MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 25226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009332	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009332	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
4	NC_009332	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
5	NC_009332	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
6	NC_009332	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472889
7	NC_009332	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
8	NC_009332	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
9	NC_009332	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
10	NC_009332	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
11	NC_009332	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
12	NC_009332	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
13	NC_009332	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
14	NC_009332	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
15	NC_009332	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139472889
16	NC_009332	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
17	NC_009332	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
18	NC_009332	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
19	NC_009332	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472889
20	NC_009332	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
21	NC_009332	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009332	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009332	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009332	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009332	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
26	NC_009332	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472890
27	NC_009332	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
28	NC_009332	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
29	NC_009332	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472890
30	NC_009332	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
31	NC_009332	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
32	NC_009332	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
33	NC_009332	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
34	NC_009332	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472890
35	NC_009332	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
36	NC_009332	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
37	NC_009332	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472890
38	NC_009332	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
39	NC_009332	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
40	NC_009332	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472890
41	NC_009332	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
42	NC_009332	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009332	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009332	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472891
45	NC_009332	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009332	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009332	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009332	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009332	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009332	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
51	NC_009332	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
52	NC_009332	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
53	NC_009332	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
54	NC_009332	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
55	NC_009332	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472892
56	NC_009332	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
57	NC_009332	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
58	NC_009332	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
59	NC_009332	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
60	NC_009332	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
61	NC_009332	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
62	NC_009332	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
63	NC_009332	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472892
64	NC_009332	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
65	NC_009332	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
66	NC_009332	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
67	NC_009332	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
68	NC_009332	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
69	NC_009332	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009332	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472893
71	NC_009332	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
72	NC_009332	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
73	NC_009332	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
74	NC_009332	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
75	NC_009332	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
76	NC_009332	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
77	NC_009332	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
78	NC_009332	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
79	NC_009332	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
80	NC_009332	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
81	NC_009332	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
82	NC_009332	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139472894
83	NC_009332	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
84	NC_009332	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
85	NC_009332	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
86	NC_009332	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
87	NC_009332	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
88	NC_009332	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
89	NC_009332	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
90	NC_009332	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
91	NC_009332	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
92	NC_009332	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
93	NC_009332	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
94	NC_009332	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
95	NC_009332	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472894
96	NC_009332	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472894
97	NC_009332	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
98	NC_009332	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
99	NC_009332	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472894
100	NC_009332	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472894
101	NC_009332	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472894
102	NC_009332	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
103	NC_009332	AGA	2	6	6922	6927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
104	NC_009332	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
105	NC_009332	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
106	NC_009332	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
107	NC_009332	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
108	NC_009332	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
109	NC_009332	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
110	NC_009332	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472894
111	NC_009332	TTG	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472894
112	NC_009332	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
113	NC_009332	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
114	NC_009332	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
115	NC_009332	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472894
116	NC_009332	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139472894
117	NC_009332	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
118	NC_009332	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
119	NC_009332	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472894
120	NC_009332	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
121	NC_009332	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139472894
122	NC_009332	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
123	NC_009332	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472894
124	NC_009332	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472894
125	NC_009332	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
126	NC_009332	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
127	NC_009332	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472894
128	NC_009332	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009332	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009332	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472895
131	NC_009332	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472895
132	NC_009332	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472895
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