MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome

Total Repeats: 596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009328	GCTGT	2	10	2906	2915	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009328	TAAAA	2	10	3013	3022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009328	AAACA	2	10	10411	10420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009328	AGGAG	2	10	11283	11292	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009328	TCGTG	2	10	11698	11707	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009328	TAAAA	2	10	20022	20031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009328	AGAGA	2	10	24736	24745	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009328	AAACA	2	10	29122	29131	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009328	AGGAG	2	10	29990	29999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009328	TCGTG	2	10	30407	30416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009328	TGGGG	2	10	39268	39277	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009328	TCTCC	2	10	41699	41708	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009328	TGTAA	2	10	44094	44103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009328	GCGAA	2	10	49700	49709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009328	GTTTT	2	10	60657	60666	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009328	TATGA	2	10	75842	75851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009328	TATAA	2	10	86300	86309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009328	AACGA	2	10	87289	87298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009328	AGGAG	2	10	87987	87996	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009328	TCGTG	2	10	88402	88411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009328	TTTCG	2	10	89050	89059	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009328	TGAAG	2	10	120951	120960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009328	TATTT	2	10	121616	121625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009328	AGCGA	2	10	133038	133047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009328	TATCA	2	10	143897	143906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009328	TTCCA	2	10	148967	148976	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009328	AACGA	2	10	150295	150304	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009328	AGGAG	2	10	150993	151002	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009328	TCGTG	2	10	151408	151417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009328	GTATT	2	10	157366	157375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009328	ACCAA	2	10	157504	157513	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009328	GATGA	2	10	166665	166674	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009328	TTTTG	2	10	170224	170233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009328	GATTG	2	10	171348	171357	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009328	TATGA	2	10	173791	173800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009328	TAAAA	2	10	174494	174503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009328	GTAAT	2	10	176924	176933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009328	TCCTT	2	10	179323	179332	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009328	AAGGA	2	10	184118	184127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009328	AATGG	2	10	193557	193566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009328	TCTTT	2	10	198048	198057	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009328	TAGGA	2	10	198175	198184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009328	TTCTC	2	10	202576	202585	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009328	ATCCG	2	10	206436	206445	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009328	GAAGA	2	10	207512	207521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009328	TTGAT	2	10	223818	223827	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009328	AGGCA	2	10	223877	223886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009328	GTAGT	2	10	224997	225006	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009328	TAAAA	2	10	225580	225589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009328	AACGA	2	10	225939	225948	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_009328	AGGAG	2	10	226637	226646	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009328	TCGTG	2	10	227052	227061	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009328	TTTCG	2	10	227699	227708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009328	CTTTT	2	10	241922	241931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009328	TGAAT	2	10	242412	242421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009328	AACGA	2	10	258757	258766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009328	AGGAG	2	10	259455	259464	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009328	TCGTG	2	10	259872	259881	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009328	TTTCG	2	10	260519	260528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009328	AAACA	2	10	281507	281516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009328	CTTTT	2	10	283083	283092	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009328	TATTT	2	10	296700	296709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009328	ATACC	2	10	309887	309896	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_009328	GTTTT	2	10	309952	309961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009328	AATGT	2	10	311562	311571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009328	GAGAA	2	10	315211	315220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009328	GAACA	2	10	317152	317161	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009328	GAAGG	2	10	323611	323620	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009328	CGAAC	2	10	332699	332708	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009328	TTCTT	2	10	338524	338533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009328	TGAGG	2	10	342243	342252	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009328	TTTCA	2	10	345539	345548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009328	AGTTG	2	10	347386	347395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009328	GATGA	2	10	348125	348134	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009328	TCGTT	2	10	357534	357543	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009328	CACAG	2	10	361923	361932	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_009328	TTATT	2	10	363541	363550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009328	TGTAA	2	10	364658	364667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009328	TTGTT	2	10	379813	379822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009328	GCGCC	2	10	386064	386073	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_009328	AGCAT	2	10	388003	388012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009328	AATCG	2	10	395924	395933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009328	ATGTT	2	10	410707	410716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009328	CGTTT	2	10	416295	416304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_009328	AGGGG	2	10	420324	420333	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009328	TTCAC	2	10	426307	426316	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_009328	AAAAG	2	10	431369	431378	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009328	GAGGG	2	10	432039	432048	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009328	TAACG	2	10	443021	443030	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009328	GAATG	2	10	455893	455902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009328	GAAAA	2	10	463889	463898	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009328	ATTGG	2	10	485311	485320	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009328	CGATC	2	10	486435	486444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_009328	TGTAT	2	10	488057	488066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009328	TAAAA	2	10	491355	491364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009328	GGCTG	2	10	491729	491738	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009328	GGATG	2	10	495573	495582	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009328	GAAAC	2	10	497252	497261	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009328	TACGT	2	10	497349	497358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009328	TATTT	2	10	498860	498869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009328	TTTCG	2	10	500989	500998	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009328	TTTAT	2	10	514390	514399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009328	TTCCC	2	10	514439	514448	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_009328	CCAAT	2	10	521242	521251	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009328	TATCA	2	10	538008	538017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009328	CATGC	2	10	538292	538301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009328	AACGA	2	10	547496	547505	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009328	AGGAG	2	10	548194	548203	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009328	TCGTG	2	10	548613	548622	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009328	GTAGT	2	10	552927	552936	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009328	GTTTC	2	10	555120	555129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009328	ATAAA	2	10	560779	560788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009328	TCAAG	2	10	563050	563059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009328	TGATA	2	10	566446	566455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009328	AAAGT	2	10	569177	569186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009328	AACTT	2	10	575029	575038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009328	CAGGG	2	10	580411	580420	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009328	TATTT	2	10	584408	584417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009328	GTTAT	2	10	592174	592183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009328	TGATA	2	10	594756	594765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009328	TGCCT	2	10	594923	594932	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009328	TATCG	2	10	611984	611993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009328	ATTTT	2	10	616696	616705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009328	CTTTC	2	10	625742	625751	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009328	TAAAA	2	10	648010	648019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009328	GAACG	2	10	661270	661279	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009328	GTAAA	2	10	661288	661297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009328	TGACG	2	10	664621	664630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009328	GCGAT	2	10	664760	664769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009328	GAATA	2	10	666413	666422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009328	TTGTT	2	10	668000	668009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009328	TTTGA	2	10	684288	684297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009328	GAAGG	2	10	696781	696790	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009328	TTACA	2	10	702827	702836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009328	TTAAT	2	10	703203	703212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009328	TGTAA	2	10	704314	704323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009328	ATGGC	2	10	713445	713454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009328	TCCAA	2	10	723893	723902	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009328	AATAG	2	10	723949	723958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009328	TTTGC	2	10	724401	724410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009328	GAGAA	2	10	729355	729364	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009328	TTTTC	2	10	744336	744345	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009328	TGTCT	2	10	744374	744383	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009328	AGTTG	2	10	745490	745499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009328	GAAAA	2	10	759481	759490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009328	CTTAT	2	10	762594	762603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_009328	ATTGT	2	10	763755	763764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009328	TCCCT	2	10	778108	778117	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
149	NC_009328	GAAGG	2	10	778887	778896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009328	TCTGT	2	10	797741	797750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_009328	AGTAA	2	10	1017524	1017533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_009328	TGATT	2	10	1065234	1065243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009328	CCTTG	2	10	1071820	1071829	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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