 %	25 %	145297104
7	NC_009343	GATT	2	8	16526	16533	25 %	50 %	25 %	0 %	145297104
8	NC_009343	TGGG	2	8	17048	17055	0 %	25 %	75 %	0 %	145297104
9	NC_009343	CCAG	2	8	19336	19343	25 %	0 %	25 %	50 %	145297105
10	NC_009343	TTTC	2	8	20420	20427	0 %	75 %	0 %	25 %	145297107
11	NC_009343	GCAG	2	8	21937	21944	25 %	0 %	50 %	25 %	145297109
12	NC_009343	CGCA	2	8	22264	22271	25 %	0 %	25 %	50 %	145297109
13	NC_009343	GCAA	2	8	23452	23459	50 %	0 %	25 %	25 %	145297110
14	NC_009343	ATTA	2	8	25041	25048	50 %	50 %	0 %	0 %	145297112
15	NC_009343	TTGG	2	8	26335	26342	0 %	50 %	50 %	0 %	145297113
16	NC_009343	GGGC	2	8	26984	26991	0 %	0 %	75 %	25 %	145297113
17	NC_009343	GCAG	2	8	27488	27495	25 %	0 %	50 %	25 %	145297113
18	NC_009343	CGAC	2	8	27518	27525	25 %	0 %	25 %	50 %	145297113
19	NC_009343	TGAC	2	8	28688	28695	25 %	25 %	25 %	25 %	145297113
20	NC_009343	CTAA	2	8	29905	29912	50 %	25 %	0 %	25 %	145297113
21	NC_009343	GATG	2	8	30033	30040	25 %	25 %	50 %	0 %	145297113
22	NC_009343	GTGG	2	8	31138	31145	0 %	25 %	75 %	0 %	145297113
23	NC_009343	GGGT	2	8	33730	33737	0 %	25 %	75 %	0 %	145297114
24	NC_009343	GTCG	2	8	33889	33896	0 %	25 %	50 %	25 %	145297114
25	NC_009343	AGTG	2	8	35854	35861	25 %	25 %	50 %	0 %	145297115
26	NC_009343	CAAC	2	8	36560	36567	50 %	0 %	0 %	50 %	145297117
27	NC_009343	TGGC	2	8	36774	36781	0 %	25 %	50 %	25 %	145297117
28	NC_009343	AACG	2	8	37260	37267	50 %	0 %	25 %	25 %	145297118
29	NC_009343	GCCA	2	8	44282	44289	25 %	0 %	25 %	50 %	145297121
30	NC_009343	GTGG	2	8	44962	44969	0 %	25 %	75 %	0 %	145297121
31	NC_009343	GTTC	2	8	47496	47503	0 %	50 %	25 %	25 %	145297122
32	NC_009343	TGGT	2	8	47780	47787	0 %	50 %	50 %	0 %	145297122

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.