MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV03

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009341	AGGA	2	8	28	35	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009341	CCCT	2	8	111	118	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009341	ACCC	2	8	223	230	25 %	0 %	0 %	75 %	145226198
4	NC_009341	GCGG	2	8	525	532	0 %	0 %	75 %	25 %	145226198
5	NC_009341	GCAC	2	8	761	768	25 %	0 %	25 %	50 %	145226198
6	NC_009341	CAGC	2	8	1027	1034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009341	GTAA	2	8	2353	2360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009341	ATGT	2	8	2363	2370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009341	GGCG	2	8	2778	2785	0 %	0 %	75 %	25 %	145226201
10	NC_009341	GGCG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	145226202
11	NC_009341	ACCG	2	8	3907	3914	25 %	0 %	25 %	50 %	145226203
12	NC_009341	ATTG	2	8	4580	4587	25 %	50 %	25 %	0 %	145226204
13	NC_009341	CGCC	2	8	5694	5701	0 %	0 %	25 %	75 %	145226205
14	NC_009341	CGCA	2	8	6447	6454	25 %	0 %	25 %	50 %	145226206
15	NC_009341	GCCC	2	8	6480	6487	0 %	0 %	25 %	75 %	145226206
16	NC_009341	GGCC	2	8	6570	6577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009341	AGGA	2	8	6722	6729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009341	TGGC	2	8	7141	7148	0 %	25 %	50 %	25 %	145226207
19	NC_009341	GGAC	2	8	7553	7560	25 %	0 %	50 %	25 %	145226207
20	NC_009341	TGAC	2	8	8245	8252	25 %	25 %	25 %	25 %	145226208
21	NC_009341	GCGG	2	8	8628	8635	0 %	0 %	75 %	25 %	145226208
22	NC_009341	CCGC	2	8	8859	8866	0 %	0 %	25 %	75 %	145226208
23	NC_009341	GCGG	2	8	8976	8983	0 %	0 %	75 %	25 %	145226208
24	NC_009341	CAGC	2	8	9594	9601	25 %	0 %	25 %	50 %	145226208
25	NC_009341	CCAC	2	8	9868	9875	25 %	0 %	0 %	75 %	145226208
26	NC_009341	CCGG	2	8	9970	9977	0 %	0 %	50 %	50 %	145226208
27	NC_009341	GTCA	2	8	10171	10178	25 %	25 %	25 %	25 %	145226209
28	NC_009341	TGGC	2	8	10415	10422	0 %	25 %	50 %	25 %	145226209
29	NC_009341	CGTG	2	8	10441	10448	0 %	25 %	50 %	25 %	145226209
30	NC_009341	GCCT	2	8	10513	10520	0 %	25 %	25 %	50 %	145226209
31	NC_009341	TGGT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	50 %	0 %	145226210
32	NC_009341	GTAG	2	8	11172	11179	25 %	25 %	50 %	0 %	145226210
33	NC_009341	GAGC	2	8	11979	11986	25 %	0 %	50 %	25 %	145226210
34	NC_009341	ACCA	2	8	12080	12087	50 %	0 %	0 %	50 %	145226210
35	NC_009341	GCTC	2	8	12144	12151	0 %	25 %	25 %	50 %	145226210
36	NC_009341	GCGG	2	8	12484	12491	0 %	0 %	75 %	25 %	145226210
37	NC_009341	TCGA	2	8	12854	12861	25 %	25 %	25 %	25 %	145226210
38	NC_009341	AGGT	2	8	13043	13050	25 %	25 %	50 %	0 %	145226210
39	NC_009341	GGGA	2	8	13615	13622	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009341	GTGG	2	8	13719	13726	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009341	GGTC	2	8	14255	14262	0 %	25 %	50 %	25 %	145226211
42	NC_009341	GGCG	2	8	15564	15571	0 %	0 %	75 %	25 %	145226212
43	NC_009341	GATC	2	8	15714	15721	25 %	25 %	25 %	25 %	145226212
44	NC_009341	CCTG	2	8	16197	16204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009341	GCTC	2	8	16431	16438	0 %	25 %	25 %	50 %	145226213
46	NC_009341	AGCG	2	8	16643	16650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.