MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	ACATT	2	10	16491	16500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009332	TCGTG	2	10	18112	18121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009332	GTTAA	2	10	19008	19017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009332	GGGAG	2	10	19527	19536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009332	AGGGA	2	10	21738	21747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009332	GCTTA	2	10	22104	22113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009332	TCGTG	2	10	24113	24122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009332	GTTAA	2	10	25009	25018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009332	GGGAG	2	10	25528	25537	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009332	AGGGA	2	10	27739	27748	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009332	GCTTA	2	10	28105	28114	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009332	TTCTT	2	10	29835	29844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009332	TATAA	2	10	32261	32270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009332	TGGTG	2	10	35980	35989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009332	AGCGA	2	10	40386	40395	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009332	TTGGG	2	10	44062	44071	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009332	ATTTT	2	10	60836	60845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009332	AAATA	2	10	62103	62112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009332	TATAT	2	10	62188	62197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009332	AAGGA	2	10	71125	71134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009332	GTTTC	2	10	78394	78403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009332	TCGTG	2	10	82737	82746	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009332	GTTAA	2	10	83633	83642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009332	GGGAG	2	10	84152	84161	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009332	AGGGA	2	10	86363	86372	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009332	GCTTA	2	10	86729	86738	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009332	ATTAT	2	10	87019	87028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009332	TATAT	2	10	87102	87111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009332	AGAAA	2	10	112352	112361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009332	TAGTT	2	10	112623	112632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009332	TTTAG	2	10	119338	119347	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009332	TTGGC	2	10	136446	136455	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009332	GTATC	2	10	153599	153608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009332	ATTAT	2	10	156118	156127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009332	CGTCA	2	10	161492	161501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009332	AACAA	2	10	163231	163240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009332	TCTAA	2	10	183828	183837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009332	TTTAC	2	10	185763	185772	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009332	TTAAA	2	10	189695	189704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009332	TGTCT	2	10	198812	198821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009332	TAAGA	2	10	200329	200338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009332	GTAAA	2	10	203471	203480	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009332	GTTAT	2	10	205444	205453	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009332	AAGAT	2	10	205530	205539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009332	CCTTT	2	10	212589	212598	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009332	GTTCA	2	10	220688	220697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009332	TCATT	2	10	250408	250417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009332	TTGTA	2	10	257031	257040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009332	TCGTG	2	10	260083	260092	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009332	GTTAA	2	10	260979	260988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009332	GGGAG	2	10	261498	261507	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009332	AGGGA	2	10	263709	263718	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009332	ATAGA	2	10	275416	275425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009332	TAAAT	2	10	279161	279170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009332	TTAAT	2	10	296915	296924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009332	TTATA	2	10	300987	300996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009332	CATTT	2	10	306862	306871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009332	TTTAT	2	10	319722	319731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009332	AAAAG	2	10	321722	321731	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009332	TATAA	2	10	325521	325530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009332	ATAAA	2	10	334244	334253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009332	ATTAA	2	10	339527	339536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009332	GAAAG	2	10	341811	341820	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009332	TCTAT	2	10	367375	367384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009332	CTAAA	2	10	369474	369483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009332	ATCAC	2	10	372878	372887	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009332	AGTTT	2	10	373284	373293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009332	TTGAT	2	10	385104	385113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	AATTA	2	10	402160	402169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009332	TTTAC	2	10	403957	403966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009332	GGAAA	2	10	416301	416310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009332	TGCGG	2	10	416671	416680	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009332	CAAAA	2	10	420952	420961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009332	AAACA	2	10	421894	421903	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009332	AAGGC	2	10	424403	424412	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009332	GATAA	2	10	427043	427052	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009332	AACAA	2	10	430383	430392	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009332	ATAGA	2	10	431391	431400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009332	ATAGA	2	10	434392	434401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009332	TATCT	2	10	436015	436024	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009332	GAAAG	2	10	439663	439672	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009332	AGTCA	2	10	439757	439766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009332	TTTTA	2	10	440121	440130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009332	AAAAT	2	10	450998	451007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009332	TAATT	2	10	451089	451098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009332	ACCAA	2	10	454167	454176	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009332	TAGAA	2	10	469672	469681	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009332	TTTGC	2	10	481536	481545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009332	CCCCT	2	10	481606	481615	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_009332	TCGTG	2	10	505837	505846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009332	GTTAA	2	10	506733	506742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009332	GGGAG	2	10	507252	507261	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009332	AGGGA	2	10	509463	509472	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009332	GCTTA	2	10	509829	509838	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009332	ATTAT	2	10	510408	510417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009332	TAAAA	2	10	516817	516826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009332	TATTT	2	10	526929	526938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009332	AACTA	2	10	528624	528633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009332	TGGTG	2	10	532739	532748	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009332	AGAAA	2	10	533442	533451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009332	GGTAA	2	10	538973	538982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009332	AAAAC	2	10	540504	540513	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_009332	AAAAG	2	10	540796	540805	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009332	GACAG	2	10	546877	546886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009332	GCTAT	2	10	547403	547412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009332	ATTAT	2	10	554098	554107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009332	ATAAA	2	10	556426	556435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009332	GAAAA	2	10	556487	556496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009332	CTTGT	2	10	582123	582132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009332	CAAAA	2	10	584845	584854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009332	GAGTT	2	10	594044	594053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009332	TTTAA	2	10	604208	604217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009332	CTTTT	2	10	608302	608311	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009332	TCCAT	2	10	611907	611916	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009332	CCTTT	2	10	634913	634922	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009332	GTTTA	2	10	634966	634975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009332	GTATT	2	10	637895	637904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009332	CTTTT	2	10	639474	639483	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_009332	TAAAA	2	10	639487	639496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009332	AAAAC	2	10	656937	656946	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009332	TAACG	2	10	657513	657522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009332	GAAAG	2	10	662349	662358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009332	TAAGA	2	10	687335	687344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009332	TTAAA	2	10	694076	694085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009332	ATATG	2	10	694866	694875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009332	ATTCA	2	10	698489	698498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009332	TAGAA	2	10	714737	714746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009332	TCAAT	2	10	715289	715298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009332	CTATT	2	10	723215	723224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009332	ATTAC	2	10	726775	726784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009332	TTAAC	2	10	741894	741903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009332	GTTTT	2	10	743330	743339	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009332	GTATA	2	10	749891	749900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009332	GAAAA	2	10	749925	749934	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009332	GTGAT	2	10	750049	750058	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009332	ACTTG	2	10	752902	752911	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009332	TTATT	2	10	755834	755843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009332	TACTA	2	10	768677	768686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009332	TTCTT	2	10	770213	770222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009332	GCAGG	2	10	779356	779365	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009332	AACAT	2	10	790097	790106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009332	TTATA	2	10	792207	792216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009332	TAAAG	2	10	792282	792291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009332	GTCAA	2	10	798341	798350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_009332	CTACT	2	10	819443	819452	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_009332	GTTAT	2	10	825682	825691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009332	TAAAT	2	10	831372	831381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009332	TAGAA	2	10	842104	842113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009332	CAAAG	2	10	859733	859742	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_009332	GAAAG	2	10	872318	872327	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009332	TAGAA	2	10	884521	884530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009332	AATGG	2	10	884609	884618	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009332	CAATT	2	10	889102	889111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_009332	ACATA	2	10	892812	892821	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_009332	CTAAA	2	10	894470	894479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_009332	CAACT	2	10	910072	910081	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_009332	ATGTG	2	10	1103345	1103354	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_009332	ATTCA	2	10	1108523	1108532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_009332	AACAT	2	10	1132344	1132353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_009332	TAAAA	2	10	1137238	1137247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_009332	TCTTT	2	10	1169376	1169385	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_009332	ATCTT	2	10	1629597	1629606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_009332	CTCAT	2	10	1689173	1689182	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_009332	ATTAG	2	10	1689776	1689785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_009332	AGAAC	2	10	1836667	1836676	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
322	NC_009332	AAAAG	2	10	1839074	1839083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
323	NC_009332	CTTTT	2	10	1839105	1839114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.