MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV01

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009339	CTTCAC	2	12	3509	3520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145225876
2	NC_009339	TCTCCG	2	12	3712	3723	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145225876
3	NC_009339	CGCGGT	2	12	4290	4301	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145225877
4	NC_009339	CCGGGA	2	12	7362	7373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145225878
5	NC_009339	ACGCTC	2	12	7804	7815	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145225878
6	NC_009339	TCGCCG	2	12	10748	10759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145225879
7	NC_009339	CCGCGA	2	12	10830	10841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225879
8	NC_009339	GTCGGT	2	12	11650	11661	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145225880
9	NC_009339	GTCGAT	2	12	12217	12228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145225880
10	NC_009339	TCGTGG	2	12	12354	12365	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145225880
11	NC_009339	GCTACG	2	12	15771	15782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225884
12	NC_009339	CTGATC	2	12	16262	16273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145225884
13	NC_009339	CTGGCG	2	12	16301	16312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145225884
14	NC_009339	CCTACG	2	12	16479	16490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145225884
15	NC_009339	ACCAGC	2	12	17431	17442	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145225885
16	NC_009339	TTCGCC	2	12	19291	19302	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145225886
17	NC_009339	GACGCC	2	12	22919	22930	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225890
18	NC_009339	CCGACG	7	42	26472	26513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225893
19	NC_009339	GCCTTG	2	12	26682	26693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145225894
20	NC_009339	CCATCT	2	12	30586	30597	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	145225899
21	NC_009339	CGGCAC	2	12	35221	35232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225904
22	NC_009339	CACCGA	2	12	43937	43948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145225912
23	NC_009339	GATCAG	2	12	48486	48497	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	145225917
24	NC_009339	CGTAGC	2	12	48977	48988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225917
25	NC_009339	CGGGTG	2	12	49859	49870	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145225918
26	NC_009339	CCGGCA	2	12	50515	50526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225919
27	NC_009339	TTCGCC	2	12	52441	52452	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145225921
28	NC_009339	AGGACA	2	12	54383	54394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145225923
29	NC_009339	CTGTCG	2	12	56665	56676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145225925
30	NC_009339	CGTCGA	2	12	57273	57284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225925
31	NC_009339	CACGGC	2	12	64137	64148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225934
32	NC_009339	CGGCGC	2	12	72126	72137	0 %	0 %	50 %	50 %	145225938
33	NC_009339	AGAACG	2	12	72252	72263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145225938
34	NC_009339	ACGCCG	2	12	75102	75113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225941
35	NC_009339	GCGATC	2	12	76706	76717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225942
36	NC_009339	CGACTC	2	12	76976	76987	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145225943
37	NC_009339	CCGTAG	2	12	77583	77594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225943
38	NC_009339	CGCGAG	2	12	79667	79678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145225946
39	NC_009339	CCGAAA	2	12	82894	82905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145225950
40	NC_009339	CGGCGA	2	12	86230	86241	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145225952
41	NC_009339	CCGGTG	2	12	94499	94510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145225957
42	NC_009339	ATGTCG	2	12	94650	94661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145225958
43	NC_009339	CTGTCG	2	12	98918	98929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145225962
44	NC_009339	CGTCGA	2	12	99526	99537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225962
45	NC_009339	GCCCCT	2	12	104127	104138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	145225966
46	NC_009339	GCGGCC	2	12	106789	106800	0 %	0 %	50 %	50 %	145225969
47	NC_009339	CACGGC	2	12	108098	108109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225970
48	NC_009339	CGGCGC	2	12	111858	111869	0 %	0 %	50 %	50 %	145225972
49	NC_009339	GAAGAG	2	12	111970	111981	50 %	0 %	50 %	0 %	145225972
50	NC_009339	GTAGCC	2	12	116911	116922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225976
51	NC_009339	CCGCGA	2	12	117917	117928	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145225977
52	NC_009339	CGGGGT	2	12	120904	120915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145225981
53	NC_009339	CCGTCG	2	12	121104	121115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145225981
54	NC_009339	CACCGC	2	12	125389	125400	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145225986
55	NC_009339	CGGTGG	2	12	126075	126086	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145225986
56	NC_009339	GGCTGG	2	12	127287	127298	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145225988
57	NC_009339	ATGGCC	2	12	129487	129498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145225991
58	NC_009339	TGAAGT	2	12	130764	130775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145225992
59	NC_009339	GCTACC	2	12	131551	131562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145225993
60	NC_009339	CCGACC	2	12	133194	133205	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145225994
61	NC_009339	CGACAT	2	12	134185	134196	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145225994
62	NC_009339	CAGGCA	2	12	134541	134552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145225994
63	NC_009339	CAACGC	2	12	149399	149410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145226008
64	NC_009339	CGCGGG	2	12	150749	150760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226010
65	NC_009339	CGGTGC	2	12	152777	152788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226011
66	NC_009339	CGACGG	2	12	158778	158789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	145226015
67	NC_009339	CCCCGG	2	12	160746	160757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226016
68	NC_009339	TCGCGC	2	12	166926	166937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226021
69	NC_009339	CGCCTG	2	12	171013	171024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226026
70	NC_009339	GACATC	2	12	171973	171984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145226028
71	NC_009339	CGGCCA	2	12	172677	172688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145226028
72	NC_009339	GCCACA	2	12	172696	172707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145226028
73	NC_009339	GCTGCG	2	12	174208	174219	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226030
74	NC_009339	GGGCTT	2	12	175657	175668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226031
75	NC_009339	GCCGCG	2	12	176016	176027	0 %	0 %	50 %	50 %	145226032
76	NC_009339	GCGTGA	2	12	177951	177962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145226035
77	NC_009339	CAGGTG	2	12	182719	182730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145226041
78	NC_009339	CGGGGG	2	12	189007	189018	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	145226048
79	NC_009339	TCGGTG	2	12	190490	190501	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226048
80	NC_009339	CACCGC	2	12	192533	192544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226050
81	NC_009339	GCGGCC	2	12	193215	193226	0 %	0 %	50 %	50 %	145226050
82	NC_009339	GCGGGC	2	12	194945	194956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226051
83	NC_009339	CGGCCT	2	12	195352	195363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226052
84	NC_009339	CGTCGG	2	12	195538	195549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226053
85	NC_009339	CACCGT	2	12	199644	199655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226056
86	NC_009339	CCAGTC	2	12	201100	201111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226056
87	NC_009339	CACCCA	2	12	206823	206834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226060
88	NC_009339	AGCACC	2	12	207500	207511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145226061
89	NC_009339	CCGCCA	2	12	207639	207650	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226061
90	NC_009339	CCGCAG	2	12	208417	208428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145226061
91	NC_009339	CCACAC	2	12	209443	209454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226063
92	NC_009339	CGAACC	2	12	211119	211130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145226065
93	NC_009339	GACCTC	2	12	212838	212849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226067
94	NC_009339	TCACGA	2	12	214491	214502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145226068
95	NC_009339	CGCCAC	2	12	215794	215805	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226069
96	NC_009339	CGGTAT	2	12	222423	222434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145226075
97	NC_009339	GCAACC	2	12	224003	224014	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145226077
98	NC_009339	TACCGC	2	12	225446	225457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226079
99	NC_009339	CCGGGC	2	12	226342	226353	0 %	0 %	50 %	50 %	145226080
100	NC_009339	CGGCGC	2	12	226512	226523	0 %	0 %	50 %	50 %	145226080
101	NC_009339	ATGGCC	2	12	226586	226597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145226080
102	NC_009339	GGCGTC	2	12	227217	227228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226081
103	NC_009339	CGGCCA	2	12	230245	230256	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145226086
104	NC_009339	GAACGG	2	12	232602	232613	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	145226089
105	NC_009339	CGCCGG	2	12	232916	232927	0 %	0 %	50 %	50 %	145226089
106	NC_009339	GCCCAC	2	12	233653	233664	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226089
107	NC_009339	TTCGAG	2	12	235431	235442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145226090
108	NC_009339	CTCAAG	2	12	236479	236490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	145226092
109	NC_009339	GGGGTT	2	12	237559	237570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226093
110	NC_009339	GTCGGG	2	12	239254	239265	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145226094
111	NC_009339	GCCGCA	2	12	240677	240688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145226096
112	NC_009339	CATCGG	2	12	241705	241716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145226096
113	NC_009339	ACCGCC	2	12	242083	242094	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145226096
114	NC_009339	CGAGGT	2	12	244426	244437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145226099
115	NC_009339	GTCGGT	2	12	248387	248398	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226104
116	NC_009339	GTCGAT	2	12	248954	248965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145226104
117	NC_009339	TCGTGG	2	12	249091	249102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226104
118	NC_009339	ATTGAG	2	12	250589	250600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226105
119	NC_009339	TTTGAG	2	12	256458	256469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	145226108
120	NC_009339	TCGATT	2	12	256528	256539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	145226108
121	NC_009339	ACGCTG	2	12	261096	261107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145226111
122	NC_009339	GGCTTG	2	12	270214	270225	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226120
123	NC_009339	GTGGGC	2	12	274683	274694	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145226125
124	NC_009339	CGCGGC	2	12	278696	278707	0 %	0 %	50 %	50 %	145226128
125	NC_009339	CTGGAC	2	12	279117	279128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145226128
126	NC_009339	GATCCG	2	12	280013	280024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	145226129
127	NC_009339	CGCCGG	2	12	282324	282335	0 %	0 %	50 %	50 %	145226131
128	NC_009339	CCGCCC	2	12	282665	282676	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	145226131
129	NC_009339	CATGCC	2	12	282715	282726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226131
130	NC_009339	CATGCC	2	12	282757	282768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226131
131	NC_009339	TCGGTG	2	12	283567	283578	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226132
132	NC_009339	GATCGT	2	12	285018	285029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145226132
133	NC_009339	GGCGTA	2	12	287004	287015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145226135
134	NC_009339	GCGTCG	2	12	287854	287865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226135
135	NC_009339	CCGTCG	2	12	288969	288980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226136
136	NC_009339	CGCCGT	2	12	291291	291302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226137
137	NC_009339	TCGGTC	2	12	294786	294797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226140
138	NC_009339	GATGGT	2	12	296092	296103	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	145226141
139	NC_009339	CGACCT	2	12	297568	297579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226142
140	NC_009339	GGCCGC	2	12	302797	302808	0 %	0 %	50 %	50 %	145226150
141	NC_009339	TGGCCG	2	12	309654	309665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145226155
142	NC_009339	TCGCGC	2	12	310989	311000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	145226157
143	NC_009339	CCGCGG	2	12	312484	312495	0 %	0 %	50 %	50 %	145226158
144	NC_009339	CAGCTC	2	12	312849	312860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145226158
145	NC_009339	CCGCGG	2	12	312874	312885	0 %	0 %	50 %	50 %	145226158
146	NC_009339	AGCGGT	2	12	317364	317375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145226163
147	NC_009339	GGTTGC	2	12	320622	320633	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226168
148	NC_009339	TCGGTG	2	12	321039	321050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145226169

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.