MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV02

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009340	GCA	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226173
2	NC_009340	CGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226173
3	NC_009340	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226173
4	NC_009340	CAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226173
5	NC_009340	AGG	2	6	795	800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226173
6	NC_009340	CAC	2	6	1108	1113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
7	NC_009340	CAC	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
8	NC_009340	CCG	2	6	1177	1182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
9	NC_009340	TCG	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226174
10	NC_009340	CCT	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226174
11	NC_009340	CAC	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
12	NC_009340	CGG	2	6	1385	1390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226174
13	NC_009340	TCG	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226174
14	NC_009340	CCA	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
15	NC_009340	GCC	2	6	1491	1496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
16	NC_009340	GCC	2	6	1576	1581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
17	NC_009340	AGT	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226174
18	NC_009340	ACC	3	9	1725	1733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
19	NC_009340	TAC	2	6	1757	1762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226174
20	NC_009340	CAC	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226174
21	NC_009340	CCG	2	6	1866	1871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
22	NC_009340	CGG	2	6	1921	1926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226174
23	NC_009340	CCG	2	6	1927	1932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
24	NC_009340	CGG	2	6	1942	1947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226174
25	NC_009340	TGG	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226174
26	NC_009340	CTG	2	6	2022	2027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226174
27	NC_009340	GCT	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226174
28	NC_009340	CGC	2	6	2078	2083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
29	NC_009340	CGA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226174
30	NC_009340	GCC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
31	NC_009340	CCG	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
32	NC_009340	GCC	3	9	2190	2198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
33	NC_009340	CGG	2	6	2272	2277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226174
34	NC_009340	CCG	3	9	2278	2286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226174
35	NC_009340	CGA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226174
36	NC_009340	GCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226174
37	NC_009340	GAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226174
38	NC_009340	CTA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226175
39	NC_009340	GCC	2	6	3545	3550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
40	NC_009340	TAC	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226175
41	NC_009340	CGG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
42	NC_009340	GCG	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
43	NC_009340	CGC	2	6	3784	3789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
44	NC_009340	GCT	2	6	3805	3810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
45	NC_009340	GGC	2	6	3874	3879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
46	NC_009340	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226175
47	NC_009340	ATC	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226175
48	NC_009340	CGA	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
49	NC_009340	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
50	NC_009340	TCG	4	12	4287	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
51	NC_009340	CCG	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
52	NC_009340	AGC	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
53	NC_009340	CGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
54	NC_009340	GCG	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
55	NC_009340	GTC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
56	NC_009340	ACG	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
57	NC_009340	CGC	2	6	4627	4632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
58	NC_009340	AGG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226175
59	NC_009340	CGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
60	NC_009340	CGC	3	9	4912	4920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
61	NC_009340	CGG	2	6	4965	4970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
62	NC_009340	GTG	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226175
63	NC_009340	GTC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
64	NC_009340	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226175
65	NC_009340	GCT	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
66	NC_009340	TCG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
67	NC_009340	CGG	2	6	5203	5208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
68	NC_009340	CCG	2	6	5332	5337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
69	NC_009340	GCC	4	12	5396	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
70	NC_009340	CGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
71	NC_009340	CTG	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
72	NC_009340	CAC	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226175
73	NC_009340	CAT	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226175
74	NC_009340	CCA	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226175
75	NC_009340	CAC	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226175
76	NC_009340	CGA	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
77	NC_009340	ACC	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226175
78	NC_009340	GCT	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226175
79	NC_009340	GCC	2	6	5889	5894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
80	NC_009340	CGG	2	6	5926	5931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226175
81	NC_009340	GAT	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226175
82	NC_009340	CGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
83	NC_009340	GCC	2	6	6149	6154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226175
84	NC_009340	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226175
85	NC_009340	GCA	2	6	6225	6230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226175
86	NC_009340	TCA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226176
87	NC_009340	CGG	2	6	6459	6464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226176
88	NC_009340	CGC	2	6	6496	6501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226176
89	NC_009340	GCC	2	6	6541	6546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226176
90	NC_009340	TCG	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226176
91	NC_009340	GGT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226176
92	NC_009340	CGG	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226176
93	NC_009340	GGC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226176
94	NC_009340	CAG	3	9	6882	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
95	NC_009340	TGC	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226177
96	NC_009340	ACG	3	9	6929	6937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
97	NC_009340	GCA	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
98	NC_009340	GCG	2	6	7082	7087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
99	NC_009340	GGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
100	NC_009340	GCG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
101	NC_009340	ACG	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
102	NC_009340	GGT	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226177
103	NC_009340	CGG	2	6	7325	7330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
104	NC_009340	GCC	2	6	7350	7355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
105	NC_009340	CCA	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
106	NC_009340	ACG	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
107	NC_009340	CAC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
108	NC_009340	TCA	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226177
109	NC_009340	CTC	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226177
110	NC_009340	CAG	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
111	NC_009340	CGC	2	6	7713	7718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
112	NC_009340	GCC	2	6	7729	7734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
113	NC_009340	ACC	2	6	7753	7758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
114	NC_009340	CGA	2	6	7794	7799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
115	NC_009340	GCC	3	9	7828	7836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
116	NC_009340	CGG	2	6	7878	7883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
117	NC_009340	CAT	2	6	7914	7919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226177
118	NC_009340	GGC	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
119	NC_009340	CCG	2	6	7993	7998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
120	NC_009340	GGC	3	9	8089	8097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226177
121	NC_009340	ACC	3	9	8106	8114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
122	NC_009340	AGG	2	6	8151	8156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226177
123	NC_009340	CGC	2	6	8172	8177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
124	NC_009340	CGC	2	6	8196	8201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
125	NC_009340	CGA	2	6	8205	8210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226177
126	NC_009340	CGC	2	6	8217	8222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
127	NC_009340	CCA	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
128	NC_009340	CAC	2	6	8255	8260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226177
129	NC_009340	CCG	3	9	8317	8325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226177
130	NC_009340	TCG	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226178
131	NC_009340	GTG	2	6	9466	9471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226178
132	NC_009340	TCG	2	6	9483	9488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226178
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255	NC_009340	CAG	2	6	16657	16662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226185
256	NC_009340	CGG	2	6	16829	16834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226186
257	NC_009340	ATC	2	6	16854	16859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226186
258	NC_009340	CGG	2	6	16882	16887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226186
259	NC_009340	GAC	2	6	17204	17209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226186
260	NC_009340	AGG	2	6	17277	17282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226186
261	NC_009340	TGA	2	6	17543	17548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226187
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264	NC_009340	CGA	2	6	17706	17711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.