MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV01

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009339	GCCC	2	8	2936	2943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_009339	ACTG	2	8	3980	3987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009339	CTCC	2	8	5141	5148	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_009339	GGTG	2	8	5189	5196	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009339	GCCC	2	8	10076	10083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009339	CTGC	2	8	10186	10193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009339	TGGT	2	8	11118	11125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009339	GGGC	2	8	11180	11187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009339	GATC	2	8	11214	11221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009339	GCCT	2	8	13578	13585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009339	CAAG	2	8	14216	14223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009339	AGCC	2	8	16732	16739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009339	GACG	2	8	16796	16803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009339	TGGG	2	8	20643	20650	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009339	CGTC	2	8	20677	20684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009339	GCTC	2	8	22028	22035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009339	GCGT	2	8	22146	22153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009339	GCCG	2	8	22203	22210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009339	CGGC	2	8	23910	23917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009339	TCAT	2	8	24837	24844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009339	ACGT	2	8	25039	25046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009339	ACGT	2	8	25112	25119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009339	CGAT	2	8	25315	25322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009339	CCCG	2	8	25557	25564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009339	ATGA	2	8	25585	25592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009339	GTCA	2	8	25955	25962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009339	CGGG	2	8	31071	31078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009339	TCAC	2	8	42487	42494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009339	CCGC	2	8	44138	44145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009339	CTGC	2	8	44251	44258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009339	CATT	2	8	50675	50682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009339	CGCA	2	8	51691	51698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009339	TCCG	2	8	52958	52965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009339	AGGG	2	8	54059	54066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009339	TGAT	2	8	54967	54974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009339	CGGC	2	8	58573	58580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009339	CGTC	2	8	60032	60039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009339	GCAC	2	8	61912	61919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009339	TAGT	3	12	62206	62217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009339	GATA	2	8	62325	62332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009339	CTCA	2	8	66084	66091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009339	ACGG	2	8	66210	66217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009339	CTAC	2	8	66536	66543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009339	CTCG	2	8	70127	70134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009339	CGTA	2	8	72946	72953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009339	CTAC	2	8	74312	74319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009339	GGCT	2	8	75780	75787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009339	CTAC	2	8	79903	79910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009339	GCAC	2	8	80017	80024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009339	CGTC	2	8	83833	83840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009339	CGGG	2	8	83846	83853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009339	TCGA	2	8	85730	85737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009339	GGGC	2	8	87114	87121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009339	GACT	2	8	87136	87143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009339	GCTC	2	8	88678	88685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009339	CCCG	2	8	89460	89467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009339	GCGT	2	8	89544	89551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009339	ACTG	2	8	89833	89840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009339	TCCC	2	8	89877	89884	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009339	CAAT	2	8	90651	90658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009339	GCTT	2	8	91029	91036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009339	TCGT	2	8	91105	91112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009339	GGTA	2	8	92489	92496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009339	AGCG	2	8	96682	96689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009339	GCGG	2	8	96924	96931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009339	GGAG	2	8	100806	100813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009339	CGAA	2	8	105012	105019	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009339	GACG	2	8	105419	105426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009339	GGCA	2	8	106183	106190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009339	GCGG	2	8	109932	109939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009339	CATC	2	8	112634	112641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009339	CGTA	2	8	112674	112681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009339	CCTG	2	8	114016	114023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009339	CGAC	2	8	115485	115492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009339	CCTA	2	8	119216	119223	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009339	GCCC	2	8	120575	120582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009339	GTCG	2	8	120618	120625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009339	CGGC	2	8	122822	122829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009339	GATC	2	8	123276	123283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009339	CCGG	2	8	129906	129913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009339	GACC	2	8	136069	136076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009339	ATCG	2	8	136375	136382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009339	GAAC	2	8	137532	137539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009339	CGCC	2	8	139700	139707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009339	TGCT	2	8	139710	139717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009339	TCGA	2	8	141387	141394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009339	GCTC	2	8	142899	142906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009339	TCAC	2	8	145371	145378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009339	ACGG	2	8	145387	145394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009339	CAGT	2	8	148245	148252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009339	ATCA	2	8	148407	148414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009339	GCGG	2	8	148521	148528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009339	CTCA	2	8	149713	149720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009339	CCCG	2	8	156754	156761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_009339	AGAA	2	8	156794	156801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009339	TGCC	2	8	156951	156958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009339	TCCC	2	8	157223	157230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_009339	GGGA	2	8	157248	157255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009339	CCAC	2	8	159991	159998	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009339	CAAC	2	8	162999	163006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009339	CGGG	2	8	164203	164210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009339	CGAG	2	8	164901	164908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009339	GCCG	2	8	164946	164953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009339	CCCT	2	8	166982	166989	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_009339	GTCG	2	8	168360	168367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009339	CCGC	2	8	170614	170621	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009339	GATC	2	8	175105	175112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009339	TTGG	2	8	175792	175799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009339	GCGA	2	8	176462	176469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009339	ATCA	2	8	177816	177823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009339	CAGT	2	8	179553	179560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009339	CAGC	2	8	185027	185034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009339	AATG	2	8	195072	195079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009339	TGGT	2	8	195825	195832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009339	GGTC	2	8	207124	207131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009339	GCGG	2	8	208563	208570	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009339	AGCC	2	8	208621	208628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009339	CTGC	2	8	208702	208709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009339	CTAC	2	8	213980	213987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009339	ATCG	2	8	214872	214879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009339	CACT	2	8	214976	214983	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009339	CTCG	2	8	215050	215057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009339	TGCA	2	8	215884	215891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009339	CTCA	2	8	215929	215936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009339	CCCG	2	8	216311	216318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_009339	ACCT	2	8	220350	220357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009339	CTGG	2	8	223414	223421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009339	CCAG	2	8	223422	223429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009339	TCCG	2	8	226682	226689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009339	GCCG	2	8	228453	228460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009339	CCTG	2	8	245773	245780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009339	CTGT	2	8	245818	245825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009339	CAGC	2	8	245871	245878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009339	GCGT	2	8	246027	246034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009339	GGGC	2	8	247917	247924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009339	GATC	2	8	247951	247958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009339	CCAA	2	8	260207	260214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009339	GGTC	2	8	269227	269234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009339	TAAC	2	8	270956	270963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009339	CCGC	2	8	271227	271234	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_009339	AAGG	2	8	271469	271476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009339	AGCT	2	8	271477	271484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009339	CTTT	2	8	277946	277953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009339	GCAC	2	8	295790	295797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009339	GGAG	2	8	299114	299121	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009339	CGCC	2	8	303893	303900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_009339	GCTA	2	8	307026	307033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009339	AGCG	2	8	308013	308020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009339	GGCC	2	8	311699	311706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009339	GGCC	2	8	316205	316212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009339	CGGA	2	8	317523	317530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009339	GCGA	2	8	317660	317667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009339	CGCA	2	8	317802	317809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009339	GTCC	2	8	320857	320864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.