MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV02

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009340	CTGA	2	8	521	528	25 %	25 %	25 %	25 %	145226173
2	NC_009340	ACCT	2	8	719	726	25 %	25 %	0 %	50 %	145226173
3	NC_009340	AGCG	2	8	1522	1529	25 %	0 %	50 %	25 %	145226174
4	NC_009340	CGCC	2	8	2327	2334	0 %	0 %	25 %	75 %	145226174
5	NC_009340	ACCT	2	8	3884	3891	25 %	25 %	0 %	50 %	145226175
6	NC_009340	TCGA	2	8	4073	4080	25 %	25 %	25 %	25 %	145226175
7	NC_009340	CGGG	2	8	4480	4487	0 %	0 %	75 %	25 %	145226175
8	NC_009340	TGGT	2	8	4847	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	145226175
9	NC_009340	CGCC	2	8	4869	4876	0 %	0 %	25 %	75 %	145226175
10	NC_009340	CGAC	2	8	5362	5369	25 %	0 %	25 %	50 %	145226175
11	NC_009340	CTAC	2	8	5755	5762	25 %	25 %	0 %	50 %	145226175
12	NC_009340	ACCA	2	8	5897	5904	50 %	0 %	0 %	50 %	145226175
13	NC_009340	ATGC	2	8	6053	6060	25 %	25 %	25 %	25 %	145226175
14	NC_009340	GCCG	2	8	6416	6423	0 %	0 %	50 %	50 %	145226176
15	NC_009340	GCCA	2	8	6512	6519	25 %	0 %	25 %	50 %	145226176
16	NC_009340	TGAC	2	8	6756	6763	25 %	25 %	25 %	25 %	145226176
17	NC_009340	TAGA	2	8	6837	6844	50 %	25 %	25 %	0 %	145226177
18	NC_009340	CCGG	2	8	6957	6964	0 %	0 %	50 %	50 %	145226177
19	NC_009340	GGTG	2	8	7058	7065	0 %	25 %	75 %	0 %	145226177
20	NC_009340	GTCT	2	8	7138	7145	0 %	50 %	25 %	25 %	145226177
21	NC_009340	GCGG	2	8	8071	8078	0 %	0 %	75 %	25 %	145226177
22	NC_009340	GTCG	2	8	10028	10035	0 %	25 %	50 %	25 %	145226179
23	NC_009340	CGGG	3	12	10077	10088	0 %	0 %	75 %	25 %	145226179
24	NC_009340	TGCG	2	8	10607	10614	0 %	25 %	50 %	25 %	145226180
25	NC_009340	GCTG	2	8	10984	10991	0 %	25 %	50 %	25 %	145226180
26	NC_009340	TGGT	2	8	11066	11073	0 %	50 %	50 %	0 %	145226180
27	NC_009340	GTGG	2	8	11587	11594	0 %	25 %	75 %	0 %	145226181
28	NC_009340	CGGG	2	8	12421	12428	0 %	0 %	75 %	25 %	145226181
29	NC_009340	CGCC	2	8	12573	12580	0 %	0 %	25 %	75 %	145226181
30	NC_009340	CCAG	2	8	13564	13571	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
31	NC_009340	GACC	2	8	14074	14081	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
32	NC_009340	ACCG	2	8	14549	14556	25 %	0 %	25 %	50 %	145226183
33	NC_009340	ACCC	2	8	15131	15138	25 %	0 %	0 %	75 %	145226183
34	NC_009340	CCGC	2	8	15469	15476	0 %	0 %	25 %	75 %	145226183
35	NC_009340	CGGG	2	8	15679	15686	0 %	0 %	75 %	25 %	145226183
36	NC_009340	ACCA	2	8	15723	15730	50 %	0 %	0 %	50 %	145226183
37	NC_009340	CCCA	2	8	16461	16468	25 %	0 %	0 %	75 %	145226184
38	NC_009340	TCGG	2	8	16730	16737	0 %	25 %	50 %	25 %	145226186
39	NC_009340	CTTG	2	8	16738	16745	0 %	50 %	25 %	25 %	145226186
40	NC_009340	GGCC	2	8	16864	16871	0 %	0 %	50 %	50 %	145226186
41	NC_009340	GGGC	2	8	16972	16979	0 %	0 %	75 %	25 %	145226186
42	NC_009340	GTCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	145226186
43	NC_009340	GACT	2	8	17775	17782	25 %	25 %	25 %	25 %	145226187
44	NC_009340	CTGC	2	8	18874	18881	0 %	25 %	25 %	50 %	145226188
45	NC_009340	TCGA	2	8	18948	18955	25 %	25 %	25 %	25 %	145226188
46	NC_009340	CCAG	2	8	19306	19313	25 %	0 %	25 %	50 %	145226189
47	NC_009340	ACCG	2	8	19347	19354	25 %	0 %	25 %	50 %	145226189
48	NC_009340	ATCG	2	8	19416	19423	25 %	25 %	25 %	25 %	145226189
49	NC_009340	CCGG	2	8	19528	19535	0 %	0 %	50 %	50 %	145226189
50	NC_009340	CTAT	2	8	19760	19767	25 %	50 %	0 %	25 %	145226189
51	NC_009340	CTAG	2	8	19781	19788	25 %	25 %	25 %	25 %	145226189
52	NC_009340	CAAC	2	8	21085	21092	50 %	0 %	0 %	50 %	145226192
53	NC_009340	CTCG	2	8	21337	21344	0 %	25 %	25 %	50 %	145226192
54	NC_009340	TCGG	2	8	22278	22285	0 %	25 %	50 %	25 %	145226193
55	NC_009340	CCGT	2	8	22584	22591	0 %	25 %	25 %	50 %	145226193
56	NC_009340	ATGA	2	8	22922	22929	50 %	25 %	25 %	0 %	145226194
57	NC_009340	TGGT	2	8	23673	23680	0 %	50 %	50 %	0 %	145226195
58	NC_009340	GATC	2	8	23779	23786	25 %	25 %	25 %	25 %	145226195
59	NC_009340	CGCC	2	8	24914	24921	0 %	0 %	25 %	75 %	145226196

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.