MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV02

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009340	CGCA	2	8	239	246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009340	AGGA	2	8	264	271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009340	GAGC	2	8	428	435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009340	CTGA	2	8	521	528	25 %	25 %	25 %	25 %	145226173
5	NC_009340	ACCT	2	8	719	726	25 %	25 %	0 %	50 %	145226173
6	NC_009340	AGCG	2	8	1522	1529	25 %	0 %	50 %	25 %	145226174
7	NC_009340	CGCC	2	8	2327	2334	0 %	0 %	25 %	75 %	145226174
8	NC_009340	ACCT	2	8	3884	3891	25 %	25 %	0 %	50 %	145226175
9	NC_009340	TCGA	2	8	4073	4080	25 %	25 %	25 %	25 %	145226175
10	NC_009340	CGGG	2	8	4480	4487	0 %	0 %	75 %	25 %	145226175
11	NC_009340	TGGT	2	8	4847	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	145226175
12	NC_009340	CGCC	2	8	4869	4876	0 %	0 %	25 %	75 %	145226175
13	NC_009340	CGAC	2	8	5362	5369	25 %	0 %	25 %	50 %	145226175
14	NC_009340	CTAC	2	8	5755	5762	25 %	25 %	0 %	50 %	145226175
15	NC_009340	ACCA	2	8	5897	5904	50 %	0 %	0 %	50 %	145226175
16	NC_009340	ATGC	2	8	6053	6060	25 %	25 %	25 %	25 %	145226175
17	NC_009340	GCCG	2	8	6416	6423	0 %	0 %	50 %	50 %	145226176
18	NC_009340	GCCA	2	8	6512	6519	25 %	0 %	25 %	50 %	145226176
19	NC_009340	TGAC	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	145226176
20	NC_009340	TAGA	2	8	6837	6844	50 %	25 %	25 %	0 %	145226177
21	NC_009340	CCGG	2	8	6957	6964	0 %	0 %	50 %	50 %	145226177
22	NC_009340	GGTG	2	8	7058	7065	0 %	25 %	75 %	0 %	145226177
23	NC_009340	GTCT	2	8	7138	7145	0 %	50 %	25 %	25 %	145226177
24	NC_009340	GCGG	2	8	8071	8078	0 %	0 %	75 %	25 %	145226177
25	NC_009340	GGTG	2	8	8427	8434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009340	CGTC	2	8	8660	8667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009340	GATT	2	8	9031	9038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009340	CTGT	2	8	9044	9051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009340	CCAG	2	8	9191	9198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009340	GTCG	2	8	10028	10035	0 %	25 %	50 %	25 %	145226179
31	NC_009340	CGGG	3	12	10077	10088	0 %	0 %	75 %	25 %	145226179
32	NC_009340	AGCA	2	8	10354	10361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009340	TGCG	2	8	10607	10614	0 %	25 %	50 %	25 %	145226180
34	NC_009340	GCTG	2	8	10984	10991	0 %	25 %	50 %	25 %	145226180
35	NC_009340	TGGT	2	8	11066	11073	0 %	50 %	50 %	0 %	145226180
36	NC_009340	GGCC	2	8	11438	11445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009340	GTGG	2	8	11587	11594	0 %	25 %	75 %	0 %	145226181
38	NC_009340	CGGG	2	8	12421	12428	0 %	0 %	75 %	25 %	145226181
39	NC_009340	CGCC	2	8	12573	12580	0 %	0 %	25 %	75 %	145226181
40	NC_009340	CCAG	2	8	13564	13571	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
41	NC_009340	GACC	2	8	14074	14081	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
42	NC_009340	ACCG	2	8	14549	14556	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
43	NC_009340	ACCC	2	8	15131	15138	25 %	0 %	0 %	75 %	145226183
44	NC_009340	CCGC	2	8	15469	15476	0 %	0 %	25 %	75 %	145226183
45	NC_009340	CGGG	2	8	15679	15686	0 %	0 %	75 %	25 %	145226183
46	NC_009340	ACCA	2	8	15723	15730	50 %	0 %	0 %	50 %	145226183
47	NC_009340	CCCA	2	8	16461	16468	25 %	0 %	0 %	75 %	145226184
48	NC_009340	TCGG	2	8	16730	16737	0 %	25 %	50 %	25 %	145226186
49	NC_009340	CTTG	2	8	16738	16745	0 %	50 %	25 %	25 %	145226186
50	NC_009340	GGCC	2	8	16864	16871	0 %	0 %	50 %	50 %	145226186
51	NC_009340	GGGC	2	8	16972	16979	0 %	0 %	75 %	25 %	145226186
52	NC_009340	GTCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	145226186
53	NC_009340	TGCC	2	8	17432	17439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009340	TCGT	2	8	17487	17494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009340	GACT	2	8	17775	17782	25 %	25 %	25 %	25 %	145226187
56	NC_009340	CTGC	2	8	18874	18881	0 %	25 %	25 %	50 %	145226188
57	NC_009340	TCGA	2	8	18948	18955	25 %	25 %	25 %	25 %	145226188
58	NC_009340	CCAG	2	8	19306	19313	25 %	0 %	25 %	50 %	145226189
59	NC_009340	ACCG	2	8	19347	19354	25 %	0 %	25 %	50 %	145226189
60	NC_009340	ATCG	2	8	19416	19423	25 %	25 %	25 %	25 %	145226189
61	NC_009340	CCGG	2	8	19528	19535	0 %	0 %	50 %	50 %	145226189
62	NC_009340	CTAT	2	8	19760	19767	25 %	50 %	0 %	25 %	145226189
63	NC_009340	CTAG	2	8	19781	19788	25 %	25 %	25 %	25 %	145226189
64	NC_009340	GCCA	2	8	19789	19796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009340	GGAC	2	8	19916	19923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009340	CAAC	2	8	21085	21092	50 %	0 %	0 %	50 %	145226192
67	NC_009340	CTCG	2	8	21337	21344	0 %	25 %	25 %	50 %	145226192
68	NC_009340	TCGG	2	8	22278	22285	0 %	25 %	50 %	25 %	145226193
69	NC_009340	CCGT	2	8	22584	22591	0 %	25 %	25 %	50 %	145226193
70	NC_009340	ATGA	2	8	22922	22929	50 %	25 %	25 %	0 %	145226194
71	NC_009340	TGGT	2	8	23673	23680	0 %	50 %	50 %	0 %	145226195
72	NC_009340	GATC	2	8	23779	23786	25 %	25 %	25 %	25 %	145226195
73	NC_009340	ACAA	2	8	24035	24042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009340	GCCA	2	8	24213	24220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009340	CTGC	2	8	24274	24281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009340	ACGG	2	8	24290	24297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009340	CGCC	2	8	24914	24921	0 %	0 %	25 %	75 %	145226196
78	NC_009340	CCAG	2	8	25120	25127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.