MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009342	GAAATT	2	12	2108	2119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009342	GGTCTT	2	12	45186	45197	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009342	TATTGA	2	12	70026	70037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009342	TTGTGG	2	12	109829	109840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009342	GTATAC	2	12	135470	135481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009342	CCTGGT	2	12	154971	154982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009342	AGGCAG	2	12	185900	185911	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009342	AAATAC	2	12	237237	237248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009342	TCGCTG	2	12	247955	247966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009342	TAGTCG	2	12	249262	249273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009342	GGGGTG	2	12	283696	283707	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009342	AAATTA	2	12	371589	371600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009342	GGTGCA	2	12	474321	474332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009342	AAACGA	2	12	479671	479682	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009342	ATCACC	2	12	495467	495478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009342	TTCAGG	2	12	593470	593481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009342	AGTCAG	2	12	607710	607721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009342	TGGGTT	2	12	651495	651506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009342	ACTTCA	2	12	675426	675437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009342	GTAAAC	2	12	697821	697832	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009342	ACGGAA	2	12	797095	797106	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009342	AGATCA	2	12	801807	801818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009342	TTTCCA	2	12	802728	802739	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009342	CTGAAG	2	12	804955	804966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009342	TTATGC	2	12	806305	806316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009342	CAGTAT	2	12	824988	824999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009342	CTGGTT	2	12	826061	826072	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009342	GACAAT	2	12	847182	847193	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009342	GAAAAA	2	12	854978	854989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009342	AGTCAA	2	12	944789	944800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009342	ATTTTC	2	12	948876	948887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009342	CTTACG	2	12	965645	965656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009342	CTAGAC	2	12	966278	966289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009342	TTGTGG	2	12	1025241	1025252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009342	TTCACA	2	12	1046035	1046046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009342	TAACAA	2	12	1049989	1050000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009342	CCGGGC	2	12	1137985	1137996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009342	TGAGGT	2	12	1231660	1231671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009342	TTAAGT	2	12	1237921	1237932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009342	CCCAAT	2	12	1244237	1244248	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009342	TTTCTT	2	12	1334081	1334092	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009342	AAGGAT	2	12	1352287	1352298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009342	CGCTGG	2	12	1399432	1399443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009342	AACTCA	2	12	1423809	1423820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009342	CCGGAA	2	12	1457078	1457089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009342	TTTGAA	2	12	1487479	1487490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009342	CGGTTT	2	12	1503546	1503557	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009342	GGGGAT	2	12	1566648	1566659	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009342	CGTTTT	2	12	1566725	1566736	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009342	TACCTC	2	12	1581591	1581602	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009342	TCTTTT	2	12	1595986	1595997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009342	TTGTGG	2	12	1628270	1628281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009342	CTTTTA	2	12	1753079	1753090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009342	AACGAA	2	12	1804265	1804276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009342	GTGCTT	2	12	1818492	1818503	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009342	AGTGTT	2	12	1859890	1859901	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009342	AGCCTT	2	12	1919071	1919082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009342	GTTATA	2	12	1948266	1948277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009342	CTTTTG	2	12	1965179	1965190	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009342	TTTTTA	2	12	2005872	2005883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009342	AAACCA	2	12	2008017	2008028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009342	CGTTTC	2	12	2114026	2114037	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009342	GCCGAT	2	12	2225667	2225678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009342	GGATAC	2	12	2273798	2273809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009342	TTAGCT	2	12	2298637	2298648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009342	TTTCGC	2	12	2308284	2308295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009342	CTAAAG	2	12	2352099	2352110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009342	AACTTG	2	12	2371228	2371239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009342	CCGGGC	2	12	2376902	2376913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009342	GCCTAA	2	12	2378856	2378867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009342	AAAACG	2	12	2515481	2515492	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009342	CCACAA	2	12	2527183	2527194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009342	GTTGAG	2	12	2533893	2533904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009342	GGGAAA	2	12	2544604	2544615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009342	GAGTGG	2	12	2558393	2558404	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009342	CACTAT	2	12	2586413	2586424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009342	CTGAAA	2	12	2610245	2610256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009342	ACCTGA	2	12	2671833	2671844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009342	CACAAA	2	12	2697974	2697985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009342	ACCACA	2	12	2698755	2698766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009342	CCAACA	2	12	2701704	2701715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009342	CAGGCA	2	12	2711514	2711525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009342	ACCACA	2	12	2712325	2712336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009342	CCAACA	2	12	2715274	2715285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009342	AGAAAA	2	12	2728070	2728081	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009342	GACCCC	2	12	2777835	2777846	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009342	GAAATA	2	12	2852612	2852623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009342	GAAACC	2	12	2860395	2860406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009342	TGAAAG	2	12	2891880	2891891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009342	GATGAC	2	12	2936195	2936206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_009342	CCACCT	2	12	2974215	2974226	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009342	ACTGCG	2	12	2982115	2982126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009342	TGCTGG	2	12	2993493	2993504	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009342	GGTAAT	2	12	3048050	3048061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009342	AACTTA	2	12	3061610	3061621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009342	ACAAGG	2	12	3061788	3061799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009342	TCTGAA	2	12	3107294	3107305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009342	TCAAAT	2	12	3108679	3108690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009342	CACAAA	2	12	3171749	3171760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009342	ACCACA	2	12	3172583	3172594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009342	CCAACA	2	12	3175532	3175543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009342	ATCTGA	2	12	3192544	3192555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009342	CAGATT	2	12	3201821	3201832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009342	GAGGTT	2	12	3276317	3276328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009342	GGCGAG	2	12	3288384	3288395	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.