MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 3851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	139472889
2	NC_009332	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	139472889
3	NC_009332	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
4	NC_009332	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
5	NC_009332	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
6	NC_009332	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
7	NC_009332	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
8	NC_009332	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	139472890
9	NC_009332	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
10	NC_009332	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	139472892
11	NC_009332	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	139472892
12	NC_009332	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	139472892
13	NC_009332	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	139472893
14	NC_009332	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
15	NC_009332	ACGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	139472894
16	NC_009332	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	139472894
17	NC_009332	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	139472894
18	NC_009332	TGAT	2	8	7419	7426	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
19	NC_009332	ACCA	2	8	7576	7583	50 %	0 %	0 %	50 %	139472894
20	NC_009332	AAAG	2	8	7708	7715	75 %	0 %	25 %	0 %	139472894
21	NC_009332	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
22	NC_009332	TCGG	2	8	8144	8151	0 %	25 %	50 %	25 %	139472894
23	NC_009332	AGCA	2	8	8192	8199	50 %	0 %	25 %	25 %	139472894
24	NC_009332	AATC	2	8	8236	8243	50 %	25 %	0 %	25 %	139472894
25	NC_009332	TCAA	2	8	8326	8333	50 %	25 %	0 %	25 %	139472894
26	NC_009332	AAAT	2	8	9027	9034	75 %	25 %	0 %	0 %	139472895
27	NC_009332	AAGA	2	8	9173	9180	75 %	0 %	25 %	0 %	139472896
28	NC_009332	GGAT	2	8	9236	9243	25 %	25 %	50 %	0 %	139472896
29	NC_009332	TATT	2	8	9264	9271	25 %	75 %	0 %	0 %	139472896
30	NC_009332	TCAA	2	8	9759	9766	50 %	25 %	0 %	25 %	139472898
31	NC_009332	CAAA	2	8	10123	10130	75 %	0 %	0 %	25 %	139472898
32	NC_009332	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	139472898
33	NC_009332	AAAT	2	8	10860	10867	75 %	25 %	0 %	0 %	139472898
34	NC_009332	CAAA	2	8	11093	11100	75 %	0 %	0 %	25 %	139472899
35	NC_009332	TTCA	2	8	11529	11536	25 %	50 %	0 %	25 %	139472899
36	NC_009332	AGTT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	25 %	0 %	139472899
37	NC_009332	TTTA	2	8	11948	11955	25 %	75 %	0 %	0 %	139472899
38	NC_009332	TTTA	2	8	12035	12042	25 %	75 %	0 %	0 %	139472899
39	NC_009332	GAAG	2	8	12481	12488	50 %	0 %	50 %	0 %	139472900
40	NC_009332	TGTT	2	8	12639	12646	0 %	75 %	25 %	0 %	139472900
41	NC_009332	ATTA	2	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	139472901
42	NC_009332	GAAA	2	8	13104	13111	75 %	0 %	25 %	0 %	139472901
43	NC_009332	TCAA	2	8	13302	13309	50 %	25 %	0 %	25 %	139472901
44	NC_009332	GTTC	2	8	13576	13583	0 %	50 %	25 %	25 %	139472901
45	NC_009332	ATGG	2	8	13723	13730	25 %	25 %	50 %	0 %	139472901
46	NC_009332	GTTG	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	139472901
47	NC_009332	AAAG	2	8	14070	14077	75 %	0 %	25 %	0 %	139472901
48	NC_009332	TGAT	2	8	14498	14505	25 %	50 %	25 %	0 %	139472901
49	NC_009332	ATTG	2	8	14583	14590	25 %	50 %	25 %	0 %	139472901
50	NC_009332	TTTA	2	8	15645	15652	25 %	75 %	0 %	0 %	139472902
51	NC_009332	GTAT	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	139472902
52	NC_009332	ATAA	2	8	16463	16470	75 %	25 %	0 %	0 %	139472902
53	NC_009332	AAGT	2	8	31116	31123	50 %	25 %	25 %	0 %	139472903
54	NC_009332	AAGC	2	8	31424	31431	50 %	0 %	25 %	25 %	139472903
55	NC_009332	TGGT	2	8	32095	32102	0 %	50 %	50 %	0 %	139472903
56	NC_009332	ATTT	2	8	32122	32129	25 %	75 %	0 %	0 %	139472903
57	NC_009332	TTGA	2	8	33056	33063	25 %	50 %	25 %	0 %	139472904
58	NC_009332	TGAT	2	8	33069	33076	25 %	50 %	25 %	0 %	139472904
59	NC_009332	TTCT	2	8	33159	33166	0 %	75 %	0 %	25 %	139472904
60	NC_009332	CATT	2	8	34253	34260	25 %	50 %	0 %	25 %	139472905
61	NC_009332	GTTT	2	8	34721	34728	0 %	75 %	25 %	0 %	139472906
62	NC_009332	TAAT	2	8	35144	35151	50 %	50 %	0 %	0 %	139472906
63	NC_009332	GTAC	2	8	35329	35336	25 %	25 %	25 %	25 %	139472906
64	NC_009332	AACA	2	8	35478	35485	75 %	0 %	0 %	25 %	139472907
65	NC_009332	TTAG	2	8	35638	35645	25 %	50 %	25 %	0 %	139472907
66	NC_009332	AATC	2	8	37231	37238	50 %	25 %	0 %	25 %	139472908
67	NC_009332	TACT	2	8	37277	37284	25 %	50 %	0 %	25 %	139472908
68	NC_009332	CTTG	2	8	37955	37962	0 %	50 %	25 %	25 %	139472908
69	NC_009332	GCAC	2	8	38499	38506	25 %	0 %	25 %	50 %	139472908
70	NC_009332	CCAA	2	8	39955	39962	50 %	0 %	0 %	50 %	139472908
71	NC_009332	TTGG	2	8	40010	40017	0 %	50 %	50 %	0 %	139472908
72	NC_009332	ACTT	2	8	40658	40665	25 %	50 %	0 %	25 %	139472909
73	NC_009332	AATC	2	8	40778	40785	50 %	25 %	0 %	25 %	139472909
74	NC_009332	TGAT	2	8	41643	41650	25 %	50 %	25 %	0 %	139472909
75	NC_009332	AATT	2	8	41793	41800	50 %	50 %	0 %	0 %	139472909
76	NC_009332	TTGA	2	8	41876	41883	25 %	50 %	25 %	0 %	139472909
77	NC_009332	TGCT	2	8	42273	42280	0 %	50 %	25 %	25 %	139472910
78	NC_009332	AGTT	2	8	43317	43324	25 %	50 %	25 %	0 %	139472911
79	NC_009332	CCTG	2	8	43563	43570	0 %	25 %	25 %	50 %	139472911
80	NC_009332	ATTA	2	8	46719	46726	50 %	50 %	0 %	0 %	139472912
81	NC_009332	CAAT	2	8	50145	50152	50 %	25 %	0 %	25 %	139472916
82	NC_009332	ATTA	2	8	50536	50543	50 %	50 %	0 %	0 %	139472916
83	NC_009332	AAGC	2	8	50556	50563	50 %	0 %	25 %	25 %	139472916
84	NC_009332	AGCA	2	8	50811	50818	50 %	0 %	25 %	25 %	139472916
85	NC_009332	ATAA	2	8	50885	50892	75 %	25 %	0 %	0 %	139472916
86	NC_009332	CAAA	2	8	50920	50927	75 %	0 %	0 %	25 %	139472916
87	NC_009332	ATTG	2	8	50990	50997	25 %	50 %	25 %	0 %	139472916
88	NC_009332	AAAT	2	8	51557	51564	75 %	25 %	0 %	0 %	139472917
89	NC_009332	TTGG	2	8	51572	51579	0 %	50 %	50 %	0 %	139472917
90	NC_009332	CAAG	2	8	51824	51831	50 %	0 %	25 %	25 %	139472917
91	NC_009332	TTGA	2	8	52461	52468	25 %	50 %	25 %	0 %	139472917
92	NC_009332	ATTG	2	8	52586	52593	25 %	50 %	25 %	0 %	139472917
93	NC_009332	TAAG	2	8	53069	53076	50 %	25 %	25 %	0 %	139472918
94	NC_009332	ATCT	2	8	53388	53395	25 %	50 %	0 %	25 %	139472918
95	NC_009332	ATTT	2	8	53540	53547	25 %	75 %	0 %	0 %	139472918
96	NC_009332	CTAT	2	8	53701	53708	25 %	50 %	0 %	25 %	139472918
97	NC_009332	TGTC	2	8	54410	54417	0 %	50 %	25 %	25 %	139472919
98	NC_009332	ATTG	2	8	54519	54526	25 %	50 %	25 %	0 %	139472919
99	NC_009332	ACGA	2	8	54858	54865	50 %	0 %	25 %	25 %	139472919
100	NC_009332	TGTC	2	8	55214	55221	0 %	50 %	25 %	25 %	139472920
101	NC_009332	ATTA	2	8	55374	55381	50 %	50 %	0 %	0 %	139472920
102	NC_009332	ATCT	2	8	55509	55516	25 %	50 %	0 %	25 %	139472920
103	NC_009332	TTAG	2	8	55578	55585	25 %	50 %	25 %	0 %	139472920
104	NC_009332	GATA	2	8	55659	55666	50 %	25 %	25 %	0 %	139472921
105	NC_009332	AATG	2	8	55839	55846	50 %	25 %	25 %	0 %	139472921
106	NC_009332	TTGA	2	8	56199	56206	25 %	50 %	25 %	0 %	139472922
107	NC_009332	TTTG	2	8	56499	56506	0 %	75 %	25 %	0 %	139472922
108	NC_009332	ATTT	2	8	56637	56644	25 %	75 %	0 %	0 %	139472922
109	NC_009332	CTAT	2	8	56840	56847	25 %	50 %	0 %	25 %	139472922
110	NC_009332	ATTT	2	8	57448	57455	25 %	75 %	0 %	0 %	139472922
111	NC_009332	TCTA	2	8	57479	57486	25 %	50 %	0 %	25 %	139472922
112	NC_009332	TAAA	2	8	57824	57831	75 %	25 %	0 %	0 %	139472922
113	NC_009332	GGTG	2	8	58471	58478	0 %	25 %	75 %	0 %	139472923
114	NC_009332	AACA	2	8	62671	62678	75 %	0 %	0 %	25 %	139472925
115	NC_009332	TCGG	2	8	62722	62729	0 %	25 %	50 %	25 %	139472925
116	NC_009332	TTGG	2	8	62800	62807	0 %	50 %	50 %	0 %	139472925
117	NC_009332	TCTA	2	8	62959	62966	25 %	50 %	0 %	25 %	139472925
118	NC_009332	TTCT	2	8	63680	63687	0 %	75 %	0 %	25 %	139472925
119	NC_009332	CAAA	2	8	65008	65015	75 %	0 %	0 %	25 %	139472926
120	NC_009332	GGTT	2	8	65709	65716	0 %	50 %	50 %	0 %	139472927
121	NC_009332	AAAC	2	8	66021	66028	75 %	0 %	0 %	25 %	139472927
122	NC_009332	TCGT	2	8	67955	67962	0 %	50 %	25 %	25 %	139472930
123	NC_009332	GACG	2	8	68275	68282	25 %	0 %	50 %	25 %	139472931
124	NC_009332	CAAA	2	8	68543	68550	75 %	0 %	0 %	25 %	139472932
125	NC_009332	AAGA	2	8	69916	69923	75 %	0 %	25 %	0 %	139472935
126	NC_009332	TCGT	2	8	70257	70264	0 %	50 %	25 %	25 %	139472936
127	NC_009332	TCGT	2	8	70551	70558	0 %	50 %	25 %	25 %	139472937
128	NC_009332	AATC	2	8	71360	71367	50 %	25 %	0 %	25 %	139472939
129	NC_009332	TGAC	2	8	72044	72051	25 %	25 %	25 %	25 %	139472941
130	NC_009332	TGAC	2	8	72374	72381	25 %	25 %	25 %	25 %	139472941
131	NC_009332	ACTC	2	8	72733	72740	25 %	25 %	0 %	50 %	139472942
132	NC_009332	TACG	2	8	73139	73146	25 %	25 %	25 %	25 %	139472942
133	NC_009332	TGGT	2	8	73877	73884	0 %	50 %	50 %	0 %	139472944
134	NC_009332	TTAG	2	8	75191	75198	25 %	50 %	25 %	0 %	139472947
135	NC_009332	AAAT	2	8	77104	77111	75 %	25 %	0 %	0 %	139472948
136	NC_009332	ACAA	2	8	77568	77575	75 %	0 %	0 %	25 %	139472950
137	NC_009332	ACTT	2	8	77658	77665	25 %	50 %	0 %	25 %	139472951
138	NC_009332	GTAG	2	8	78963	78970	25 %	25 %	50 %	0 %	139472953
139	NC_009332	GAAA	2	8	79121	79128	75 %	0 %	25 %	0 %	139472953
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