MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 plasmid pLW1071

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009329	GAAAC	2	10	4487	4496	60 %	0 %	20 %	20 %	138898343
2	NC_009329	GAAAA	2	10	5787	5796	80 %	0 %	20 %	0 %	138898345
3	NC_009329	ACTTT	2	10	6551	6560	20 %	60 %	0 %	20 %	138898346
4	NC_009329	CTGTC	2	10	6655	6664	0 %	40 %	20 %	40 %	138898346
5	NC_009329	TTTTC	2	10	6942	6951	0 %	80 %	0 %	20 %	138898346
6	NC_009329	AACGA	2	10	7877	7886	60 %	0 %	20 %	20 %	138898347
7	NC_009329	TCGTA	2	10	8068	8077	20 %	40 %	20 %	20 %	138898347
8	NC_009329	GCGAT	2	10	8760	8769	20 %	20 %	40 %	20 %	138898348
9	NC_009329	ATCGC	2	10	10595	10604	20 %	20 %	20 %	40 %	138898350
10	NC_009329	TTCCG	2	10	10639	10648	0 %	40 %	20 %	40 %	138898350
11	NC_009329	TGGAA	2	10	12535	12544	40 %	20 %	40 %	0 %	138898351
12	NC_009329	AGATG	2	10	13335	13344	40 %	20 %	40 %	0 %	138898352
13	NC_009329	CTGTT	2	10	22003	22012	0 %	60 %	20 %	20 %	138898361
14	NC_009329	TCTTT	2	10	25502	25511	0 %	80 %	0 %	20 %	138898365
15	NC_009329	AAAAT	2	10	26181	26190	80 %	20 %	0 %	0 %	138898366
16	NC_009329	GTTTT	2	10	27361	27370	0 %	80 %	20 %	0 %	138898368
17	NC_009329	AAATC	2	10	28508	28517	60 %	20 %	0 %	20 %	138898370
18	NC_009329	GAAAA	2	10	30018	30027	80 %	0 %	20 %	0 %	138898370
19	NC_009329	GTGTT	2	10	30462	30471	0 %	60 %	40 %	0 %	138898371
20	NC_009329	CTGAA	2	10	33021	33030	40 %	20 %	20 %	20 %	138898372
21	NC_009329	GAACG	2	10	33274	33283	40 %	0 %	40 %	20 %	138898372
22	NC_009329	GTATC	2	10	33530	33539	20 %	40 %	20 %	20 %	138898372
23	NC_009329	GATGG	2	10	33889	33898	20 %	20 %	60 %	0 %	138898372
24	NC_009329	CTATC	2	10	34254	34263	20 %	40 %	0 %	40 %	138898372
25	NC_009329	ACAAA	2	10	41542	41551	80 %	0 %	0 %	20 %	138898379
26	NC_009329	ATTGA	2	10	43388	43397	40 %	40 %	20 %	0 %	138898381
27	NC_009329	AACAA	2	10	43927	43936	80 %	0 %	0 %	20 %	138898381
28	NC_009329	TTTGT	2	10	44836	44845	0 %	80 %	20 %	0 %	138898383
29	NC_009329	ACGTC	2	10	47128	47137	20 %	20 %	20 %	40 %	138898385
30	NC_009329	GCTTG	2	10	49773	49782	0 %	40 %	40 %	20 %	138898387
31	NC_009329	CAAAC	2	10	54558	54567	60 %	0 %	0 %	40 %	138898391
32	NC_009329	AAATT	2	10	57150	57159	60 %	40 %	0 %	0 %	138898392

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.