MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009337	CAACA	2	10	33478	33487	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009337	TGTTT	2	10	33644	33653	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009337	ATATA	2	10	33676	33685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009337	GTTAT	2	10	35568	35577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009337	GGGCC	2	10	39297	39306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009337	CGATC	2	10	39888	39897	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009337	TGTAT	2	10	57998	58007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009337	GACAA	2	10	67570	67579	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009337	ATATA	2	10	98000	98009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009337	TTTTC	2	10	99092	99101	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009337	AGAAA	2	10	118095	118104	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009337	GTATG	2	10	123345	123354	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009337	TATGT	2	10	135438	135447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009337	CATAT	2	10	158260	158269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009337	AAGGC	2	10	169983	169992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009337	TCAGA	2	10	170088	170097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009337	AATGG	2	10	188335	188344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009337	TCGTG	2	10	192823	192832	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009337	ACCGT	2	10	195417	195426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009337	GGAAA	2	10	212243	212252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009337	CGGCC	2	10	219829	219838	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_009337	TGGTT	2	10	229040	229049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009337	AAGAG	2	10	239609	239618	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009337	GTTTT	2	10	254862	254871	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009337	GTCTC	2	10	265184	265193	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009337	TTACA	2	10	271657	271666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009337	ACGAA	2	10	296523	296532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009337	GCTGT	2	10	338890	338899	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009337	GAAAA	2	10	341681	341690	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009337	TGCGT	2	10	342202	342211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009337	GGTTG	2	10	363614	363623	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009337	CAGGG	2	10	365440	365449	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009337	TTCCC	2	10	392861	392870	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_009337	CTGCC	2	10	392891	392900	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009337	TTGCC	2	10	397788	397797	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009337	TTCCC	2	10	410478	410487	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009337	GAGAG	2	10	423496	423505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009337	GTATG	2	10	466135	466144	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009337	TCTGC	2	10	528439	528448	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009337	TTGAA	2	10	531031	531040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009337	GTGCT	2	10	534998	535007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009337	CATGC	2	10	558886	558895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009337	TTGTT	2	10	558970	558979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009337	GTTCA	2	10	559922	559931	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_009337	TGAAT	2	10	579088	579097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009337	CTTTT	2	10	594645	594654	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009337	CCTTT	2	10	595782	595791	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_009337	CGGTT	2	10	614724	614733	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009337	CTGTT	2	10	632333	632342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009337	TGGCA	2	10	705947	705956	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009337	AAAGA	2	10	713052	713061	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009337	GGTTC	2	10	723411	723420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009337	TTTTA	2	10	725956	725965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009337	AGCGG	2	10	729327	729336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009337	GCTCA	2	10	729372	729381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009337	CCTGT	2	10	740529	740538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009337	CTCCG	2	10	753567	753576	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_009337	TTTCA	2	10	755473	755482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009337	AAATG	2	10	756627	756636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009337	CAAAA	2	10	757591	757600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009337	GATAA	2	10	779204	779213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009337	CCCTG	2	10	801873	801882	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_009337	GAAAA	2	10	810162	810171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009337	ATTAT	2	10	811865	811874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009337	GTTTT	2	10	831325	831334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009337	TTGAA	2	10	878091	878100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009337	TACAA	2	10	885028	885037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009337	ACAGG	2	10	885264	885273	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009337	CGGGA	2	10	906058	906067	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009337	AACCA	2	10	906831	906840	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009337	CGAGA	2	10	961226	961235	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009337	AATGG	2	10	970474	970483	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009337	TTCTT	2	10	991871	991880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009337	GTTTA	2	10	1000663	1000672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009337	CCCTG	2	10	1001952	1001961	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_009337	GAAGA	2	10	1023655	1023664	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009337	TCAAC	2	10	1024547	1024556	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009337	CCACA	2	10	1025100	1025109	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_009337	ACCGG	2	10	1040146	1040155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009337	AAAAT	2	10	1057353	1057362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009337	ACAAA	3	15	1061615	1061629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009337	GTAAG	2	10	1061864	1061873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009337	TTCTG	2	10	1077343	1077352	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009337	CTCCA	2	10	1077404	1077413	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_009337	GCAGG	2	10	1086975	1086984	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009337	CGTTC	2	10	1104941	1104950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009337	TAATT	2	10	1118572	1118581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009337	CTGCC	2	10	1124823	1124832	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_009337	TGAAC	2	10	1130676	1130685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009337	AAAGG	2	10	1144750	1144759	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009337	GAACA	2	10	1150852	1150861	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009337	TTTTA	2	10	1180527	1180536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009337	CCCCG	2	10	1199118	1199127	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
94	NC_009337	TGCCG	2	10	1202400	1202409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_009337	CGAAA	2	10	1220342	1220351	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009337	CTGAA	2	10	1222141	1222150	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009337	TCAAT	2	10	1222436	1222445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009337	TCATA	2	10	1223036	1223045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009337	ACATT	2	10	1237177	1237186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009337	CCAAG	2	10	1250978	1250987	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009337	CTGCG	2	10	1263278	1263287	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009337	AAGAA	2	10	1271211	1271220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009337	AACAT	2	10	1281962	1281971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009337	TTCGA	2	10	1286124	1286133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009337	GTAAT	2	10	1292578	1292587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009337	TCATT	2	10	1314414	1314423	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009337	CAGAA	2	10	1323494	1323503	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009337	AAATA	2	10	1407520	1407529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009337	AGGAG	2	10	1417362	1417371	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009337	CCTTC	2	10	1425075	1425084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_009337	CAAAA	2	10	1430053	1430062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009337	ACCTT	2	10	1430098	1430107	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009337	GAAAA	2	10	1433224	1433233	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009337	GCATT	2	10	1465473	1465482	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009337	CTCAT	2	10	1465527	1465536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009337	CAGAT	2	10	1489440	1489449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009337	AGACA	2	10	1501092	1501101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009337	GGCGG	2	10	1515966	1515975	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009337	GAAAA	2	10	1569660	1569669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009337	CTCAT	2	10	1584970	1584979	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_009337	ATTAC	2	10	1610690	1610699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009337	TCTCA	2	10	1610700	1610709	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009337	GCCCC	2	10	1610774	1610783	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_009337	CCAAA	2	10	1619722	1619731	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009337	CTTTA	2	10	1630763	1630772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009337	ACAAG	2	10	1661507	1661516	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009337	TAGTA	2	10	1684728	1684737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009337	AAAGG	2	10	1711376	1711385	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009337	CCCTC	2	10	1713844	1713853	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_009337	CAAAA	2	10	1713872	1713881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009337	TCGTT	2	10	1728029	1728038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009337	AATAT	2	10	1728411	1728420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009337	TACAG	2	10	1736028	1736037	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009337	CCGCT	2	10	1751120	1751129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009337	GTGCT	2	10	1758942	1758951	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009337	CTTTT	2	10	1763558	1763567	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009337	CCTGC	2	10	1771393	1771402	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_009337	CAAAA	2	10	1800286	1800295	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009337	AAATA	2	10	1806632	1806641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009337	CATTA	2	10	1841031	1841040	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009337	GAGAG	2	10	1848406	1848415	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009337	ATGGC	2	10	1855073	1855082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009337	CCCTT	2	10	1859561	1859570	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_009337	AGATG	2	10	1882370	1882379	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_009337	GAATG	2	10	1920225	1920234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009337	AGAGA	2	10	1930360	1930369	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.