MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV02

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009340	CTGAT	2	10	555	564	20 %	40 %	20 %	20 %	145226173
2	NC_009340	GTCGA	2	10	932	941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009340	CCGGG	2	10	2200	2209	0 %	0 %	60 %	40 %	145226174
4	NC_009340	CGCAC	2	10	2250	2259	20 %	0 %	20 %	60 %	145226174
5	NC_009340	CGCCT	2	10	3298	3307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009340	GGCGG	2	10	3733	3742	0 %	0 %	80 %	20 %	145226175
7	NC_009340	GGCGC	2	10	4453	4462	0 %	0 %	60 %	40 %	145226175
8	NC_009340	TGAAC	2	10	6570	6579	40 %	20 %	20 %	20 %	145226176
9	NC_009340	GGCGC	2	10	7853	7862	0 %	0 %	60 %	40 %	145226177
10	NC_009340	TCAGC	2	10	8981	8990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009340	TGTTT	2	10	9593	9602	0 %	80 %	20 %	0 %	145226178
12	NC_009340	CCAAT	2	10	9727	9736	40 %	20 %	0 %	40 %	145226178
13	NC_009340	GCTGG	2	10	10127	10136	0 %	20 %	60 %	20 %	145226179
14	NC_009340	TCTGC	2	10	11772	11781	0 %	40 %	20 %	40 %	145226181
15	NC_009340	GCGCA	2	10	11888	11897	20 %	0 %	40 %	40 %	145226181
16	NC_009340	GAGCC	2	10	12889	12898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009340	GCCGC	2	10	13500	13509	0 %	0 %	40 %	60 %	145226183
18	NC_009340	GACCC	2	10	15373	15382	20 %	0 %	20 %	60 %	145226183
19	NC_009340	TGCCC	2	10	15583	15592	0 %	20 %	20 %	60 %	145226183
20	NC_009340	GCAGG	2	10	16778	16787	20 %	0 %	60 %	20 %	145226186
21	NC_009340	AGTGC	2	10	17922	17931	20 %	20 %	40 %	20 %	145226187
22	NC_009340	GATTC	2	10	18249	18258	20 %	40 %	20 %	20 %	145226188
23	NC_009340	GGGAT	2	10	18708	18717	20 %	20 %	60 %	0 %	145226188
24	NC_009340	GCCCG	2	10	20258	20267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009340	GCGCC	2	10	20563	20572	0 %	0 %	40 %	60 %	145226191
26	NC_009340	TCTGG	2	10	21948	21957	0 %	40 %	40 %	20 %	145226193
27	NC_009340	CAACC	2	10	22660	22669	40 %	0 %	0 %	60 %	145226194
28	NC_009340	ATCGC	2	10	23652	23661	20 %	20 %	20 %	40 %	145226195
29	NC_009340	TCAGA	2	10	24409	24418	40 %	20 %	20 %	20 %	145226196

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.