MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009339	ATCGC	2	10	10277	10286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009339	CAGGT	2	10	10476	10485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009339	CTTGG	2	10	10582	10591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009339	CTGTC	2	10	24666	24675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009339	CCGCA	2	10	25072	25081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009339	CCACG	2	10	30348	30357	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_009339	CGCGG	2	10	34324	34333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_009339	CGCGT	2	10	44287	44296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009339	GGCCG	2	10	51429	51438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009339	CGCTG	2	10	60053	60062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009339	GTCTC	2	10	62373	62382	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009339	CACGA	2	10	66788	66797	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009339	GCGTA	2	10	70104	70113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009339	CTCGC	2	10	70145	70154	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009339	CGGGG	2	10	77896	77905	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009339	GCACG	2	10	78813	78822	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009339	CACCT	2	10	88750	88759	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_009339	CGGGC	2	10	90633	90642	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009339	GGCGC	2	10	94551	94560	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009339	GCGCT	2	10	94597	94606	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009339	CGCGC	2	10	96619	96628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009339	ATGTC	2	10	97777	97786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009339	CGAGT	2	10	104586	104595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009339	GAATG	2	10	110570	110579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009339	CGGGG	2	10	117222	117231	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009339	CCAGA	2	10	120774	120783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009339	CGCGG	2	10	136080	136089	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009339	CACCT	2	10	142971	142980	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009339	TGCAA	2	10	156736	156745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009339	ACGCC	2	10	156828	156837	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_009339	CCGCG	2	10	157003	157012	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_009339	CCCGG	2	10	173584	173593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_009339	GCCTG	2	10	173606	173615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009339	CGCGG	2	10	175865	175874	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009339	GCGCC	2	10	176962	176971	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_009339	GGTGA	2	10	179610	179619	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009339	AGGTG	2	10	187695	187704	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009339	AACCC	2	10	206965	206974	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_009339	ACCAC	2	10	211854	211863	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_009339	ACCGG	2	10	223880	223889	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009339	CGGTC	2	10	234971	234980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009339	ACACC	2	10	237324	237333	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_009339	ACCAC	2	10	237367	237376	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_009339	ACACC	2	10	237506	237515	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_009339	GATCA	2	10	242977	242986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009339	GGCCA	2	10	251256	251265	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009339	CCCCG	2	10	260304	260313	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_009339	TCGAG	2	10	278288	278297	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009339	AGCTG	2	10	295868	295877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009339	CGCGT	2	10	315863	315872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009339	CTGGC	2	10	316854	316863	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.