MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	139472890
2	NC_009332	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	139472891
3	NC_009332	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	139472892
4	NC_009332	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	139472894
5	NC_009332	TCAAT	2	10	11646	11655	40 %	40 %	0 %	20 %	139472899
6	NC_009332	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	139472899
7	NC_009332	TACAC	2	10	15914	15923	40 %	20 %	0 %	40 %	139472902
8	NC_009332	TAAAT	2	10	15924	15933	60 %	40 %	0 %	0 %	139472902
9	NC_009332	ACATT	2	10	16491	16500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009332	TCGTG	2	10	18112	18121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009332	GTTAA	2	10	19008	19017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009332	GGGAG	2	10	19527	19536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009332	AGGGA	2	10	21738	21747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009332	GCTTA	2	10	22104	22113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009332	TCGTG	2	10	24113	24122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009332	GTTAA	2	10	25009	25018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009332	GGGAG	2	10	25528	25537	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009332	AGGGA	2	10	27739	27748	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009332	GCTTA	2	10	28105	28114	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009332	TTCTT	2	10	29835	29844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009332	TATAA	2	10	32261	32270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009332	AGTGA	2	10	33008	33017	40 %	20 %	40 %	0 %	139472904
23	NC_009332	ATTTT	2	10	33707	33716	20 %	80 %	0 %	0 %	139472905
24	NC_009332	TTGAT	2	10	33896	33905	20 %	60 %	20 %	0 %	139472905
25	NC_009332	TGGTG	2	10	35980	35989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009332	AGCGA	2	10	40386	40395	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009332	AGCAG	2	10	43302	43311	40 %	0 %	40 %	20 %	139472911
28	NC_009332	GGTCA	2	10	43666	43675	20 %	20 %	40 %	20 %	139472911
29	NC_009332	TTGGG	2	10	44062	44071	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009332	GCAGG	2	10	48143	48152	20 %	0 %	60 %	20 %	139472913
31	NC_009332	CTGCC	2	10	49107	49116	0 %	20 %	20 %	60 %	139472915
32	NC_009332	CTCAG	2	10	49500	49509	20 %	20 %	20 %	40 %	139472915
33	NC_009332	TGTAT	2	10	53678	53687	20 %	60 %	20 %	0 %	139472918
34	NC_009332	TATTT	2	10	53757	53766	20 %	80 %	0 %	0 %	139472918
35	NC_009332	TCGGA	2	10	54106	54115	20 %	20 %	40 %	20 %	139472919
36	NC_009332	GCTTT	2	10	56851	56860	0 %	60 %	20 %	20 %	139472922
37	NC_009332	TTTTC	2	10	57049	57058	0 %	80 %	0 %	20 %	139472922
38	NC_009332	AAACC	2	10	57114	57123	60 %	0 %	0 %	40 %	139472922
39	NC_009332	ATGGT	2	10	58887	58896	20 %	40 %	40 %	0 %	139472923
40	NC_009332	ATTCA	2	10	59571	59580	40 %	40 %	0 %	20 %	139472923
41	NC_009332	ATTTT	2	10	60836	60845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009332	AAATA	2	10	62103	62112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009332	TATAT	2	10	62188	62197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009332	TTTTA	2	10	63342	63351	20 %	80 %	0 %	0 %	139472925
45	NC_009332	AAAGC	2	10	63535	63544	60 %	0 %	20 %	20 %	139472925
46	NC_009332	TTTGG	2	10	68608	68617	0 %	60 %	40 %	0 %	139472932
47	NC_009332	TTCAC	2	10	68964	68973	20 %	40 %	0 %	40 %	139472933
48	NC_009332	GAAAT	2	10	70045	70054	60 %	20 %	20 %	0 %	139472935
49	NC_009332	AAGGA	2	10	71125	71134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009332	TCCAA	2	10	75745	75754	40 %	20 %	0 %	40 %	139472947
51	NC_009332	GTTTC	2	10	78394	78403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009332	AACAA	2	10	81223	81232	80 %	0 %	0 %	20 %	139472955
53	NC_009332	TCGTG	2	10	82737	82746	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009332	GTTAA	2	10	83633	83642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009332	GGGAG	2	10	84152	84161	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009332	AGGGA	2	10	86363	86372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009332	GCTTA	2	10	86729	86738	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009332	ATTAT	2	10	87019	87028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009332	TATAT	2	10	87102	87111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009332	CTTGG	2	10	91045	91054	0 %	40 %	40 %	20 %	139472958
61	NC_009332	TCTTA	2	10	91463	91472	20 %	60 %	0 %	20 %	139472958
62	NC_009332	CACTC	2	10	93007	93016	20 %	20 %	0 %	60 %	139472959
63	NC_009332	GATTG	2	10	95268	95277	20 %	40 %	40 %	0 %	139472960
64	NC_009332	TTGAT	2	10	105427	105436	20 %	60 %	20 %	0 %	139472965
65	NC_009332	AAATC	2	10	105595	105604	60 %	20 %	0 %	20 %	139472965
66	NC_009332	TGAAG	2	10	110911	110920	40 %	20 %	40 %	0 %	139472974
67	NC_009332	AGAAA	2	10	112352	112361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009332	TAGTT	2	10	112623	112632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	TTTAG	2	10	112770	112779	20 %	60 %	20 %	0 %	139472977
70	NC_009332	GTGTT	2	10	117173	117182	0 %	60 %	40 %	0 %	139472983
71	NC_009332	TTGAA	2	10	117462	117471	40 %	40 %	20 %	0 %	139472984
72	NC_009332	TTTAG	2	10	119338	119347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009332	CTACA	2	10	122288	122297	40 %	20 %	0 %	40 %	139472987
74	NC_009332	AAAGA	2	10	122322	122331	80 %	0 %	20 %	0 %	139472987
75	NC_009332	AGGAG	2	10	126007	126016	40 %	0 %	60 %	0 %	139472991
76	NC_009332	TAATT	2	10	126834	126843	40 %	60 %	0 %	0 %	139472991
77	NC_009332	TCAGG	2	10	127297	127306	20 %	20 %	40 %	20 %	139472991
78	NC_009332	TTTTA	2	10	129068	129077	20 %	80 %	0 %	0 %	139472993
79	NC_009332	GCTTT	3	15	129644	129658	0 %	60 %	20 %	20 %	139472993
80	NC_009332	GTCAT	2	10	129963	129972	20 %	40 %	20 %	20 %	139472993
81	NC_009332	TAGTG	2	10	130907	130916	20 %	40 %	40 %	0 %	139472994
82	NC_009332	GTTAA	2	10	131310	131319	40 %	40 %	20 %	0 %	139472994
83	NC_009332	AATAA	2	10	131339	131348	80 %	20 %	0 %	0 %	139472994
84	NC_009332	TTGAT	2	10	132426	132435	20 %	60 %	20 %	0 %	139472995
85	NC_009332	TTGAC	2	10	133648	133657	20 %	40 %	20 %	20 %	139472997
86	NC_009332	TACCT	2	10	133829	133838	20 %	40 %	0 %	40 %	139472997
87	NC_009332	AATCA	2	10	134608	134617	60 %	20 %	0 %	20 %	139472998
88	NC_009332	TCATG	2	10	135215	135224	20 %	40 %	20 %	20 %	139472999
89	NC_009332	AACAA	2	10	136361	136370	80 %	0 %	0 %	20 %	139473000
90	NC_009332	TTGGC	2	10	136446	136455	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009332	CAAAA	2	10	137576	137585	80 %	0 %	0 %	20 %	139473002
92	NC_009332	TTTTA	2	10	138649	138658	20 %	80 %	0 %	0 %	139473002
93	NC_009332	AAAGC	2	10	139837	139846	60 %	0 %	20 %	20 %	139473004
94	NC_009332	AGTTC	2	10	140087	140096	20 %	40 %	20 %	20 %	139473004
95	NC_009332	GCTGA	2	10	140107	140116	20 %	20 %	40 %	20 %	139473004
96	NC_009332	ATCGC	2	10	143481	143490	20 %	20 %	20 %	40 %	139473007
97	NC_009332	TTGGG	2	10	144884	144893	0 %	40 %	60 %	0 %	139473008
98	NC_009332	GTACG	2	10	149275	149284	20 %	20 %	40 %	20 %	139473012
99	NC_009332	GAAAA	2	10	150194	150203	80 %	0 %	20 %	0 %	139473013
100	NC_009332	GGATT	2	10	150311	150320	20 %	40 %	40 %	0 %	139473013
101	NC_009332	TTTTG	2	10	150831	150840	0 %	80 %	20 %	0 %	139473013
102	NC_009332	TCATG	2	10	152338	152347	20 %	40 %	20 %	20 %	139473015
103	NC_009332	GTATC	2	10	153599	153608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009332	GTCGC	2	10	154038	154047	0 %	20 %	40 %	40 %	139473017
105	NC_009332	ATTAT	2	10	156118	156127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009332	CTTGT	2	10	158679	158688	0 %	60 %	20 %	20 %	139473021
107	NC_009332	GCAAC	2	10	159613	159622	40 %	0 %	20 %	40 %	139473022
108	NC_009332	AAGGT	2	10	161295	161304	40 %	20 %	40 %	0 %	139473022
109	NC_009332	CGTCA	2	10	161492	161501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009332	AACAA	2	10	163231	163240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009332	ATTTG	2	10	167579	167588	20 %	60 %	20 %	0 %	139473030
112	NC_009332	CAAGA	2	10	169501	169510	60 %	0 %	20 %	20 %	139473031
113	NC_009332	TTTGG	2	10	170669	170678	0 %	60 %	40 %	0 %	139473032
114	NC_009332	TGGAT	2	10	171618	171627	20 %	40 %	40 %	0 %	139473033
115	NC_009332	TTGCC	2	10	171993	172002	0 %	40 %	20 %	40 %	139473033
116	NC_009332	CCTAA	2	10	172691	172700	40 %	20 %	0 %	40 %	139473033
117	NC_009332	GGAAA	2	10	177720	177729	60 %	0 %	40 %	0 %	139473037
118	NC_009332	TAATC	2	10	180546	180555	40 %	40 %	0 %	20 %	139473041
119	NC_009332	TCTAA	2	10	183828	183837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009332	TTTAC	2	10	185763	185772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009332	AGATA	2	10	188395	188404	60 %	20 %	20 %	0 %	139473049
122	NC_009332	ATATA	2	10	189184	189193	60 %	40 %	0 %	0 %	139473049
123	NC_009332	TTAAA	2	10	189695	189704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009332	GTTTT	2	10	191141	191150	0 %	80 %	20 %	0 %	139473053
125	NC_009332	TTTTG	2	10	193071	193080	0 %	80 %	20 %	0 %	139473054
126	NC_009332	TTTTA	2	10	195557	195566	20 %	80 %	0 %	0 %	139473057
127	NC_009332	CTAAT	2	10	195795	195804	40 %	40 %	0 %	20 %	139473057
128	NC_009332	GAATG	2	10	196318	196327	40 %	20 %	40 %	0 %	139473057
129	NC_009332	TGTCT	2	10	198812	198821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009332	TAAGA	2	10	200329	200338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009332	CCTTC	2	10	200744	200753	0 %	40 %	0 %	60 %	139473061
132	NC_009332	GCTAA	2	10	200787	200796	40 %	20 %	20 %	20 %	139473061
133	NC_009332	TGGAT	2	10	202878	202887	20 %	40 %	40 %	0 %	139473063
134	NC_009332	CTTTT	2	10	203048	203057	0 %	80 %	0 %	20 %	139473063
135	NC_009332	GTAAA	2	10	203471	203480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009332	GAGAA	2	10	204419	204428	60 %	0 %	40 %	0 %	139473064
137	NC_009332	GTTAT	2	10	205444	205453	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009332	AAGAT	2	10	205530	205539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009332	AAATG	2	10	207077	207086	60 %	20 %	20 %	0 %	139473065
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141	NC_009332	CCTTT	2	10	212589	212598	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_009332	CTCAT	2	10	212668	212677	20 %	40 %	0 %	40 %	139473072
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