MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK chromosome

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009338	CACATG	2	12	84921	84932	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009338	TCTCGT	2	12	132150	132161	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009338	TGCGGG	2	12	230712	230723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009338	CGGCCG	2	12	234282	234293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009338	AGCTGA	2	12	284366	284377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009338	CGCCGG	2	12	300623	300634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009338	ACTGAA	2	12	332761	332772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009338	CGGGCT	2	12	429792	429803	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009338	TGCGGG	2	12	441269	441280	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009338	GATCAA	2	12	452120	452131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009338	CACCGA	2	12	508494	508505	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009338	GCCGTA	2	12	516114	516125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009338	AACCGT	2	12	516134	516145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009338	CCGCAC	2	12	564304	564315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009338	GAAGTG	2	12	580466	580477	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009338	GTCGGT	2	12	612040	612051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009338	GAAGTG	2	12	654150	654161	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009338	CTCGAT	2	12	686809	686820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009338	AGATCG	2	12	692398	692409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009338	GGCGAG	4	24	692778	692801	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009338	GCAGCG	2	12	693048	693059	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009338	GACCGG	2	12	693306	693317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009338	TCCGGC	2	12	776685	776696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009338	GTGTCG	2	12	815307	815318	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009338	TCGCCG	2	12	815620	815631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009338	CCAGCG	2	12	816346	816357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009338	CCGGCC	2	12	860387	860398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009338	CGGGGC	2	12	895629	895640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009338	GCCGTT	2	12	916887	916898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009338	CGTGCC	2	12	1018053	1018064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009338	GACGAG	2	12	1021969	1021980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009338	GTGCCT	2	12	1056837	1056848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009338	ATCGCC	2	12	1111974	1111985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009338	CCGCCA	2	12	1249066	1249077	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009338	CCGCCA	2	12	1271436	1271447	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009338	CCCGGC	2	12	1274895	1274906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009338	CGTGCC	2	12	1401279	1401290	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009338	GGCCTT	2	12	1437574	1437585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009338	TCCCGC	2	12	1455904	1455915	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009338	GGCTCG	2	12	1512727	1512738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009338	GGCCTC	2	12	1536351	1536362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009338	AGTGCG	2	12	1640812	1640823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009338	GTGGGG	2	12	1694510	1694521	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009338	GCCCGC	2	12	1737487	1737498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009338	GCGCGT	2	12	1777722	1777733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009338	CCGCAC	2	12	1794224	1794235	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009338	ACCAGA	2	12	1844148	1844159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009338	GGGAAC	2	12	1920769	1920780	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009338	CCGCAC	2	12	1924535	1924546	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009338	TCGGCG	2	12	2020921	2020932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009338	CAGCGG	2	12	2050105	2050116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009338	TCACCC	2	12	2050149	2050160	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009338	GACGAT	2	12	2059182	2059193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009338	GACGCC	2	12	2069760	2069771	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009338	CGGCTG	2	12	2160372	2160383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009338	CGCGGC	2	12	2165472	2165483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009338	GATGTC	2	12	2226907	2226918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009338	CGGCTG	2	12	2293602	2293613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009338	CGGTGA	2	12	2328724	2328735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009338	CTCGGT	2	12	2367667	2367678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009338	GCGGGT	2	12	2376011	2376022	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009338	CGGTTC	2	12	2399434	2399445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009338	GATAGG	2	12	2463894	2463905	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009338	GAGGCG	2	12	2472456	2472467	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009338	GCCGGT	2	12	2496193	2496204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009338	GAATGA	2	12	2601273	2601284	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009338	TCGGTG	2	12	2682055	2682066	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009338	GCCCGA	2	12	2714366	2714377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009338	TGTTAT	2	12	2740746	2740757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009338	CACGTC	2	12	2740838	2740849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009338	GTGGGT	2	12	2740991	2741002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009338	CTCGTC	2	12	2803691	2803702	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009338	CCATGA	2	12	2940524	2940535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009338	TTTCGG	2	12	2961616	2961627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009338	TGCTCG	2	12	3033996	3034007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009338	CGACCG	2	12	3034522	3034533	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009338	CCTTCT	2	12	3036782	3036793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009338	ATGTAC	2	12	3088094	3088105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009338	CGTGGT	2	12	3091955	3091966	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009338	GATGGT	2	12	3093712	3093723	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009338	GCCGTT	2	12	3130031	3130042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009338	GCGACC	2	12	3136076	3136087	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009338	CCGACG	2	12	3204097	3204108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009338	AGTGGG	2	12	3367870	3367881	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009338	GCGCCA	2	12	3420628	3420639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009338	GATGCG	2	12	3427214	3427225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009338	GCAAAG	2	12	3559910	3559921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009338	CGCACC	2	12	3571775	3571786	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009338	CCGCGT	2	12	3788203	3788214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009338	GCCACG	2	12	3945234	3945245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009338	GCCTGC	2	12	3945746	3945757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009338	CCCGAC	2	12	3945851	3945862	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009338	AAGCCG	2	12	3945906	3945917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009338	GAGGTT	2	12	3945929	3945940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009338	TCGGGC	2	12	4000131	4000142	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009338	CAGCGA	5	30	4130543	4130572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009338	CGGTCG	2	12	4160131	4160142	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009338	GTGTTC	2	12	4160473	4160484	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009338	TCCTGT	2	12	4384575	4384586	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009338	CGCGAA	2	12	4468958	4468969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009338	CGGGGT	2	12	4549950	4549961	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_009338	CGAATT	2	12	4652486	4652497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009338	GACGGT	2	12	4692642	4692653	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_009338	CGCCCC	2	12	4712752	4712763	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_009338	GCCGGG	2	12	4768923	4768934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009338	CGGACG	2	12	4768941	4768952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009338	GACCAT	2	12	4803773	4803784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009338	CGACCT	2	12	4806011	4806022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009338	CTTTGT	2	12	4906734	4906745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009338	CAGACC	2	12	4946335	4946346	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009338	GCGACA	2	12	4948220	4948231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009338	TCCTGG	2	12	5023923	5023934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009338	GACGAG	2	12	5081144	5081155	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009338	CGGCCA	2	12	5174844	5174855	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009338	GCTGTC	2	12	5177166	5177177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009338	GCCCGC	2	12	5395586	5395597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009338	GCTCTT	2	12	5424960	5424971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009338	GATCAC	2	12	5499652	5499663	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009338	CACCGA	2	12	5551618	5551629	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009338	CGACGC	2	12	5559192	5559203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009338	GCACCA	2	12	5577324	5577335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009338	GCCAGC	2	12	5577673	5577684	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009338	CTTGAT	2	12	5591847	5591858	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.