MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 chromosome

Total Repeats: 1054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009337	GAAAA	2	10	776	785	80 %	0 %	20 %	0 %	145218823
2	NC_009337	CGAAG	2	10	1915	1924	40 %	0 %	40 %	20 %	145218824
3	NC_009337	GAACT	2	10	4267	4276	40 %	20 %	20 %	20 %	145218826
4	NC_009337	TTTTA	2	10	5456	5465	20 %	80 %	0 %	0 %	145218827
5	NC_009337	TCTCC	2	10	7133	7142	0 %	40 %	0 %	60 %	145218828
6	NC_009337	ATCTT	2	10	9313	9322	20 %	60 %	0 %	20 %	145218829
7	NC_009337	TCAGC	2	10	12151	12160	20 %	20 %	20 %	40 %	145218831
8	NC_009337	ATGCC	2	10	15688	15697	20 %	20 %	20 %	40 %	145218834
9	NC_009337	GGGAA	2	10	16125	16134	40 %	0 %	60 %	0 %	145218834
10	NC_009337	CTTTC	2	10	17058	17067	0 %	60 %	0 %	40 %	145218835
11	NC_009337	CCTTC	2	10	18857	18866	0 %	40 %	0 %	60 %	145218836
12	NC_009337	GCGGA	2	10	20158	20167	20 %	0 %	60 %	20 %	145218838
13	NC_009337	AGCTC	2	10	25484	25493	20 %	20 %	20 %	40 %	145218842
14	NC_009337	CGTAT	2	10	25938	25947	20 %	40 %	20 %	20 %	145218842
15	NC_009337	TCAAA	2	10	26474	26483	60 %	20 %	0 %	20 %	145218843
16	NC_009337	TTCTG	2	10	27574	27583	0 %	60 %	20 %	20 %	145218844
17	NC_009337	TCCTG	2	10	29778	29787	0 %	40 %	20 %	40 %	145218847
18	NC_009337	CGGAG	2	10	30283	30292	20 %	0 %	60 %	20 %	145218847
19	NC_009337	GCTCT	2	10	30980	30989	0 %	40 %	20 %	40 %	145218848
20	NC_009337	TACGG	2	10	34466	34475	20 %	20 %	40 %	20 %	145218850
21	NC_009337	GGGGC	2	10	36747	36756	0 %	0 %	80 %	20 %	145218852
22	NC_009337	GTTCG	2	10	36796	36805	0 %	40 %	40 %	20 %	145218852
23	NC_009337	GCACC	2	10	40723	40732	20 %	0 %	20 %	60 %	145218853
24	NC_009337	AATCC	2	10	47279	47288	40 %	20 %	0 %	40 %	145218862
25	NC_009337	TTCCC	2	10	51161	51170	0 %	40 %	0 %	60 %	145218868
26	NC_009337	GGAGA	2	10	56707	56716	40 %	0 %	60 %	0 %	145218874
27	NC_009337	TCCGC	2	10	59413	59422	0 %	20 %	20 %	60 %	145218876
28	NC_009337	GGCTC	2	10	59641	59650	0 %	20 %	40 %	40 %	145218876
29	NC_009337	TTCTC	2	10	59725	59734	0 %	60 %	0 %	40 %	145218876
30	NC_009337	TGGCC	2	10	60481	60490	0 %	20 %	40 %	40 %	145218877
31	NC_009337	GCCCC	2	10	61326	61335	0 %	0 %	20 %	80 %	145218877
32	NC_009337	CAGGG	2	10	62780	62789	20 %	0 %	60 %	20 %	145218879
33	NC_009337	CCTCA	2	10	67407	67416	20 %	20 %	0 %	60 %	145218882
34	NC_009337	TTTCG	2	10	68884	68893	0 %	60 %	20 %	20 %	145218883
35	NC_009337	GAGCC	2	10	70176	70185	20 %	0 %	40 %	40 %	145218885
36	NC_009337	GGGAA	2	10	70502	70511	40 %	0 %	60 %	0 %	145218885
37	NC_009337	ACTCC	2	10	70579	70588	20 %	20 %	0 %	60 %	145218885
38	NC_009337	AGGCA	2	10	71434	71443	40 %	0 %	40 %	20 %	145218885
39	NC_009337	CTTTT	2	10	72131	72140	0 %	80 %	0 %	20 %	145218885
40	NC_009337	GCCCG	2	10	74612	74621	0 %	0 %	40 %	60 %	145218886
41	NC_009337	TTTCT	2	10	75585	75594	0 %	80 %	0 %	20 %	145218886
42	NC_009337	CAGTC	2	10	79844	79853	20 %	20 %	20 %	40 %	145218890
43	NC_009337	CTGAA	2	10	83732	83741	40 %	20 %	20 %	20 %	145218892
44	NC_009337	TGCTT	2	10	83969	83978	0 %	60 %	20 %	20 %	145218893
45	NC_009337	GATAT	2	10	84774	84783	40 %	40 %	20 %	0 %	145218893
46	NC_009337	TGCAT	2	10	85565	85574	20 %	40 %	20 %	20 %	145218893
47	NC_009337	CGTTC	2	10	86548	86557	0 %	40 %	20 %	40 %	145218893
48	NC_009337	TGCAA	2	10	87833	87842	40 %	20 %	20 %	20 %	145218893
49	NC_009337	ATCCG	2	10	88239	88248	20 %	20 %	20 %	40 %	145218893
50	NC_009337	CCGTG	2	10	94030	94039	0 %	20 %	40 %	40 %	145218896
51	NC_009337	AATAG	2	10	96951	96960	60 %	20 %	20 %	0 %	145218899
52	NC_009337	TCTCT	2	10	97215	97224	0 %	60 %	0 %	40 %	145218899
53	NC_009337	TCCTC	2	10	99225	99234	0 %	40 %	0 %	60 %	145218901
54	NC_009337	TCGTC	2	10	102477	102486	0 %	40 %	20 %	40 %	145218902
55	NC_009337	ATCCC	2	10	102898	102907	20 %	20 %	0 %	60 %	145218903
56	NC_009337	GAATC	2	10	109097	109106	40 %	20 %	20 %	20 %	145218909
57	NC_009337	CAGCG	2	10	113474	113483	20 %	0 %	40 %	40 %	145218912
58	NC_009337	CGCTC	2	10	113695	113704	0 %	20 %	20 %	60 %	145218912
59	NC_009337	ACTCC	2	10	114370	114379	20 %	20 %	0 %	60 %	145218912
60	NC_009337	TTCGC	2	10	114899	114908	0 %	40 %	20 %	40 %	145218912
61	NC_009337	CATGG	2	10	115051	115060	20 %	20 %	40 %	20 %	145218912
62	NC_009337	CAATG	2	10	117844	117853	40 %	20 %	20 %	20 %	145218912
63	NC_009337	AAACG	2	10	123142	123151	60 %	0 %	20 %	20 %	145218917
64	NC_009337	TTTCA	2	10	128988	128997	20 %	60 %	0 %	20 %	145218924
65	NC_009337	ATGCA	2	10	130639	130648	40 %	20 %	20 %	20 %	145218926
66	NC_009337	GGTGA	2	10	136991	137000	20 %	20 %	60 %	0 %	145218934
67	NC_009337	CCTGT	2	10	141688	141697	0 %	40 %	20 %	40 %	145218941
68	NC_009337	CTTGC	2	10	142291	142300	0 %	40 %	20 %	40 %	145218941
69	NC_009337	CGGTG	2	10	145940	145949	0 %	20 %	60 %	20 %	145218946
70	NC_009337	TTCAA	2	10	147280	147289	40 %	40 %	0 %	20 %	145218947
71	NC_009337	GCATT	2	10	150280	150289	20 %	40 %	20 %	20 %	145218949
72	NC_009337	CTGCG	2	10	153534	153543	0 %	20 %	40 %	40 %	145218954
73	NC_009337	CGCTC	2	10	154968	154977	0 %	20 %	20 %	60 %	145218955
74	NC_009337	CTTCT	2	10	156161	156170	0 %	60 %	0 %	40 %	145218956
75	NC_009337	TTTCA	2	10	156851	156860	20 %	60 %	0 %	20 %	145218956
76	NC_009337	CGGCT	2	10	161199	161208	0 %	20 %	40 %	40 %	145218959
77	NC_009337	AGCCG	2	10	163423	163432	20 %	0 %	40 %	40 %	145218960
78	NC_009337	GCCGG	2	10	164832	164841	0 %	0 %	60 %	40 %	145218962
79	NC_009337	CTTTT	2	10	165150	165159	0 %	80 %	0 %	20 %	145218963
80	NC_009337	GACGT	2	10	165202	165211	20 %	20 %	40 %	20 %	145218963
81	NC_009337	CAGCA	2	10	165672	165681	40 %	0 %	20 %	40 %	145218964
82	NC_009337	GAGGT	2	10	166435	166444	20 %	20 %	60 %	0 %	145218966
83	NC_009337	GGAAT	2	10	167194	167203	40 %	20 %	40 %	0 %	145218966
84	NC_009337	GCGCA	2	10	167340	167349	20 %	0 %	40 %	40 %	145218966
85	NC_009337	TGGCG	2	10	171519	171528	0 %	20 %	60 %	20 %	145218970
86	NC_009337	CGCTT	2	10	172503	172512	0 %	40 %	20 %	40 %	145218971
87	NC_009337	CGCGC	2	10	173207	173216	0 %	0 %	40 %	60 %	145218972
88	NC_009337	GGTTC	2	10	173239	173248	0 %	40 %	40 %	20 %	145218972
89	NC_009337	GGCCC	2	10	174054	174063	0 %	0 %	40 %	60 %	145218972
90	NC_009337	CCCTG	2	10	175765	175774	0 %	20 %	20 %	60 %	145218976
91	NC_009337	TTTCA	2	10	177821	177830	20 %	60 %	0 %	20 %	145218977
92	NC_009337	TGCCC	2	10	181030	181039	0 %	20 %	20 %	60 %	145218981
93	NC_009337	GCCAT	2	10	181060	181069	20 %	20 %	20 %	40 %	145218981
94	NC_009337	GGTGA	2	10	184036	184045	20 %	20 %	60 %	0 %	145218984
95	NC_009337	CTTCC	2	10	184857	184866	0 %	40 %	0 %	60 %	145218986
96	NC_009337	ATGGT	2	10	189842	189851	20 %	40 %	40 %	0 %	145218989
97	NC_009337	TCCTT	2	10	197256	197265	0 %	60 %	0 %	40 %	145218991
98	NC_009337	GCTTC	2	10	198862	198871	0 %	40 %	20 %	40 %	145218993
99	NC_009337	GGCGG	2	10	200402	200411	0 %	0 %	80 %	20 %	145218994
100	NC_009337	AGGGC	2	10	203169	203178	20 %	0 %	60 %	20 %	145218999
101	NC_009337	AGAAA	2	10	203595	203604	80 %	0 %	20 %	0 %	145219000
102	NC_009337	TTCTG	2	10	204249	204258	0 %	60 %	20 %	20 %	145219001
103	NC_009337	CCGTT	2	10	205033	205042	0 %	40 %	20 %	40 %	145219002
104	NC_009337	TCCGG	2	10	205129	205138	0 %	20 %	40 %	40 %	145219002
105	NC_009337	GGTCA	2	10	205239	205248	20 %	20 %	40 %	20 %	145219002
106	NC_009337	TTGGT	2	10	206785	206794	0 %	60 %	40 %	0 %	145219006
107	NC_009337	GGCCG	2	10	208454	208463	0 %	0 %	60 %	40 %	145219006
108	NC_009337	CCTTC	2	10	208540	208549	0 %	40 %	0 %	60 %	145219006
109	NC_009337	CCGCT	2	10	209296	209305	0 %	20 %	20 %	60 %	145219007
110	NC_009337	GCGTG	2	10	210818	210827	0 %	20 %	60 %	20 %	145219008
111	NC_009337	TCATG	2	10	212330	212339	20 %	40 %	20 %	20 %	145219009
112	NC_009337	CATTC	2	10	212840	212849	20 %	40 %	0 %	40 %	145219009
113	NC_009337	TTGAG	2	10	214375	214384	20 %	40 %	40 %	0 %	145219010
114	NC_009337	GGGTG	2	10	215775	215784	0 %	20 %	80 %	0 %	145219012
115	NC_009337	TTTTG	2	10	220618	220627	0 %	80 %	20 %	0 %	145219017
116	NC_009337	GTGGC	2	10	224091	224100	0 %	20 %	60 %	20 %	145219021
117	NC_009337	CGGAA	2	10	225171	225180	40 %	0 %	40 %	20 %	145219022
118	NC_009337	GCCTG	2	10	228069	228078	0 %	20 %	40 %	40 %	145219026
119	NC_009337	TCTGC	2	10	230329	230338	0 %	40 %	20 %	40 %	145219029
120	NC_009337	GTTGA	2	10	231841	231850	20 %	40 %	40 %	0 %	145219030
121	NC_009337	TGCGC	2	10	232172	232181	0 %	20 %	40 %	40 %	145219031
122	NC_009337	TGCTG	2	10	232613	232622	0 %	40 %	40 %	20 %	145219031
123	NC_009337	TTTGC	2	10	233016	233025	0 %	60 %	20 %	20 %	145219031
124	NC_009337	AGAGC	2	10	233097	233106	40 %	0 %	40 %	20 %	145219031
125	NC_009337	GCCGG	2	10	233171	233180	0 %	0 %	60 %	40 %	145219031
126	NC_009337	GCACT	2	10	233601	233610	20 %	20 %	20 %	40 %	145219032
127	NC_009337	GGCCG	2	10	233649	233658	0 %	0 %	60 %	40 %	145219032
128	NC_009337	TTTCT	2	10	234092	234101	0 %	80 %	0 %	20 %	145219032
129	NC_009337	GCAGC	2	10	235195	235204	20 %	0 %	40 %	40 %	145219035
130	NC_009337	TGTGA	2	10	236872	236881	20 %	40 %	40 %	0 %	145219037
131	NC_009337	GCTGT	2	10	238278	238287	0 %	40 %	40 %	20 %	145219039
132	NC_009337	GGAGC	2	10	239818	239827	20 %	0 %	60 %	20 %	145219041
133	NC_009337	AGGAG	2	10	244491	244500	40 %	0 %	60 %	0 %	145219046
134	NC_009337	GACGG	2	10	245318	245327	20 %	0 %	60 %	20 %	145219047
135	NC_009337	TTCCC	2	10	246737	246746	0 %	40 %	0 %	60 %	145219049
136	NC_009337	ACAGT	2	10	247985	247994	40 %	20 %	20 %	20 %	145219051
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139	NC_009337	CCGGT	2	10	250460	250469	0 %	20 %	40 %	40 %	145219053
140	NC_009337	TGGAT	2	10	256044	256053	20 %	40 %	40 %	0 %	145219058
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143	NC_009337	CGGTT	2	10	267980	267989	0 %	40 %	40 %	20 %	145219078
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148	NC_009337	GGCTG	2	10	287733	287742	0 %	20 %	60 %	20 %	145219101
149	NC_009337	AACTG	2	10	293433	293442	40 %	20 %	20 %	20 %	145219105
150	NC_009337	CGGGA	2	10	294437	294446	20 %	0 %	60 %	20 %	145219106
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152	NC_009337	GGAGG	2	10	296321	296330	20 %	0 %	80 %	0 %	145219108
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164	NC_009337	TACGG	2	10	315624	315633	20 %	20 %	40 %	20 %	145219128
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248	NC_009337	AGGGT	2	10	455950	455959	20 %	20 %	60 %	0 %	145219240
249	NC_009337	CTCGC	2	10	457296	457305	0 %	20 %	20 %	60 %	145219241
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251	NC_009337	AGGGG	2	10	461797	461806	20 %	0 %	80 %	0 %	145219242
252	NC_009337	GGCCG	2	10	462359	462368	0 %	0 %	60 %	40 %	145219242
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259	NC_009337	ACACC	2	10	474861	474870	40 %	0 %	0 %	60 %	145219249
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261	NC_009337	ACAGC	2	10	476813	476822	40 %	0 %	20 %	40 %	145219250
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263	NC_009337	CGACA	2	10	478059	478068	40 %	0 %	20 %	40 %	145219250
264	NC_009337	CGACA	2	10	478683	478692	40 %	0 %	20 %	40 %	145219250
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