MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	AGC	2	6	147	152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009343	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009343	ACG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009343	GCT	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009343	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009343	GGA	2	6	717	722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009343	CTG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009343	AGG	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009343	CAA	2	6	1804	1809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009343	TGA	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009343	GAA	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009343	TGG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009343	TCG	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009343	TGG	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009343	ATC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009343	TGC	2	6	2630	2635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297096
17	NC_009343	ACA	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297096
18	NC_009343	CAG	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
19	NC_009343	GCA	3	9	2948	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
20	NC_009343	CAG	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
21	NC_009343	CGG	2	6	3005	3010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297096
22	NC_009343	CAG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
23	NC_009343	GCA	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
24	NC_009343	GCA	3	9	3059	3067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
25	NC_009343	CAG	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
26	NC_009343	TGG	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297096
27	NC_009343	GGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297096
28	NC_009343	AAG	2	6	3182	3187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009343	CAA	3	9	3239	3247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009343	ATT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009343	ACG	2	6	3371	3376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009343	ATG	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009343	CAA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009343	CTT	2	6	3607	3612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009343	ACC	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009343	GTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009343	TCG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009343	CAA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009343	GCA	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297097
40	NC_009343	ACG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297097
41	NC_009343	GCG	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297097
42	NC_009343	ACA	3	9	3980	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297097
43	NC_009343	GTG	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297097
44	NC_009343	TGG	3	9	4070	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297097
45	NC_009343	CAA	2	6	4153	4158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009343	GGT	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009343	TGA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009343	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009343	GAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009343	ACA	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009343	CCA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009343	GAA	2	6	4567	4572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009343	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009343	GAA	2	6	4854	4859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009343	GAA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009343	ACC	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009343	AAC	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009343	TCA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297098
59	NC_009343	TGG	2	6	5189	5194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297098
60	NC_009343	CGA	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297098
61	NC_009343	GTC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297098
62	NC_009343	GTG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297098
63	NC_009343	TCA	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009343	ACA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009343	GGA	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009343	ATC	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009343	AGA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009343	GCC	2	6	5505	5510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009343	GCA	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009343	TTG	2	6	5688	5693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009343	CGA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009343	ATC	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009343	TGG	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009343	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009343	GAA	2	6	5846	5851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009343	TCG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009343	TAA	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009343	TTC	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009343	AGA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009343	ATT	2	6	6303	6308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009343	CCG	2	6	6444	6449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009343	GTG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009343	AGA	2	6	6493	6498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009343	GAG	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009343	GCA	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009343	GAC	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009343	CGA	2	6	6717	6722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009343	TAT	2	6	6805	6810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009343	GAA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009343	TGG	3	9	6913	6921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009343	TTC	2	6	6951	6956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009343	GCA	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009343	GGT	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009343	CCA	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_009343	TCG	2	6	7131	7136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009343	TGG	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009343	ATT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009343	GAA	2	6	7390	7395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009343	CGT	2	6	7543	7548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009343	GGT	2	6	7563	7568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009343	CAA	3	9	7969	7977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009343	TGA	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009343	TGT	2	6	8166	8171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009343	ACA	2	6	8198	8203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009343	CAA	2	6	8215	8220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009343	ACG	2	6	8308	8313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009343	CCA	2	6	8345	8350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009343	TCT	2	6	8402	8407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009343	CAT	2	6	8412	8417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009343	TCA	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009343	CCA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009343	CGC	2	6	8775	8780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009343	ACG	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009343	GTT	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009343	TTG	2	6	8906	8911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009343	TTG	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009343	ATG	2	6	8951	8956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009343	CAC	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009343	AAC	3	9	9028	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009343	ATG	2	6	9062	9067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009343	GTT	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009343	CAC	2	6	9156	9161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009343	ACG	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009343	ATG	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009343	GGT	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009343	CAC	2	6	9488	9493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009343	GTG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009343	ATC	2	6	9807	9812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009343	CAT	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009343	ACG	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009343	GCC	2	6	9960	9965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009343	CAT	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009343	CAT	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009343	ACC	2	6	10328	10333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009343	AGC	2	6	10338	10343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009343	GTA	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009343	CAC	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009343	GAA	2	6	10433	10438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009343	GCA	2	6	10459	10464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009343	CTC	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009343	GAA	2	6	10571	10576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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