MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	AGTGTA	2	12	21851	21862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009332	ACTAAT	2	12	21879	21890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009332	AGTGTA	2	12	27852	27863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009332	ACTAAT	2	12	27880	27891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009332	ATATCG	2	12	44354	44365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009332	TATTTT	2	12	65425	65436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009332	AGTGTA	2	12	86476	86487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009332	ACTAAT	2	12	86504	86515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009332	TTCGGG	2	12	87446	87457	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009332	TTGTCT	2	12	88842	88853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009332	ATAAAA	2	12	114610	114621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009332	AGATAA	2	12	125394	125405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009332	AGATAA	2	12	136817	136828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009332	CTTTAT	2	12	161729	161740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009332	CTCTTT	2	12	163593	163604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009332	TGACAC	2	12	182324	182335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009332	CAGTTC	2	12	188049	188060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009332	TTTAAA	2	12	189897	189908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009332	AGTGTA	2	12	263822	263833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009332	ACTAAT	2	12	263850	263861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009332	TTTTTC	2	12	270182	270193	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009332	AGAAAA	2	12	272878	272889	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009332	TTGTTA	2	12	275266	275277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009332	AAAGCA	2	12	289211	289222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009332	GTTTTT	2	12	296588	296599	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009332	AATATT	2	12	304928	304939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009332	AAAGGA	2	12	371021	371032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009332	AGAAAA	2	12	371823	371834	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009332	TGGAAT	2	12	373474	373485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009332	ATGTTC	2	12	387789	387800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009332	GTAGTT	2	12	398082	398093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009332	AACAAT	2	12	402327	402338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009332	ACAACT	2	12	424460	424471	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009332	GGTATT	2	12	474929	474940	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009332	AAAATA	2	12	483948	483959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009332	GAATTG	2	12	485020	485031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009332	AGTGTA	2	12	509576	509587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009332	ACTAAT	2	12	509604	509615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009332	ATTGAG	2	12	510917	510928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009332	GTTTCA	2	12	510934	510945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009332	GTAGCT	2	12	522547	522558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009332	CTGTTC	2	12	527331	527342	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009332	CAAAGA	2	12	528687	528698	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009332	AAGCTA	2	12	533188	533199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009332	GAGAAG	2	12	556523	556534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009332	TAAAAA	2	12	601184	601195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009332	CTTAAG	2	12	613135	613146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009332	ATTCTA	2	12	620990	621001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009332	AAAGTC	2	12	637339	637350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_009332	CCAAGG	2	12	697551	697562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009332	AAAAAG	2	12	729538	729549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009332	ATAAAA	2	12	755971	755982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009332	AAGACT	2	12	756994	757005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009332	TATTGA	2	12	766193	766204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009332	TCATAT	2	12	776734	776745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009332	AAAACA	2	12	801921	801932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_009332	TTTAAA	2	12	831343	831354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009332	TTGTTA	2	12	893130	893141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009332	TTTTAA	2	12	941051	941062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009332	CCTTTT	2	12	972483	972494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009332	CTCTTT	2	12	995832	995843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009332	TTTACG	2	12	996120	996131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009332	TTCAGA	2	12	1007837	1007848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009332	CAAACG	2	12	1007868	1007879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009332	GCTATT	2	12	1008214	1008225	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009332	ATATTT	2	12	1057807	1057818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009332	TTACCT	2	12	1126130	1126141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009332	TATTTA	2	12	1136937	1136948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	TTATTT	2	12	1305832	1305843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009332	CTTTTT	2	12	1329713	1329724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009332	TCTTTT	2	12	1358033	1358044	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009332	CAAAAA	2	12	1365195	1365206	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009332	AGTCCT	2	12	1377635	1377646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009332	AAAACT	2	12	1384858	1384869	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009332	TCTAGA	2	12	1393787	1393798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009332	TAACAT	2	12	1394848	1394859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009332	TTACTC	2	12	1398669	1398680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009332	TAAAAT	2	12	1404458	1404469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009332	ATTTCT	2	12	1440146	1440157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_009332	ACTTTT	2	12	1466759	1466770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_009332	ATTTAA	2	12	1474045	1474056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009332	CAAAGC	2	12	1492054	1492065	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009332	ATTAAA	2	12	1532191	1532202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009332	TATTAG	2	12	1569670	1569681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009332	TACACT	2	12	1569699	1569710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009332	GTTAAA	2	12	1584810	1584821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009332	TTTTCA	2	12	1616673	1616684	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_009332	ATGACA	2	12	1639517	1639528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009332	AGAAAA	2	12	1674648	1674659	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009332	AGAAAA	2	12	1674740	1674751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009332	CCTTTA	2	12	1702235	1702246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009332	ATTTTA	2	12	1756493	1756504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009332	ACATTC	2	12	1772537	1772548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009332	CTAAAA	2	12	1773808	1773819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009332	TTTTCA	2	12	1775991	1776002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009332	TAAAAA	2	12	1787971	1787982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009332	TGACAT	2	12	1790156	1790167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009332	AATTTA	3	18	1799432	1799449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009332	GAAAAA	2	12	1836892	1836903	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.