MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 plasmid pLW1071

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009329	CATG	2	8	911	918	25 %	25 %	25 %	25 %	138898340
2	NC_009329	TAGA	2	8	2181	2188	50 %	25 %	25 %	0 %	138898341
3	NC_009329	TCGC	2	8	2439	2446	0 %	25 %	25 %	50 %	138898341
4	NC_009329	TCGT	2	8	2500	2507	0 %	50 %	25 %	25 %	138898341
5	NC_009329	TTTC	2	8	2718	2725	0 %	75 %	0 %	25 %	138898341
6	NC_009329	GGTA	2	8	3037	3044	25 %	25 %	50 %	0 %	138898341
7	NC_009329	CATC	2	8	3819	3826	25 %	25 %	0 %	50 %	138898342
8	NC_009329	AAAG	2	8	4031	4038	75 %	0 %	25 %	0 %	138898342
9	NC_009329	GAAG	2	8	4053	4060	50 %	0 %	50 %	0 %	138898342
10	NC_009329	TCCT	2	8	5801	5808	0 %	50 %	0 %	50 %	138898345
11	NC_009329	TTCA	2	8	5941	5948	25 %	50 %	0 %	25 %	138898345
12	NC_009329	CGAA	2	8	6054	6061	50 %	0 %	25 %	25 %	138898345
13	NC_009329	ATTC	2	8	6093	6100	25 %	50 %	0 %	25 %	138898345
14	NC_009329	TTCA	2	8	6244	6251	25 %	50 %	0 %	25 %	138898346
15	NC_009329	ACTA	2	8	6592	6599	50 %	25 %	0 %	25 %	138898346
16	NC_009329	TCTT	2	8	6695	6702	0 %	75 %	0 %	25 %	138898346
17	NC_009329	TTTG	2	8	6747	6754	0 %	75 %	25 %	0 %	138898346
18	NC_009329	TGCC	2	8	6766	6773	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
19	NC_009329	TCTG	2	8	6809	6816	0 %	50 %	25 %	25 %	138898346
20	NC_009329	AATC	2	8	7212	7219	50 %	25 %	0 %	25 %	138898346
21	NC_009329	GTCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
22	NC_009329	TCCG	2	8	7351	7358	0 %	25 %	25 %	50 %	138898346
23	NC_009329	AACG	2	8	7430	7437	50 %	0 %	25 %	25 %	138898346
24	NC_009329	TATT	2	8	7691	7698	25 %	75 %	0 %	0 %	138898346
25	NC_009329	CTCA	2	8	7725	7732	25 %	25 %	0 %	50 %	138898347
26	NC_009329	TTTC	2	8	8275	8282	0 %	75 %	0 %	25 %	138898347
27	NC_009329	AAAC	2	8	8561	8568	75 %	0 %	0 %	25 %	138898348
28	NC_009329	CAAT	2	8	10252	10259	50 %	25 %	0 %	25 %	138898349
29	NC_009329	TCAT	2	8	10297	10304	25 %	50 %	0 %	25 %	138898349
30	NC_009329	GCTG	2	8	10319	10326	0 %	25 %	50 %	25 %	138898350
31	NC_009329	TCGT	2	8	11480	11487	0 %	50 %	25 %	25 %	138898351
32	NC_009329	TTCT	2	8	11514	11521	0 %	75 %	0 %	25 %	138898351
33	NC_009329	GATC	2	8	12335	12342	25 %	25 %	25 %	25 %	138898351
34	NC_009329	TTGC	2	8	12724	12731	0 %	50 %	25 %	25 %	138898351
35	NC_009329	TCTT	2	8	13144	13151	0 %	75 %	0 %	25 %	138898351
36	NC_009329	GATG	2	8	14058	14065	25 %	25 %	50 %	0 %	138898352
37	NC_009329	AAGG	2	8	14097	14104	50 %	0 %	50 %	0 %	138898352
38	NC_009329	ATTC	2	8	14239	14246	25 %	50 %	0 %	25 %	138898352
39	NC_009329	CTTG	2	8	15160	15167	0 %	50 %	25 %	25 %	138898353
40	NC_009329	TGAA	2	8	15650	15657	50 %	25 %	25 %	0 %	138898354
41	NC_009329	TGAA	2	8	16229	16236	50 %	25 %	25 %	0 %	138898355
42	NC_009329	ATTG	2	8	16368	16375	25 %	50 %	25 %	0 %	138898355
43	NC_009329	CAAC	2	8	16404	16411	50 %	0 %	0 %	50 %	138898355
44	NC_009329	TTTG	2	8	16848	16855	0 %	75 %	25 %	0 %	138898356
45	NC_009329	GAAA	2	8	17117	17124	75 %	0 %	25 %	0 %	138898356
46	NC_009329	TGAT	2	8	17168	17175	25 %	50 %	25 %	0 %	138898356
47	NC_009329	ATAA	2	8	17473	17480	75 %	25 %	0 %	0 %	138898356
48	NC_009329	ATAA	2	8	17494	17501	75 %	25 %	0 %	0 %	138898356
49	NC_009329	AAAC	2	8	17613	17620	75 %	0 %	0 %	25 %	138898356
50	NC_009329	AACC	2	8	17782	17789	50 %	0 %	0 %	50 %	138898356
51	NC_009329	TTGT	2	8	18365	18372	0 %	75 %	25 %	0 %	138898357
52	NC_009329	AAAT	2	8	20060	20067	75 %	25 %	0 %	0 %	138898358
53	NC_009329	CCGA	2	8	21055	21062	25 %	0 %	25 %	50 %	138898359
54	NC_009329	GAAG	2	8	21195	21202	50 %	0 %	50 %	0 %	138898359
55	NC_009329	TAAA	2	8	21273	21280	75 %	25 %	0 %	0 %	138898359
56	NC_009329	AAAT	2	8	21351	21358	75 %	25 %	0 %	0 %	138898360
57	NC_009329	CATT	2	8	22155	22162	25 %	50 %	0 %	25 %	138898361
58	NC_009329	TCAC	2	8	22225	22232	25 %	25 %	0 %	50 %	138898361
59	NC_009329	GGAT	2	8	22535	22542	25 %	25 %	50 %	0 %	138898362
60	NC_009329	AACA	2	8	22657	22664	75 %	0 %	0 %	25 %	138898362
61	NC_009329	ATTC	2	8	22676	22683	25 %	50 %	0 %	25 %	138898362
62	NC_009329	CAAT	2	8	23224	23231	50 %	25 %	0 %	25 %	138898362
63	NC_009329	ATAA	2	8	24693	24700	75 %	25 %	0 %	0 %	138898363
64	NC_009329	TGGA	2	8	24707	24714	25 %	25 %	50 %	0 %	138898363
65	NC_009329	AATA	2	8	25405	25412	75 %	25 %	0 %	0 %	138898364
66	NC_009329	TTCG	2	8	25768	25775	0 %	50 %	25 %	25 %	138898365
67	NC_009329	ATCC	2	8	26788	26795	25 %	25 %	0 %	50 %	138898367
68	NC_009329	CGTT	2	8	27149	27156	0 %	50 %	25 %	25 %	138898368
69	NC_009329	GAGG	2	8	27654	27661	25 %	0 %	75 %	0 %	138898368
70	NC_009329	TCAA	2	8	28079	28086	50 %	25 %	0 %	25 %	138898369
71	NC_009329	GGAT	2	8	28573	28580	25 %	25 %	50 %	0 %	138898370
72	NC_009329	CAGC	2	8	29461	29468	25 %	0 %	25 %	50 %	138898370
73	NC_009329	TCCA	2	8	29556	29563	25 %	25 %	0 %	50 %	138898370
74	NC_009329	AAGA	2	8	29834	29841	75 %	0 %	25 %	0 %	138898370
75	NC_009329	GAGC	2	8	30076	30083	25 %	0 %	50 %	25 %	138898370
76	NC_009329	GTTT	2	8	30571	30578	0 %	75 %	25 %	0 %	138898371
77	NC_009329	CGAT	2	8	31078	31085	25 %	25 %	25 %	25 %	138898371
78	NC_009329	AGAA	2	8	31494	31501	75 %	0 %	25 %	0 %	138898371
79	NC_009329	CGAA	2	8	31829	31836	50 %	0 %	25 %	25 %	138898371
80	NC_009329	AAGG	2	8	31922	31929	50 %	0 %	50 %	0 %	138898371
81	NC_009329	TTAT	2	8	32011	32018	25 %	75 %	0 %	0 %	138898371
82	NC_009329	CAAG	2	8	32194	32201	50 %	0 %	25 %	25 %	138898371
83	NC_009329	TTTC	2	8	32657	32664	0 %	75 %	0 %	25 %	138898372
84	NC_009329	CCAG	2	8	32900	32907	25 %	0 %	25 %	50 %	138898372
85	NC_009329	GAAA	2	8	33037	33044	75 %	0 %	25 %	0 %	138898372
86	NC_009329	CCAT	2	8	33045	33052	25 %	25 %	0 %	50 %	138898372
87	NC_009329	GAAT	2	8	33099	33106	50 %	25 %	25 %	0 %	138898372
88	NC_009329	AAGC	2	8	33451	33458	50 %	0 %	25 %	25 %	138898372
89	NC_009329	TTCG	2	8	33636	33643	0 %	50 %	25 %	25 %	138898372
90	NC_009329	TCGA	2	8	34485	34492	25 %	25 %	25 %	25 %	138898372
91	NC_009329	GAAT	2	8	34943	34950	50 %	25 %	25 %	0 %	138898373
92	NC_009329	ACGA	2	8	35232	35239	50 %	0 %	25 %	25 %	138898373
93	NC_009329	AGAA	2	8	35278	35285	75 %	0 %	25 %	0 %	138898373
94	NC_009329	AAAG	2	8	35382	35389	75 %	0 %	25 %	0 %	138898373
95	NC_009329	AAAG	2	8	36261	36268	75 %	0 %	25 %	0 %	138898374
96	NC_009329	CGAT	2	8	36529	36536	25 %	25 %	25 %	25 %	138898375
97	NC_009329	AATT	2	8	36642	36649	50 %	50 %	0 %	0 %	138898375
98	NC_009329	GAAA	2	8	36700	36707	75 %	0 %	25 %	0 %	138898375
99	NC_009329	ATCA	2	8	37074	37081	50 %	25 %	0 %	25 %	138898375
100	NC_009329	CAAA	2	8	38457	38464	75 %	0 %	0 %	25 %	138898376
101	NC_009329	TAAT	2	8	38768	38775	50 %	50 %	0 %	0 %	138898377
102	NC_009329	TGGT	2	8	39135	39142	0 %	50 %	50 %	0 %	138898377
103	NC_009329	TACC	2	8	40205	40212	25 %	25 %	0 %	50 %	138898378
104	NC_009329	GAAA	2	8	40524	40531	75 %	0 %	25 %	0 %	138898378
105	NC_009329	ACGA	2	8	40742	40749	50 %	0 %	25 %	25 %	138898378
106	NC_009329	ATCT	2	8	41060	41067	25 %	50 %	0 %	25 %	138898378
107	NC_009329	CTCA	2	8	41826	41833	25 %	25 %	0 %	50 %	138898379
108	NC_009329	TTTG	2	8	42170	42177	0 %	75 %	25 %	0 %	138898380
109	NC_009329	CTTT	2	8	42219	42226	0 %	75 %	0 %	25 %	138898380
110	NC_009329	TTTC	2	8	42904	42911	0 %	75 %	0 %	25 %	138898381
111	NC_009329	AATC	2	8	44439	44446	50 %	25 %	0 %	25 %	138898383
112	NC_009329	CTCG	2	8	44746	44753	0 %	25 %	25 %	50 %	138898383
113	NC_009329	GACA	2	8	44985	44992	50 %	0 %	25 %	25 %	138898383
114	NC_009329	ATTT	2	8	45003	45010	25 %	75 %	0 %	0 %	138898383
115	NC_009329	ATTC	2	8	45211	45218	25 %	50 %	0 %	25 %	138898383
116	NC_009329	TACT	2	8	46199	46206	25 %	50 %	0 %	25 %	138898384
117	NC_009329	ATCA	2	8	46744	46751	50 %	25 %	0 %	25 %	138898384
118	NC_009329	TGAT	2	8	48593	48600	25 %	50 %	25 %	0 %	138898386
119	NC_009329	TGCA	2	8	48700	48707	25 %	25 %	25 %	25 %	138898386
120	NC_009329	ATCC	2	8	49494	49501	25 %	25 %	0 %	50 %	138898387
121	NC_009329	CGGT	2	8	49592	49599	0 %	25 %	50 %	25 %	138898387
122	NC_009329	ATGG	2	8	49681	49688	25 %	25 %	50 %	0 %	138898387
123	NC_009329	ATGA	2	8	50371	50378	50 %	25 %	25 %	0 %	138898387
124	NC_009329	GAAC	2	8	50750	50757	50 %	0 %	25 %	25 %	138898388
125	NC_009329	CACT	2	8	52126	52133	25 %	25 %	0 %	50 %	138898389
126	NC_009329	TTAA	2	8	52497	52504	50 %	50 %	0 %	0 %	138898389
127	NC_009329	AAAT	2	8	52705	52712	75 %	25 %	0 %	0 %	138898389
128	NC_009329	TAGA	2	8	53158	53165	50 %	25 %	25 %	0 %	138898389
129	NC_009329	CTTT	2	8	54445	54452	0 %	75 %	0 %	25 %	138898391
130	NC_009329	ACTG	2	8	54926	54933	25 %	25 %	25 %	25 %	138898391
131	NC_009329	AAAT	2	8	56860	56867	75 %	25 %	0 %	0 %	138898392
132	NC_009329	TTAT	2	8	56935	56942	25 %	75 %	0 %	0 %	138898392
133	NC_009329	AGGA	2	8	57490	57497	50 %	0 %	50 %	0 %	138898392

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.